Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,118,542 | C→G | 8.0% | S63T (AGC→ACC) | yceB ← | lipoprotein, DUF1439 family |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,118,542 | 0 | C | G | 8.0% | 714.8 / 2.8 | 223 | S63T (AGC→ACC) | yceB | lipoprotein, DUF1439 family |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (116/85); new base G (3/16); total (119/104) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GAAGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCC > CP009273/1118394‑1118690 | gAAGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGc < 2:301534/149‑1 (MQ=255) gAAGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGc < 1:1903411/149‑1 (MQ=255) aGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTg < 1:4073903/149‑1 (MQ=255) aGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTg > 2:2990150/1‑149 (MQ=255) aGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTAACGAACAGGGAGTTCATGTACAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAAACATATTAGGCTCTTCGCGACCAATTTTGCTg > 1:3381189/1‑149 (MQ=255) gATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTTGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTgg > 1:3054379/1‑149 (MQ=255) gATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTgg < 1:1746868/149‑1 (MQ=255) gATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTgg < 1:585030/149‑1 (MQ=255) aTCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGt < 2:588034/149‑1 (MQ=255) aCCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTTAATACCGAACACGGAGTTCATTTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTAGGCTCTTCGCGACCAAATTTGCTGGTCAGGt > 1:2376951/1‑149 (MQ=255) ccTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGGCAGGtt > 2:4168096/1‑149 (MQ=255) cTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTGTGACTAACGAAAAGGGAGGTCATTTCCAGATTTGCGTCTCCGGGTTTGGTAACCTTTTTAGGCTCTTCGCGACCAAATTTGGTGGTCAGGttt > 1:1186563/1‑149 (MQ=255) cTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTAAAGAAAAGGGAGTTCATGTCCAGATTTGAGTCTCCGGTTAGGGTAAACATATTCGGCTCTTCGCGAACAATTTTTCTGGTGAGGttt > 2:2831167/1‑149 (MQ=255) cTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACAACCGAACAGGGAGGTCATGTCCAGAATGGCGGCGCCCGGTAGGGTAACCATAATAGGCTCTTAGCGACCCAAATTGCTGGGCAGGttt > 1:861686/1‑149 (MQ=255) ttttCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGGTAGGGTAACCTTTTTCGGCTCTTCGCGACCCATTTGGGTGGTCAGGTTTGt > 2:622394/1‑149 (MQ=255) tttCTTTATCAAACCCGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTc < 2:3335752/149‑1 (MQ=255) tttCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGGTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAAATTGGCGGGTAAGGTTTGTc > 2:462169/1‑149 (MQ=255) tttATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGaa > 2:147239/1‑149 (MQ=255) ttATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAAc < 1:1526144/149‑1 (MQ=255) aTCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACaa < 1:326253/149‑1 (MQ=255) aTCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTATGACTAACGAAAAGGGAGTTAATGTCCAGATTTGCGGCTCCGGTTAGGGTAACCATATTAGGCTCTTCGCGACCAAATTGGCTGGTCCGGTTTGTCAGAACaa > 1:1671351/1‑149 (MQ=255) tCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCGTTCTGACGACCCCACCGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGGTAGGGTAACCTTATTCGGCGCGTCGCGCCCCAATTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACaaa > 1:573904/1‑148 (MQ=255) cAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGGTGGTCAGGGTTGTCAGAACAata > 2:289375/1‑149 (MQ=255) aaCACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTTGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAatatt > 2:4337429/1‑148 (MQ=255) acacGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATgg < 1:2155504/149‑1 (MQ=255) gggCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTAGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGt > 2:4419744/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCa < 2:2584638/149‑1 (MQ=255) cAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAg < 1:3624710/149‑1 (MQ=255) ttCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTATGACTACCCAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCATAATAGGCGCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCAcccc > 2:3852563/1‑149 (MQ=255) ttCAGTTTCTTGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTaa < 2:3817122/149‑1 (MQ=255) ttCAGTTTCATGGTCGCTTTCAGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGGAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCCATTTGGCGGGTCAGGTTTGGCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTaa > 2:2055996/1‑149 (MQ=255) tttCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGa < 2:1860298/149‑1 (MQ=255) ttCATGGTCGCTTTCTGACAACCGAACAGGGAGTTCATTTCCAGATTTGCGGCTCCCGTTATGGTAACCATATTAGGCTCTTCGCGACCCAATTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAAAAAGGGCGTCAGCCACGCCGGGGAAAACGat > 2:1143800/1‑149 (MQ=255) ttCATGGTCGCTTGCTGACAACCGAACCGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAAATTTGGGTGGTCAGGTTTGTCATAACATTATGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGat < 2:1182116/149‑1 (MQ=255) cATGGTCGCTTTCTGACTACCTACCAGGTATTTCATGTCCAGAGTGGCGTCTCCGTTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGatat < 2:937757/149‑1 (MQ=255) aTGGACGCTTTCTGACTACCGACCTGGGTGTTCATGTCAAGTTTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGATATTCGCGACCAATTTGGCTGGTCCGGTTTGTCATAACATTTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATc < 1:768935/149‑1 (MQ=255) ggTCGCTTTCTGCCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATGGGCGTCTCCGGTTAGGGAAACCTTATCCGGCTCTTCGCGACCACTTTGGCTGGTCCGGTTGGTCAGAACAATAGGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCtt < 2:660529/149‑1 (MQ=255) ggTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCtt < 2:2276679/149‑1 (MQ=255) gTCGCTTTCTGTCTACCTACCCGGGTGTTCTTGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGTTAACGTTATTCGGCTCTTGGCGACCATTTTGGCTGGTGAGGTTTGTCAGAAAAATTGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCttt < 1:3438360/149‑1 (MQ=255) gTCGCTTTCTGACTCCCGACCTGGGTGTTCTGGTCCAGTGGGGGGTCTCCGGTTTGGGTACCCTTATGCGGCTCGTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCATAACATTAGGGGCTTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCttt < 2:2682198/149‑1 (MQ=255) gTCGCTTTCTGACTCCCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTGGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCttt < 2:704144/149‑1 (MQ=255) cGCTTTCTTACTACCGAACTGGGAGTTCATGTCCAGTTTGGCTTCTCCGTTTTGGTTAACATTATTCGGCACTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTg < 1:3056161/149‑1 (MQ=255) gCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTga > 1:537767/1‑149 (MQ=255) ttCTGACTACCTCACTGGGAGTTCTTGTCCCTATTGGCGTCTCCGTTTAGGTTAACCTTATGCGGATCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATTGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGaa < 2:3244284/149‑1 (MQ=255) tGACGACCGACCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAatt < 2:1426414/149‑1 (MQ=255) gACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAatta > 2:3819813/1‑149 (MQ=255) aattccGAACTGGGAGTTATTTTCCAGTTTGGAGTCTCCGGTTTGGGTAACTTTTTCCGGATCGTCGCGACCATTTTGGCTGGCCAGGTTTGTCTTAAAAATTTGGGGGAATCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattat < 2:3463831/145‑1 (MQ=255) cTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattatt > 2:3320289/1‑149 (MQ=255) cTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattatt > 2:2624595/1‑149 (MQ=255) aCCGAACCGGGTGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTTGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCATTTTGGCTGGTCTGGTTTGTCATAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATtattat < 2:865901/149‑1 (MQ=255) ccGAACAGGGAGTTCATGTCCAGTTTGGCGTCTCCGGTTAGGTTAACATTATTCGGCTCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATg < 2:4046901/149‑1 (MQ=255) gAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGtt > 1:1893059/1‑149 (MQ=255) gAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGtt < 2:1771616/149‑1 (MQ=255) aCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGTTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTc < 2:284673/149‑1 (MQ=255) gggAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCa > 1:1680380/1‑149 (MQ=255) aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGc > 2:3095968/1‑149 (MQ=255) attGTCCTGTTTGGGTTCTCCGGTTTGGTTAAAATTTTTCGGATCTTCGCTACAAATTTGGCTGGTCTGGTTTTTCTTAAAAATTGGGGCGTAAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACt < 1:4554044/147‑1 (MQ=255) aTGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTg > 1:2620587/1‑149 (MQ=255) gTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGt > 1:2467878/1‑149 (MQ=255) tCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGtt > 2:1373208/1‑149 (MQ=255) agtttGGCGTCGCGGGTTTGGGTAACTTTTTTCGGCTCTCCGCGACCATTTTGGCTGGGCAGGTTGGTCAGAACAATAGGGGCGTAAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAt < 2:2805812/146‑1 (MQ=255) gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAtt > 2:2020108/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAAttt > 1:4042806/1‑149 (MQ=255) gCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTg > 2:1304950/1‑149 (MQ=255) tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc > 2:4085437/1‑149 (MQ=255) tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc > 2:4006869/1‑149 (MQ=255) gTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt > 2:412767/1‑149 (MQ=255) tAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCATTTGGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 2:2381412/149‑1 (MQ=255) aGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgt > 2:4578967/1‑149 (MQ=255) ggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgt > 2:2209441/1‑149 (MQ=255) ggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgt > 2:909912/1‑149 (MQ=255) ggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgt > 2:2236078/1‑149 (MQ=255) tAACTTTTTTCGGCTCGGCGCCACCTTTGGGGGTGGTCTGTTTTGAAAAAAAAATGGGGGCGTCCCCCACGCCGGTTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAt < 1:147239/149‑1 (MQ=255) tAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAt > 2:2267700/1‑149 (MQ=255) tAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAt > 1:3756108/1‑149 (MQ=255) cttttttCGGCTCTTCGCCACAATTTGGGCTGGTCAGGTTTGTCATAACAATTTGGGCGCCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTgg < 1:351756/144‑1 (MQ=255) cTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 2:4534359/1‑149 (MQ=255) ttATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt > 1:1776589/1‑149 (MQ=255) aTTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa > 2:1677440/1‑149 (MQ=255) aTTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa < 2:718113/149‑1 (MQ=255) aTTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa > 1:3165041/1‑149 (MQ=255) ttCGGCTCTTCGCCACCATTTGGGCGGGTCTGTTTTGTCAGAACAATCGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAg < 1:2938431/149‑1 (MQ=255) tctTCGCGACAATTTTGGCTGTTCTGGTTTGTCAGAACAATTGGGGCGCCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGAtt < 2:1671351/149‑1 (MQ=255) ctTCGCGACCATTTTGGCTGGTCTGTTTTGTCATAACAATTGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTa < 1:2990150/149‑1 (MQ=255) cgcgACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAg > 1:2338044/1‑149 (MQ=255) cgcgACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAg > 1:4308406/1‑149 (MQ=255) gcgACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGc > 1:2560745/1‑149 (MQ=255) gcgACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGc > 1:787373/1‑149 (MQ=255) gcccAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATTTGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCa < 2:3094504/147‑1 (MQ=255) gACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCa > 1:3242538/1‑149 (MQ=255) acaaaTTGGGGTGGTCTGGTTTGTCAGAACAATAGGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCaa < 2:438000/146‑1 (MQ=255) aCCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCaa > 1:1032688/1‑149 (MQ=255) aCCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCaa > 1:1593254/1‑149 (MQ=255) aaTTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGa > 2:1356421/1‑149 (MQ=255) aaTTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGa > 1:334962/1‑149 (MQ=255) tttgggCTGGTCTGTTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg < 2:1567922/145‑1 (MQ=255) tttGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGc > 1:3573239/1‑149 (MQ=255) ttGGCTGGTCTGTTTTGTCAGAAAAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCa < 1:1435264/149‑1 (MQ=255) tGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAg > 1:3141155/1‑149 (MQ=255) gggCTGGTCAGGTTTTTCAGAACAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAg < 2:164875/148‑1 (MQ=255) | GAAGATCGCACCTTTTTCTTTATCAAACACGGGCAGCGCTTTCAGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGACTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCC > CP009273/1118394‑1118690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |