Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 3,898,349 | 0 | G | A | 5.1% | 1270.0 / 37.4 | 336 | F203F (TTC→TTT) | bglF | fused beta‑glucoside‑specific PTS enzymes: IIA component/IIB component/IIC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (182/137); new base A (7/10); total (189/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.18e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
TCAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGGAAGA > CP009273/3898201‑3898497 | cAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGaa > 2:1624743/1‑150 (MQ=255) cAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGaa < 1:3523365/150‑1 (MQ=255) gACAGAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAAt < 2:3511497/150‑1 (MQ=255) 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cccAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCggg > 2:1014153/1‑150 (MQ=255) cAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGgaa < 2:5100838/150‑1 (MQ=255) | TCAGACATAGCAATGGTGTGAAGAAATTTTTGATTGCCGACGGTAACCACGCATTAAGTCGGCGTTCCAGAATGCTGCACAACCAGGCAGAAAAAATAATGGGAATAACCGATGACGAGTAATTCAACAATGTGACCGGAATACCCAGGAAATCCAGCCCCAGCGCATCCGCTTTTTGCCCGTTCTCGAAAGCAGTCAGAATTAATGGATGCACTAACGCTCCACCAATCACCATGGCAGTAAATGGATTACCGCCGAAGCGTTTCCCCGCGGTGTATCCCAGGATTATCGGGAAGA > CP009273/3898201‑3898497 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |