| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,546,277 | 0 | A | T | 9.6% | 794.8 / 21.4 | 246 | intergenic (‑445/‑167) | malP/malT | maltodextrin phosphorylase/mal regulon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (82/138); new base T (24/2); total (106/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-08 | |||||||||||
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Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |