| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 386,569 | C→A | 8.6% | pseudogene (863/1458 nt) | yaiT → | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 386,569 | 0 | C | A | 8.6% | 868.8 / 40.8 | 233 | pseudogene (863/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (113/100); new base A (7/13); total (120/113) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
CAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACGGGGGTT > CP009273/386420‑386718 | cAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTc < 1:481186/150‑1 (MQ=255) aaTATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCa > 2:1902342/1‑150 (MQ=255) aaTATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCa > 2:1902449/1‑150 (MQ=255) aaTATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCa < 2:3089137/150‑1 (MQ=255) tatCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAgg < 1:330128/150‑1 (MQ=255) tatCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAgg < 1:2081734/150‑1 (MQ=255) tatCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAgg > 1:3260690/1‑150 (MQ=255) atCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGt < 1:3897695/150‑1 (MQ=255) atCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGt > 2:4411844/1‑150 (MQ=255) ctctGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTc > 1:2116833/1‑150 (MQ=255) gTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGAc > 2:524916/1‑150 (MQ=255) gTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATACTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGAc > 1:80495/1‑150 (MQ=255) aaaaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTa < 1:358556/150‑1 (MQ=255) aaaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTAt < 1:3064713/150‑1 (MQ=255) aaaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTAt > 2:3748449/1‑150 (MQ=255) aaaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTAt < 1:268363/150‑1 (MQ=255) aaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATg > 1:1631962/1‑150 (MQ=255) aGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATgt > 2:301206/1‑149 (MQ=255) aGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGc > 1:1324718/1‑150 (MQ=255) aGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGc < 2:1362223/150‑1 (MQ=255) gATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCg < 1:4783521/150‑1 (MQ=255) aTTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGa > 1:1600960/1‑150 (MQ=255) cacaGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaa < 1:5035/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTAt > 2:4072123/1‑150 (MQ=255) gggTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTAtt < 2:1745612/150‑1 (MQ=255) tCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTACAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTc > 1:1592085/1‑150 (MQ=255) aaaTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAg > 2:1551238/1‑150 (MQ=255) aTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCa < 1:4534993/150‑1 (MQ=255) tataTCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAAt < 1:4100575/150‑1 (MQ=255) atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAAtt > 1:2315077/1‑150 (MQ=255) tatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTc > 2:3600200/1‑150 (MQ=255) tatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTc > 2:3600235/1‑150 (MQ=255) tatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTc > 2:4757441/1‑150 (MQ=255) atCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCa < 2:2480520/150‑1 (MQ=255) atCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCa < 2:2480454/150‑1 (MQ=255) atCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCa > 2:2576803/1‑150 (MQ=255) aTAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGa < 1:4609234/150‑1 (MQ=255) aTAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGa > 1:638412/1‑150 (MQ=255) aTAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGa > 2:421253/1‑150 (MQ=255) tAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGAt < 1:2796837/150‑1 (MQ=255) cAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATggg > 2:1752271/1‑150 (MQ=255) aaTACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGt > 2:1828669/1‑150 (MQ=255) tACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa < 1:296414/150‑1 (MQ=255) tACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa > 1:1244498/1‑150 (MQ=255) tACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa > 2:2207226/1‑150 (MQ=255) aCTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGAt > 1:2239315/1‑150 (MQ=255) cTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATg > 2:2329629/1‑150 (MQ=255) ttATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGt < 2:2055257/150‑1 (MQ=255) ttATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGt < 1:4719640/150‑1 (MQ=255) tATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGtt > 1:2211384/1‑150 (MQ=255) tGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGc > 2:1991670/1‑150 (MQ=255) tGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGc > 2:1308323/1‑150 (MQ=255) aaaaaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCtt < 2:946616/149‑1 (MQ=255) aaaaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCttt > 1:2734931/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTa > 1:750388/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTAc > 2:149525/1‑150 (MQ=255) cTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCa > 1:3240199/1‑150 (MQ=255) ggTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGc > 1:1553361/1‑150 (MQ=255) cACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAcc > 1:276395/1‑150 (MQ=255) cACTTTGGCAAGTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTAGCACTGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCAcc < 2:3085770/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTg < 2:3884793/150‑1 (MQ=255) tGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGaa < 1:1064436/150‑1 (MQ=255) gCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATa < 2:3260690/150‑1 (MQ=255) cAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAg < 1:1718853/150‑1 (MQ=255) tCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAt < 2:3751162/150‑1 (MQ=255) cTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAtt > 1:3699222/1‑150 (MQ=255) cTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAtt < 2:1271257/150‑1 (MQ=255) tgatgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATACGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAttt < 1:2674542/150‑1 (MQ=255) gatgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAtttt > 2:1114793/1‑150 (MQ=255) cGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGa > 1:948503/1‑150 (MQ=255) cGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGa > 1:1286859/1‑150 (MQ=255) aGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAAt < 2:3992553/150‑1 (MQ=255) gTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATg < 2:580057/150‑1 (MQ=255) gTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATg < 2:2970114/150‑1 (MQ=255) gATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGt < 2:2039142/150‑1 (MQ=255) aTTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTc > 1:1628185/1‑150 (MQ=255) ttATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCa > 2:3335616/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGAt < 2:3882130/150‑1 (MQ=255) gCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCa > 2:284364/1‑150 (MQ=255) gggTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACgg > 2:2105093/1‑150 (MQ=255) tGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGa < 2:3224279/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGAc < 1:3131832/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGAc < 2:52603/150‑1 (MQ=255) aTGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACg < 1:1446158/150‑1 (MQ=255) gTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACggg > 2:2003418/1‑150 (MQ=255) tGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGt < 2:2690039/150‑1 (MQ=255) gCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTg < 2:4538035/150‑1 (MQ=255) gCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTg < 1:421253/150‑1 (MQ=255) cAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGa > 2:2795971/1‑150 (MQ=255) cAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGa > 2:797086/1‑150 (MQ=255) aaTGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGaa < 2:2009141/150‑1 (MQ=255) aaTGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGaa < 2:2836686/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAg < 2:4648296/150‑1 (MQ=255) tttACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATAcc > 2:197777/1‑150 (MQ=255) tttACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATAcc > 1:3846921/1‑150 (MQ=255) ttACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCa > 2:4344896/1‑150 (MQ=255) aCTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAAc < 1:1902449/150‑1 (MQ=255) cTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACg < 1:4411844/150‑1 (MQ=255) gCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACggg < 1:1124727/150‑1 (MQ=255) cTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACgggg < 2:2670544/150‑1 (MQ=255) | CAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACGGGGGTT > CP009273/386420‑386718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |