| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 235,010 | G→T | 23.7% | L72I (CTT→ATT) | ykfM ← | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 235,010 | 0 | G | T | 23.7% | 366.3 / 38.3 | 223 | L72I (CTT→ATT) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (98/62); new base T (11/48); total (112/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.85e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCA > CP009273/234863‑235158 | tATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAgtaagt > 1:1771704/1‑149 (MQ=255) aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagta < 2:3400739/149‑1 (MQ=255) ttGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagtaa < 1:3345183/149‑1 (MQ=255) ttGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgtaagtaa > 2:3553781/1‑149 (MQ=255) tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaa < 1:1103165/149‑1 (MQ=255) aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 1:713114/149‑1 (MQ=255) atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑a < 2:3153714/149‑1 (MQ=255) ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATg < 1:4218809/149‑1 (MQ=255) tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGaa < 2:3769209/149‑1 (MQ=255) tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAAT‑AAATTAata > 1:661685/1‑149 (MQ=255) aCAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATAtt > 2:4008193/1‑149 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATAGTAATTAAAAAT‑AAATGAATATTTa > 1:2685150/1‑149 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATT‑AAATGAATAATTa > 1:1247136/1‑149 (MQ=255) aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAATATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑ACATGAATAATTa > 1:2450298/1‑149 (MQ=255) aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTaa < 2:558510/149‑1 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTaaa > 1:1436898/1‑149 (MQ=255) aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTaaa < 1:2801221/149‑1 (MQ=255) ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTaaaaa < 2:3304623/149‑1 (MQ=255) gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAg < 1:3921218/149‑1 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATATTAAGTAAAATT‑AAATTAATATTTaaaaatg > 2:2680805/1‑147 (MQ=255) aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAgg < 1:3506130/149‑1 (MQ=255) gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGa > 2:1074097/1‑149 (MQ=255) cTATTAAAGGTTCTATTAAGATATCTATTAGTAAAAATATAAGTGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:295190/149‑1 (MQ=255) cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAAT‑ACAATAATATTTAAAAATGaa > 1:500920/1‑149 (MQ=255) cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGACTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:3680876/149‑1 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTAATTTATTATCGTAAGTAAAATT‑AAATTAATATTTAAAAATTaaaa > 1:3210860/1‑149 (MQ=255) aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAAAA‑ACAAAAAAATTTAAAAAGGaaaa > 1:81073/1‑149 (MQ=255) tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGaaaaag > 1:1855604/1‑147 (MQ=255) aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGGTTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAAAT‑AAAATAATATTTAAAAAGGaaaaacg > 1:4444113/1‑146 (MQ=255) aaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAATGAAAACGAc > 2:1264033/1‑149 (MQ=255) aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑AAATGAATATTTAAAAATGAAAACGaaa > 2:2069225/1‑147 (MQ=255) aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACa > 2:618670/1‑149 (MQ=255) ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑AAATGAATATATAAAAAGGAAAACGACAt > 1:1739713/1‑149 (MQ=255) gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑AAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaa > 2:1171871/1‑149 (MQ=255) tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATT‑ACTTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAc < 2:349043/149‑1 (MQ=255) cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAg > 2:3703511/1‑149 (MQ=255) cGATAGATATTATTAAAAATATATGTGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACTTGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAg < 2:239814/149‑1 (MQ=255) aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTTATAATTATTTTTTTTTATTAAGTAAAAAT‑AAATTAAAATTTAAAAATGAAAACGACAATAAAACGAAGca > 1:1524591/1‑149 (MQ=255) atatattatTAAAAATATAAGATTTTGGTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTTTTTTATTATCGTAATTAAAATT‑AATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:4107829/146‑1 (MQ=255) aGCTATTTGAAAAAATATATGTGTTCGGTTTTTTGTTTTGTCGGTGGCTAAATTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATGTTATGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:2619156/149‑1 (MQ=255) gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAAAGATTTTTTTATAGTAATTAAAATT‑AAAATAATATTTAAAAATGAAAAAGAAAAGAAACCCAAAcacac > 1:2371749/1‑148 (MQ=255) gCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑AAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAACCCAAGCATAg > 2:3108774/1‑149 (MQ=255) tATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTGTTTTTATTATCTTAAGTAAAATT‑ACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:1837576/149‑1 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:1781656/149‑1 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAATCACAGAATaaa > 1:2581540/1‑149 (MQ=255) aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAAT‑AAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATTAAAACGAAGCACCGAATaaa > 1:2582923/1‑149 (MQ=255) tAAAAATATTTGTTTTAGCTTTTTTGTTTTTTCTGTGGTTAATTTGATTACTTTCTTTTTTTTGTTTTTGATTGTTTTTTTTTTCGTAAGTAAATTT‑ATATTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:528810/149‑1 (MQ=255) tAAAAATATATGTTTTTGGTGTTTTGTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTATGAATGTTTTTTTTATCGTATGTAAATTT‑ACATTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:2822641/149‑1 (MQ=255) tAAAAATATATGTGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTTAATACATTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATGTTAATTAAAATT‑AAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:935089/149‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAGTGTTAGTTTTTTTGTTATGTGTGTGGCTAATTTTACTACCTTGTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTTTATCTTATTTAAAATT‑AAATTAATTTTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt < 1:4045579/149‑1 (MQ=255) aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACCTGAAACCCCAGCACAGAATCAACaa > 1:140177/1‑148 (MQ=255) tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTcc > 2:2647264/1‑149 (MQ=255) ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATAAACATTCTCCa > 2:130640/1‑149 (MQ=255) aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAAT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATAAAAAATATCCAAt > 1:2868037/1‑149 (MQ=255) agagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAAT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc > 2:4082658/1‑149 (MQ=255) gTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑AAATGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAACAACATTCTCCAataata > 1:2226994/1‑149 (MQ=255) ttAGCTGTATTTTTTTGTCTGTGGCGAAATGGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTATGTAAAATT‑AAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaa < 2:1645824/149‑1 (MQ=255) tAGGTGTTTTGTTTTGTGTGTGGATAAATTTACTACATTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTATTTAAATTT‑ACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaa < 2:2018479/149‑1 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAATAAAAAT‑ACAATAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATTAAAAAGAAGCACACAAACAACAATCACCAaaaataaaat > 1:1341428/1‑149 (MQ=255) gCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑AAAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAATCACAGAATCAACAATATCCAATCATAAAat > 2:4432964/1‑149 (MQ=255) tttATTTTTTTTTCTGTGGCGAATTTGACTACCTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTATTATCTTATTTAAATTT‑AATTTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 1:3516397/147‑1 (MQ=255) gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACCAAGCACAGAAAAAACAATATCCAATAAAAAAATAtt > 1:1014303/1‑149 (MQ=255) gTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATT‑AAATTAATATTTAAAAATGAAAAAGAAATGAAAACGAAGCACAGAATAAAAATTCTACAATAATAAAAAAtt > 1:3714054/1‑149 (MQ=255) tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt > 2:330015/1‑149 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑AAATGAAAATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAAACGAAGCACAGAATCAACAATCTCCAAACATAAAATAttta > 1:356046/1‑148 (MQ=255) aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATTAATATTTAAAAATGAAAACGACAAGAAAACGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATCAAAAAATAatta > 1:354288/1‑148 (MQ=255) tttttttgtgtgtgGCTAATTTTACTACATTGTTTTTTTTTTTTAATAATTTTTTTTTTATCTTATTAAAATTT‑AATTTATTATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTcc < 1:1004750/143‑1 (MQ=255) ttATGTCTGTGGCTAATTTTACTACCTACTTTTTTTTTTTTAAGATTTTTTTTTTTATCGTAATTAAAATT‑ACATCAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTg < 2:3894943/149‑1 (MQ=255) ttGTTTGTGGCTATTTTGACTACCTTTTTTTTTTTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTCTTATTAAAATTT‑AATTTAATATTAAAAAATGAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGa < 1:3109515/148‑1 (MQ=255) gtgGCTAAATTGAATACATTTTTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTATTATCTTAA‑TAAAATTAACATTAATATTAAAAAAGAAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:913664/149‑1 (MQ=255) gtgGCCAAATTCACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATAAAAATA‑AAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:1828089/149‑1 (MQ=255) gctaatttGACTACTTTCGTTTTTTTTTTTAATAATTATTTTTTTATCGTATTTAAAATT‑AAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 1:684678/143‑1 (MQ=255) aaaTTGAATACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:3023006/149‑1 (MQ=255) gtaCTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACTTGAATATTTAAAATGGAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 1:3439298/147‑1 (MQ=255) aCTCCCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTATGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAata < 2:2354320/149‑1 (MQ=255) acttatttttttttATTAATATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAATT‑ACATTAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATaga < 1:1930714/143‑1 (MQ=255) cTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag > 1:760699/1‑149 (MQ=255) ttatttttttttATTAATAATTATTTTATTATCTTAATAAAAATT‑AAATTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:479646/145‑1 (MQ=255) tggTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 2:1984254/147‑1 (MQ=255) tCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt > 1:2535059/1‑149 (MQ=255) tttttttttATTAATATTTTTTTTATTATCTTAAGTAAAATT‑ACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:3328136/148‑1 (MQ=255) tttttttttATTAATATTTATTTTATTATCTTAATAAAAATA‑AAATTAAAATAAAAAAACTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 1:3852486/148‑1 (MQ=255) ttttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGttt < 2:156141/148‑1 (MQ=255) ttttttATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATT‑ACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 1:4525743/149‑1 (MQ=255) tttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTc > 2:4454351/1‑149 (MQ=255) tttataaaGAATTATTTTATTATCGTAATAAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTcc < 1:3697190/143‑1 (MQ=255) aTTAATAATGATTTTATTATATTAATTAAATTT‑AATTTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt < 1:616409/149‑1 (MQ=255) aTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGt > 2:1767112/1‑149 (MQ=255) ttAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTa > 2:1366551/1‑149 (MQ=255) aGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 2:1904580/1‑149 (MQ=255) ttgtttttATTATCTTAATTAAAATT‑AATTGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:1652563/145‑1 (MQ=255) atcaTTTTATTATCTTAATTAAAATT‑ACATTAATTTTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAc < 1:2091659/146‑1 (MQ=255) ttttttATCTTAATAAAAATT‑AAATTAATAATAAAAAATCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAaaga < 1:2677215/149‑1 (MQ=255) ttatCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCa > 2:2366378/1‑149 (MQ=255) ttttgtaattaaATTT‑AATTTAATTTTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 1:4299409/145‑1 (MQ=255) tatCTTAATTAAAATT‑AATTGAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCAt < 1:197705/149‑1 (MQ=255) tCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTg > 1:4162810/1‑149 (MQ=255) ttaagtaaAATT‑AAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:1436898/148‑1 (MQ=255) gtaattaaATTT‑ACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGaa < 2:1436602/149‑1 (MQ=255) agtaaAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGAATTTTATTATTGAATATAGAGTTTTAACTCCGGTAAAAAACAAATAAGAATTGAATGc > 1:4136301/1‑149 (MQ=255) | TATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATT‑ACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAAAGAAGCATTGAATGCA > CP009273/234863‑235158 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |