| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 3,525,215 | A→C | 13.9% | L195R (CTG→CGG) | yhgE ← | DUF4153 family putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,525,215 | 0 | A | C | 13.9% | 653.7 / 29.2 | 251 | L195R (CTG→CGG) | yhgE | DUF4153 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (85/123); new base C (39/3); total (124/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.04e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
ATCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGT‑ATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAG > CP009273/3525068‑3525363 | ctCGCGCTCCGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAg < 1:1385701/148‑1 (MQ=255)aTCGCGCCCCGCCCCGTACACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAg < 1:846266/149‑1 (MQ=255) tCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGGGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAgc > 2:2215004/1‑149 (MQ=255) 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aGCGCGTTAACCAGACCTAACGTGATATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGT‑ATTGAAAAACGTGATGCCAACAATTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg < 2:2986428/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGT‑ATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAg < 2:700441/149‑1 (MQ=255) | ATCGCGCTCAGGCCCGTAAACGGCAGGGTGATGATAAACATCAGGGTTAGCAATGATACTAACGGCAGCAACCCCGTGGCGATTAACGTGAACAACTTTTGAATAGAGTCGATTAAACGTGACTGTGTTCGCGCGAGGATCACCGCCAGCGCGGTAACCAGACCTAACGTGAGATAAATAAACCAGTCGGTTGCAAAAAAGAGCGT‑ATTGAAAAACGTGATGCCAACAAGTTTAAACAACTCACTCCACAGTAAAAGCACCAGCCACGTCAAGCCATTGGCGAGAAAAATCACCAG > CP009273/3525068‑3525363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |