New junction evidence | |||||||||||
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
CAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCG > CP009273/2774502‑2774799 | cAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGc > 2:3989903/1‑150 (MQ=255) aGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGcc < 1:2635448/150‑1 (MQ=255) gAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGcct < 2:2030977/150‑1 (MQ=255) 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caTAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGc > 1:564086/1‑150 (MQ=255) caTAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGc > 1:4732054/1‑150 (MQ=255) aTAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGcc > 1:3955747/1‑150 (MQ=255) aaTTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTc > 1:4038511/1‑150 (MQ=255) aTTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAATTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTcc < 1:4276715/150‑1 (MQ=255) aTTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTcc > 2:4996568/1‑150 (MQ=255) tAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCgg > 2:4528800/1‑150 (MQ=255) aGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgc < 1:2221102/150‑1 (MQ=255) aGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgc > 2:1531612/1‑150 (MQ=255) aGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgc > 2:5032545/1‑150 (MQ=255) gCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgcg < 2:4185012/150‑1 (MQ=255) gCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGgcg < 2:2891798/150‑1 (MQ=255) | CAGAACGCCGCCATTATTAAGTCTGGTGCTATCTGTTTTAGCCTCCTTCTGGACAATCAGCTTACCGCCAGTATCAATGGTAGTATTTTTCGCCGAGGTTTTAGCCACTACCGTCAGTTCGCCGGTATTTTCCAGCACAACATAATTAGCCTCCCCTCCGGTAATAGTGAAGTGAGAGAGCTTGTTGTATCCTTCGATATCAGTCCCTGCACCCGTGTTGGCAACTAAAGCACTGCCCGTCTCCTGGTTAACCCCATGTGCAATACCGCCGGTATAGACAATCAGCGAGCCTCCGGCG > CP009273/2774502‑2774799 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |