| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,096,555 | G→T | 10.7% | S53S (TCG→TCT) | fieF → | ferrous iron and zinc transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,096,555 | 0 | G | T | 10.7% | 1191.6 / 66.7 | 329 | S53S (TCG→TCT) | fieF | ferrous iron and zinc transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (141/151); new base T (14/23); total (155/174) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
TCTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTC > CP009273/4096406‑4096703 | tcTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGcgtcg > 1:1578371/1‑150 (MQ=255) cTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGcgtcgt > 2:4598871/1‑150 (MQ=255) ttATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCttt < 1:709055/150‑1 (MQ=255) tATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTg < 1:4373389/150‑1 (MQ=255) tATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTg < 1:4979465/150‑1 (MQ=255) aTGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGa < 2:1318466/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAAt < 2:1825289/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAAtt > 1:2096507/1‑150 (MQ=255) cTGGTCTGTCGGTCGGCGATTGCTGCGACGGAGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTTAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGTTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTa < 2:1700654/150‑1 (MQ=255) cTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTa < 1:2820690/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTAt > 2:43170/1‑150 (MQ=255) cAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATtggt > 2:4498425/1‑150 (MQ=255) tCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTTGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTggtggt < 1:3636332/150‑1 (MQ=255) cGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGgtggtg < 1:3230114/150‑1 (MQ=255) ggcggcGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCg > 2:825236/1‑150 (MQ=255) ggcggcGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCg < 1:2224531/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTc > 2:928580/1‑150 (MQ=255) tgctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCt > 1:4241114/1‑150 (MQ=255) tgctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCt > 1:2010329/1‑150 (MQ=255) tgctgcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCt < 1:1684112/150‑1 (MQ=255) gcGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCaa < 1:3118041/150‑1 (MQ=255) aCGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCt < 1:4512005/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGc > 1:5014325/1‑150 (MQ=255) cGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCGGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCACCCTGCcg > 2:1135462/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcga > 2:2819750/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcga > 2:4357114/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcga > 1:4869333/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcga < 1:3922896/150‑1 (MQ=255) aTGGCTTCGCTTCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcgac < 2:2316479/150‑1 (MQ=255) tGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcgacg > 1:196688/1‑150 (MQ=255) ggCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCcgacga > 1:1087644/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGAt > 1:238449/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATa > 1:4459542/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATaa > 1:4059674/1‑150 (MQ=255) gctgctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCa > 2:1001970/1‑150 (MQ=255) ctgctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCAc > 2:2459812/1‑150 (MQ=255) ctgctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGGCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCAc < 1:25635/150‑1 (MQ=255) tgctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACt > 2:406930/1‑150 (MQ=255) ctATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCg < 1:1564060/150‑1 (MQ=255) ttGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGttt < 2:58778/150‑1 (MQ=255) gCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTgg > 2:2536698/1‑150 (MQ=255) cTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGt > 1:1363890/1‑150 (MQ=255) tGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTc < 2:2945516/150‑1 (MQ=255) gATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCa < 2:3331892/150‑1 (MQ=255) aTTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCAc > 1:620061/1‑150 (MQ=255) aTTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCAc < 2:3125858/150‑1 (MQ=255) tAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACgg > 2:2152055/1‑150 (MQ=255) aaaTTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTa < 1:3503050/150‑1 (MQ=255) tttGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCt > 2:5016545/1‑150 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa > 2:4111179/1‑150 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa < 2:1396034/150‑1 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa > 2:4706959/1‑150 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa < 2:3958932/150‑1 (MQ=255) tGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTAGTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGa < 2:2006266/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTc < 2:2787428/150‑1 (MQ=255) ggtggtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTccc < 2:4983103/150‑1 (MQ=255) ggtggtATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTccc > 1:2337200/1‑150 (MQ=255) tataCCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTcgcg < 2:4898680/150‑1 (MQ=255) cGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTGTGACGAATTTCTTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTCCAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCt > 2:641561/1‑150 (MQ=255) gTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGgc < 1:377853/150‑1 (MQ=255) tCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGgcg < 1:1450763/150‑1 (MQ=255) tCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGgcg < 1:527408/150‑1 (MQ=255) ggTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCa > 1:3518425/1‑150 (MQ=255) gAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAg < 2:3641750/150‑1 (MQ=255) gAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAg > 2:2744907/1‑150 (MQ=255) gAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAg < 2:1926263/150‑1 (MQ=255) tATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTAt > 1:2796982/1‑150 (MQ=255) aTTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGCCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATg < 1:535578/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGt < 2:1546701/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGt < 2:3010066/150‑1 (MQ=255) tctcGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGtt > 1:219319/1‑150 (MQ=255) ctcGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGACGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGttt < 2:3345493/150‑1 (MQ=255) tcGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCTCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTa < 1:3336759/150‑1 (MQ=255) tcGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTa < 2:3768038/150‑1 (MQ=255) gccgcGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTAtc > 2:4607920/1‑150 (MQ=255) gccgcGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTAtc > 1:2515513/1‑150 (MQ=255) gcTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCgg > 2:3725549/1‑150 (MQ=255) ggtggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTc < 1:1056005/150‑1 (MQ=255) ggtggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTc < 2:3522706/150‑1 (MQ=255) gtggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCg < 2:3610904/150‑1 (MQ=255) ggATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGc > 1:1753773/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACt < 1:3275309/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTa < 1:3849824/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTa > 1:4762494/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTAtt < 1:4681432/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTAtt < 1:2992777/150‑1 (MQ=255) tggtggATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTcc < 2:4042769/150‑1 (MQ=255) tggtggATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTcc > 2:4275314/1‑150 (MQ=255) gtggATATCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTg < 1:1014802/150‑1 (MQ=255) gATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGttt < 2:5123199/150‑1 (MQ=255) atatCGGCGCGTCTTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGtttt > 1:1918214/1‑150 (MQ=255) atatCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGtttt < 2:3429996/150‑1 (MQ=255) atatCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGtttt < 1:1676812/150‑1 (MQ=255) atatCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGtttt > 1:787755/1‑150 (MQ=255) atCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTg < 2:3582650/150‑1 (MQ=255) ggCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACg > 1:184653/1‑150 (MQ=255) cgcgTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACggg > 2:1869694/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTa > 1:91746/1‑150 (MQ=255) tcgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTAtt > 2:4244417/1‑150 (MQ=255) cgtTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTc > 2:1982947/1‑150 (MQ=255) | TCTTATGGACGGCTGGTCAGTCGGGCGGCGATTGCTGCGACGGCGATGGCTTCGCTGCTATTGCTGATTAAAATTTTTGCATGGTGGTATACCGGGTCGGTGAGTATTCTCGCCGCGCTGGTGGATTCGCTGGTGGATATCGGCGCGTCGTTGACGAATTTATTGGTGGTGCGATATTCCCTGCAACCTGCCGACGATAATCACTCGTTTGGTCACGGTAAAGCTGAGTCCCTCGCGGCGCTGGCGCAAAGTATGTTTATCTCCGGTTCGGCACTATTCCTGTTTTTGACGGGTATTC > CP009273/4096406‑4096703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |