| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,468,165 | A→G | 90.6% | intergenic (‑37/‑125) | argI ← / → rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,468,165 | 0 | A | G | 90.6% | 843.6 / 54.0 | 256 | intergenic (‑37/‑125) | argI/rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (13/11); new base G (118/114); total (131/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
ACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTG > CP009273/4468018‑4468310 | aCCGCTTTTCTTATCGTCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCATCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt < 1:4152167/150‑1 (MQ=255)aCCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGACTTAAAGtt > 1:1074760/1‑150 (MQ=255)aCCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt > 2:3831424/1‑150 (MQ=255)aCCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt < 2:277320/150‑1 (MQ=255)aCCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt > 2:2254665/1‑150 (MQ=255)aCCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGtt < 1:3941833/150‑1 (MQ=255) ccGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTc < 2:1267605/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt > 1:1800641/1‑150 (MQ=255) tttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAttt > 1:1040505/1‑150 (MQ=255) ttATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTatat > 2:4284740/1‑150 (MQ=255) ttATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTatat < 2:3586042/150‑1 (MQ=255) tATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATg > 1:4518034/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATgg < 1:713140/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATgg < 2:2823673/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat < 2:4506228/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat > 2:2684559/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGgatg > 2:1688640/1‑150 (MQ=255) cTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatgat > 1:276039/1‑150 (MQ=255) tttCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGatt < 1:2787770/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGatta < 1:2156513/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCTGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattat < 2:2351007/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattatt > 1:1129691/1‑150 (MQ=255) cAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattatt < 2:1314298/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattatt < 1:2199445/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAtt > 1:3062387/1‑150 (MQ=255) cgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCa < 2:3317118/150‑1 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa > 2:1540157/1‑150 (MQ=255) cTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGt < 2:3799995/150‑1 (MQ=255) aCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTa < 2:2478122/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaa > 1:2262987/1‑150 (MQ=255) agcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCa > 1:2842527/1‑150 (MQ=255) agcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCa > 2:1443502/1‑150 (MQ=255) agGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATaa < 1:26342/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAAt < 1:3623757/150‑1 (MQ=255) tGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCt < 2:580990/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCtt < 1:1592796/150‑1 (MQ=255) gTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCtt < 2:3723324/150‑1 (MQ=255) aGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTc < 1:582075/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACaa > 2:2679625/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACaaa > 2:465037/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACaaa < 1:1553169/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACaaa > 2:411958/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg > 2:1654319/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg < 1:137105/150‑1 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg > 1:3850283/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg < 1:1921424/150‑1 (MQ=255) aaaTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCa > 2:2000701/1‑150 (MQ=255) aaaTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCa < 2:2087145/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTATAGCATAAATCTTTGTCACAATGGTGGAGGCAAt > 2:2389969/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt > 1:4484207/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt < 2:320506/150‑1 (MQ=255) gTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAg < 1:4212383/150‑1 (MQ=255) gTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAg < 1:4212547/150‑1 (MQ=255) tAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgt > 1:2251795/1‑150 (MQ=255) aaTTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtg > 1:2815741/1‑150 (MQ=255) aaTTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtg < 1:4713390/150‑1 (MQ=255) ttCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtggtg < 1:4086695/150‑1 (MQ=255) ttCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtggtg > 1:171475/1‑150 (MQ=255) ggAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGtgtgtg > 1:2122930/1‑150 (MQ=255) ggAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGtgtgtg < 1:1443502/150‑1 (MQ=255) ggAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGtgtgtg > 1:3300068/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGa > 1:3154456/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGa < 1:873669/150‑1 (MQ=255) aaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACa > 1:3967537/1‑150 (MQ=255) aTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACaa > 1:4128060/1‑150 (MQ=255) gCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATa < 1:237356/150‑1 (MQ=255) ttATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAag < 2:3980255/150‑1 (MQ=255) ttATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAag < 2:3160911/150‑1 (MQ=255) tATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAaga < 1:3477449/150‑1 (MQ=255) aTGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAagag < 2:1800641/150‑1 (MQ=255) aTGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAagag > 2:3659765/1‑150 (MQ=255) aTGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAagag > 1:2906814/1‑150 (MQ=255) gATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGtc > 2:1823740/1‑149 (MQ=255) aaaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCg < 1:753965/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGc < 1:3831424/150‑1 (MQ=255) ccGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAgg < 2:2907330/150‑1 (MQ=255) cGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGa > 1:1846532/1‑150 (MQ=255) cGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGa < 2:3955297/150‑1 (MQ=255) gACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACa > 2:347200/1‑150 (MQ=255) cATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAtt > 1:893007/1‑150 (MQ=255) cccTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGa > 2:484483/1‑150 (MQ=255) cctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGaa < 1:4608432/150‑1 (MQ=255) ctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAg < 2:2208871/150‑1 (MQ=255) ctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAg < 1:1961685/150‑1 (MQ=255) tgtgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGc > 1:1622281/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGc > 1:1223800/1‑150 (MQ=255) ggCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCAt > 1:3744780/1‑150 (MQ=255) gCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATg > 1:3375458/1‑150 (MQ=255) gCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATg > 1:3483400/1‑150 (MQ=255) gCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATg < 1:148890/150‑1 (MQ=255) aCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaa > 1:2636740/1‑150 (MQ=255) aCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaa < 2:462646/150‑1 (MQ=255) cGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaaa < 1:1613659/150‑1 (MQ=255) ccTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAAcc < 2:3061935/150‑1 (MQ=255) tCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCg > 1:2696282/1‑150 (MQ=255) cAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCgg < 2:828819/150‑1 (MQ=255) cAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCgg > 1:3100712/1‑150 (MQ=255) aTGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaa > 1:1672347/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac > 2:1036943/1‑150 (MQ=255) ttAAAGTTAAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACt < 2:2610642/150‑1 (MQ=255) | ACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTG > CP009273/4468018‑4468310 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |