Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,894,614 | C→A | 15.5% | A323S (GCA→TCA) | bglH ← | carbohydrate‑specific outer membrane porin, cryptic |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,894,614 | 0 | C | A | 15.5% | 956.2 / 110.5 | 305 | A323S (GCA→TCA) | bglH | carbohydrate‑specific outer membrane porin, cryptic |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (116/141); new base A (25/23); total (141/164) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
AAAGTTACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTCGCGAA > CP009273/3894465‑3894763 | aaaGTTACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATgc < 2:925210/150‑1 (MQ=255) aaaGTTACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATgc < 2:3427181/150‑1 (MQ=255) aaaGTGTCTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGTATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATgc < 2:641606/150‑1 (MQ=255) aGTTACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATgcgc > 1:476896/1‑150 (MQ=255) gTTACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCt > 1:3778476/1‑150 (MQ=255) tACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCttt < 1:5120793/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCg < 1:4658080/150‑1 (MQ=255) cTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCg < 1:2035452/150‑1 (MQ=255) gATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGc > 1:3534953/1‑150 (MQ=255) gATAGAGTTAGTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGc < 2:4035099/150‑1 (MQ=255) agagTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGt > 2:280755/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAACTTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATa < 2:3878491/150‑1 (MQ=255) ttCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATaa < 1:3252053/150‑1 (MQ=255) cgcgACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACg < 2:1281971/150‑1 (MQ=255) cgACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGAc < 1:987687/150‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCAc < 1:2561636/150‑1 (MQ=255) aggaaggaGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACtt < 2:529236/150‑1 (MQ=255) aggaaggaGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACtt < 2:2330127/150‑1 (MQ=255) ggaaggaGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTa < 1:4358790/150‑1 (MQ=255) ggaaggaGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTa < 1:1803312/150‑1 (MQ=255) aggaGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCa > 2:3321465/1‑150 (MQ=255) aaTTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAg < 2:1204872/150‑1 (MQ=255) aaTTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAg < 2:4467478/150‑1 (MQ=255) agtCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAgg > 1:2012614/3‑150 (MQ=255) aTTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAgg > 1:2700885/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGt > 2:4531573/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGt > 2:2960696/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGt > 1:558275/1‑150 (MQ=255) 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aCCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCa > 1:633056/1‑150 (MQ=255) ccTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCAt > 2:3376299/1‑150 (MQ=255) ccTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCAt > 2:2436079/1‑150 (MQ=255) cTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATa > 1:2891276/1‑150 (MQ=255) ttATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAAc > 2:3959119/1‑150 (MQ=255) ttATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAAc < 2:74367/150‑1 (MQ=255) tATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACg < 1:1150245/150‑1 (MQ=255) aTCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACgg < 2:2172817/150‑1 (MQ=255) tCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACggg < 1:1610903/150‑1 (MQ=255) cAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGa < 1:3216363/150‑1 (MQ=255) aTTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGatat > 2:1894605/1‑150 (MQ=255) ttCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCt < 1:1021650/150‑1 (MQ=255) tCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCtt < 2:3535255/150‑1 (MQ=255) tCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCtt < 1:3122761/150‑1 (MQ=255) gTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAg < 2:2584078/150‑1 (MQ=255) 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aaaCATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAAtggt > 1:1937304/1‑150 (MQ=255) aaaCATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAAtggt < 2:2243845/150‑1 (MQ=255) aaaCATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAAtggt < 1:1154095/150‑1 (MQ=255) aTCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAAtggtattg < 2:1459544/150‑1 (MQ=255) ccAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAAtggtattggt < 1:1504136/150‑1 (MQ=255) ggTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATggtattggtatt < 2:1832650/150‑1 (MQ=255) tATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTaa < 2:5127588/150‑1 (MQ=255) aTCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAAt > 1:1947374/1‑150 (MQ=255) tCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATc < 1:2670944/150‑1 (MQ=255) tCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATc > 2:154047/1‑150 (MQ=255) 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aataCCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGtttt < 1:2256347/150‑1 (MQ=255) ataCCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTg > 1:2648285/1‑150 (MQ=255) cccGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAg > 1:4180986/1‑150 (MQ=255) cGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGc > 1:23350/1‑150 (MQ=255) tattatCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGc < 1:3079523/150‑1 (MQ=255) tattatCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGc > 1:691179/1‑150 (MQ=255) attatCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCg < 1:1579335/150‑1 (MQ=255) attatCCTGATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCg > 1:3322635/1‑150 (MQ=255) ttatCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGa > 2:671405/1‑150 (MQ=255) ttatCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGa < 1:4564626/150‑1 (MQ=255) atCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATc < 2:3778516/150‑1 (MQ=255) atCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATc > 2:4492412/1‑150 (MQ=255) ccTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGt < 1:3698121/150‑1 (MQ=255) tGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTaa > 1:1778672/1‑150 (MQ=255) gATTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAat < 1:4467714/150‑1 (MQ=255) aTTATCTTTTTCCGATGAGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAatc < 1:2397867/150‑1 (MQ=255) cGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTc < 1:4954966/150‑1 (MQ=255) cGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTc > 1:4072952/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTcgcg < 2:3165417/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTCGCGa < 2:1239152/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTCGCGa < 1:4012821/150‑1 (MQ=255) gcgcTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTCGCGa > 1:1719093/1‑150 (MQ=255) | AAAGTTACTGGCGATAGAGTTATTCGCGACCAGGAAGGAGAATTCGTTGAAGCCACCTTTATCAAATTTCTGCGTTAAAGATGTGCCAAACATCCAGGTATCTTTCCAGTCATAATACCCGTTATTATCCTGATTATCTTTTTCCGATGCGCTTTCGTTTGCCGTGACATAACGACCACTTACCATTAAGGTGGCTTTATCCCATAACGGGATATCTTTATAGCGTAAATCAATGGTATTGGTATTAATCTGCTGTTTGTTTTGCAGGCTGCGATCGTAATCATCGACATCTTCGCGAA > CP009273/3894465‑3894763 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |