| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,105,186 | C→A | 14.6% | D108Y (GAT→TAT) | glpX ← | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,105,186 | 0 | C | A | 14.6% | 1210.6 / 130.2 | 374 | D108Y (GAT→TAT) | glpX | fructose 1,6‑bisphosphatase II |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (157/162); new base A (36/19); total (193/181) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.87e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
CAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGATTTCAC > CP009273/4105037‑4105335 | cAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATc < 2:4936556/150‑1 (MQ=255) aGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCg > 2:3443554/1‑150 (MQ=255) ttCGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGATGCAGCCTTTATCGcc < 2:4273639/150‑1 (MQ=255) gtCGCTCACCGGTGTGCCGAGCGCCGCCGCTACATGGCGCAGGGTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCACGGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATCCATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGcc < 2:3061103/149‑1 (MQ=255) tCGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCt > 2:1700656/1‑150 (MQ=255) cGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTa < 1:1542050/150‑1 (MQ=255) cGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCtc > 2:4866916/1‑149 (MQ=255) gCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTAc < 1:3664460/150‑1 (MQ=255) gCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTGCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGACGCAGCCTTTATCGCCTAc > 2:131431/1‑150 (MQ=255) cTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACt > 1:651102/1‑150 (MQ=255) tCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTg < 1:4910065/150‑1 (MQ=255) tCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTg > 1:3899305/1‑150 (MQ=255) aCGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCa < 1:2857433/150‑1 (MQ=255) aCGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCa < 2:464380/150‑1 (MQ=255) tGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCg > 2:1212810/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGc > 2:4162258/1‑150 (MQ=255) ccGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGcc < 1:3583025/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCa < 2:477749/150‑1 (MQ=255) cGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCa < 2:1856362/150‑1 (MQ=255) gAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAg > 1:1054133/1‑150 (MQ=255) gAGCGCCGCCGCTAAATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAg > 1:3110008/1‑150 (MQ=255) gccgccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGcgcg > 1:3400390/1‑150 (MQ=255) gccgccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGcgcg < 1:1251193/150‑1 (MQ=255) cgccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGtt > 2:3617302/1‑150 (MQ=255) gccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTa < 2:1958337/150‑1 (MQ=255) gccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTa < 1:2611818/150‑1 (MQ=255) gccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTa > 1:1797256/1‑150 (MQ=255) gccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTa > 1:198883/1‑150 (MQ=255) ccgcTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAg > 1:3216892/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATgcgc < 1:2052091/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGt > 2:3642815/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCa < 1:2096036/150‑1 (MQ=255) ggTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCaa > 2:2949087/1‑150 (MQ=255) ggTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCaa > 1:4698650/1‑150 (MQ=255) gTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAAt < 2:3489286/150‑1 (MQ=255) gTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAAt < 2:7402/150‑1 (MQ=255) tCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCg < 2:2986522/150‑1 (MQ=255) gTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCa > 1:4352187/1‑150 (MQ=255) tttGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACAGATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATc < 2:3977365/150‑1 (MQ=255) tGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTa > 1:4613471/1‑150 (MQ=255) tGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTa > 2:2182948/1‑150 (MQ=255) ggCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTAc < 2:1024414/150‑1 (MQ=255) gCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTAcc < 1:1592799/150‑1 (MQ=255) cTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACcg < 2:447535/150‑1 (MQ=255) cTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACcg > 1:5128709/1‑150 (MQ=255) cTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACcg > 1:5096000/1‑150 (MQ=255) cGGCCCGACTATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTc < 2:3762998/150‑1 (MQ=255) ggCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTcg < 1:4132142/150‑1 (MQ=255) cccGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTcgcc < 1:780944/150‑1 (MQ=255) cccGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTcgcc < 1:4526178/150‑1 (MQ=255) aCAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTCTCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGa > 2:3871410/1‑150 (MQ=255) cAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGAc > 2:524740/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGAcc > 2:4606190/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCa < 2:490718/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGt > 1:2941092/1‑150 (MQ=255) gCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTAc < 1:1654040/150‑1 (MQ=255) cTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTAcc < 1:3278775/150‑1 (MQ=255) cTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTAcc < 2:3351926/150‑1 (MQ=255) ttCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCg > 2:2305949/1‑150 (MQ=255) ttCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGACGCCGCGACCAGTACCg > 1:4416265/1‑150 (MQ=255) tctcCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGa > 2:2822722/1‑150 (MQ=255) tctcCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGa < 1:3861742/150‑1 (MQ=255) tcCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACt > 1:2221085/1‑150 (MQ=255) atatACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACtttt < 1:4845169/150‑1 (MQ=255) atatACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACtttt > 1:303967/1‑150 (MQ=255) tataCATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACttttt > 1:2429344/1‑150 (MQ=255) ataCATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTc < 2:242497/150‑1 (MQ=255) ataCATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTc > 1:4545160/1‑150 (MQ=255) atatCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCa > 1:2937421/1‑150 (MQ=255) tatCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCaa > 1:4819361/1‑150 (MQ=255) tatCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCaa > 1:4274976/1‑150 (MQ=255) atCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAAt > 2:3192789/1‑150 (MQ=255) gcATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGc > 1:852497/1‑150 (MQ=255) gcATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGc > 2:1143008/1‑150 (MQ=255) cATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCa < 1:1443337/150‑1 (MQ=255) cATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCa < 1:4005100/150‑1 (MQ=255) cATTGAGGAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCa > 2:1404006/1‑150 (MQ=255) tGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCg < 1:3760639/150‑1 (MQ=255) tGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCg < 1:1188207/150‑1 (MQ=255) aGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGt < 1:3830895/150‑1 (MQ=255) aGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGt < 1:4074676/150‑1 (MQ=255) aGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGt > 2:5063648/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCCATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCCTCGGTg > 2:253486/1‑150 (MQ=255) ggAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTg < 1:396547/150‑1 (MQ=255) ggAAGCAGCCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTg > 2:343011/1‑150 (MQ=255) aaGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCt < 2:1480273/150‑1 (MQ=255) aaGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCt < 2:2595579/150‑1 (MQ=255) gcagcCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtc < 2:4447893/150‑1 (MQ=255) gcagcCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtc < 2:2220229/150‑1 (MQ=255) gcagcCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtc < 1:4162258/150‑1 (MQ=255) gcagcCTTTATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtc < 1:2478678/150‑1 (MQ=255) agcCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtcgt < 1:1021969/150‑1 (MQ=255) agcCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtcgt < 1:945445/150‑1 (MQ=255) ccTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTtcgtcg < 2:4484116/150‑1 (MQ=255) cTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGa < 2:1829001/150‑1 (MQ=255) ttATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGAtt > 2:2060162/1‑150 (MQ=255) ttATAGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGAtt > 2:5052124/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGATttc < 2:818189/150‑1 (MQ=255) cGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGATttcac < 1:2059445/150‑1 (MQ=255) cGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTAACGCGTCGCCGCGACCAGTACAGTATTGTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGATttcac < 1:4982009/150‑1 (MQ=255) | CAGTTCGCTCAACGGTTTGCCGAGCGCCGCCGCTACATTGCGCAGGTTATCCGCCAGCGGCAGGTTCAGATCAATGGTGCCTTTGGCTCCCGGCCCGACAATCAGCTTCTCCATATACATATCCGGCGCATTGAGGAAGCAGCCTTTATCGCCTACTGCCAGCACCGCCAGCGCGTTAGCCTGGCCCATCGCCGTCATGCGCGTGCCTTCAATCGGATCAACAGCAATATCTACCGCGTCGCCGCGACCAGTACCGACTTTTTCACCAATGTAGAGCATCGGTGCTTCGTCGATTTCAC > CP009273/4105037‑4105335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |