| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 386,569 | C→A | 15.0% | pseudogene (863/1458 nt) | yaiT → | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 386,569 | 0 | C | A | 15.0% | 936.8 / 101.9 | 291 | pseudogene (863/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (125/122); new base A (18/26); total (143/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
CAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACGGGGGTT > CP009273/386420‑386718 | cAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTc > 2:4118665/1‑150 (MQ=255) atatCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAg < 2:4069662/150‑1 (MQ=255) tatCTCTGTAAAAGATTCCACATTGACTTCGTGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTTGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCTgg < 1:4129535/150‑1 (MQ=255) tatCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAgg > 1:5145421/1‑150 (MQ=255) tctGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTcc < 1:3248728/150‑1 (MQ=255) gTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGAc > 1:3663954/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACt > 2:3596700/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACt < 1:4548574/150‑1 (MQ=255) aaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATg > 1:3452778/1‑150 (MQ=255) aaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATg > 1:1501725/1‑150 (MQ=255) aaGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATg > 1:1719426/1‑150 (MQ=255) aGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGc < 1:2674200/150‑1 (MQ=255) aTTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGa > 1:1602557/1‑150 (MQ=255) ttCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGAt < 1:1025769/150‑1 (MQ=255) ttCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGAt < 2:45349/150‑1 (MQ=255) ccACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATga > 2:1563226/1‑150 (MQ=255) cacaGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaa > 2:3154533/1‑150 (MQ=255) cacaGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaa < 1:1029629/150‑1 (MQ=255) aGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaagaa < 2:3646749/150‑1 (MQ=255) aGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATgaagaa < 1:3570077/150‑1 (MQ=255) gTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAAc < 1:461625/150‑1 (MQ=255) tGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACa < 2:3094680/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGt < 1:369049/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTAt > 1:4212119/1‑150 (MQ=255) gggTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTAtt < 2:5122375/150‑1 (MQ=255) gTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTcc > 2:4590442/1‑150 (MQ=255) ttCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCt < 1:776495/150‑1 (MQ=255) tCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTc > 1:1648011/1‑150 (MQ=255) cAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCa < 1:5037615/150‑1 (MQ=255) aaaTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAg > 2:801869/1‑150 (MQ=255) aaaTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAg > 1:3805263/1‑150 (MQ=255) aaTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGc > 1:2990397/1‑150 (MQ=255) aaTTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGACCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACCATGTAATCCTCAGc > 2:2976289/1‑150 (MQ=255) tataTCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAAt < 2:4465416/150‑1 (MQ=255) atatCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAAtt < 1:1752831/150‑1 (MQ=255) atCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCa > 1:638189/1‑150 (MQ=255) tCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCaa > 1:2780559/1‑150 (MQ=255) cTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACg > 2:2419010/1‑150 (MQ=255) aTAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGa > 2:909878/1‑150 (MQ=255) tAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGAt < 2:3896296/150‑1 (MQ=255) aGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATg > 1:888659/1‑150 (MQ=255) aaTACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGt > 2:2245145/1‑150 (MQ=255) aaTACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGt > 2:4796106/1‑150 (MQ=255) tACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa > 1:4478224/1‑150 (MQ=255) tACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa > 1:1259675/1‑150 (MQ=255) tACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGa > 1:558153/1‑150 (MQ=255) aCTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGAt < 1:3745551/150‑1 (MQ=255) aCTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGAt > 1:4515272/1‑150 (MQ=255) ttATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGt > 1:2486452/1‑150 (MQ=255) ggCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGcc > 1:3948579/1‑150 (MQ=255) gCAAATCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCt < 2:882657/150‑1 (MQ=255) aaaaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCttt < 2:2170907/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGATGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTAc < 2:1475502/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTAc > 2:431064/1‑150 (MQ=255) cTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCa < 2:262287/150‑1 (MQ=255) tGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAg < 1:1075716/150‑1 (MQ=255) tGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAg < 1:427689/150‑1 (MQ=255) ggTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGc > 2:725842/1‑150 (MQ=255) gTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCa < 2:1762468/150‑1 (MQ=255) cTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTg > 1:1191052/1‑150 (MQ=255) tttGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTgg < 2:3388213/150‑1 (MQ=255) gCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATa > 2:4007659/1‑150 (MQ=255) cAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAg < 2:2003571/150‑1 (MQ=255) tCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAt < 2:4341633/150‑1 (MQ=255) tgatgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAttt < 1:2337162/150‑1 (MQ=255) gatgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAtttt > 1:464141/1‑150 (MQ=255) gatgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAAtttt < 2:3352810/150‑1 (MQ=255) atgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTg < 2:557387/150‑1 (MQ=255) tgaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGa > 2:1652045/1‑150 (MQ=255) gaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGAt < 1:971268/150‑1 (MQ=255) gaACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGAt < 2:1959163/150‑1 (MQ=255) aCCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATcc < 1:4027097/150‑1 (MQ=255) aCCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATcc > 1:2183928/1‑150 (MQ=255) cGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGa > 2:3305930/1‑150 (MQ=255) gAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGaa > 2:488920/1‑150 (MQ=255) gTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATg > 1:1932738/1‑150 (MQ=255) gTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATg > 2:2371368/1‑150 (MQ=255) gATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGt < 1:2414826/150‑1 (MQ=255) ttATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCa < 2:2901443/150‑1 (MQ=255) ttATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCa < 2:69090/150‑1 (MQ=255) ttATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCa < 2:1308112/150‑1 (MQ=255) ttATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCa > 1:4424236/1‑150 (MQ=255) cTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGAtt > 1:4830025/1‑150 (MQ=255) cccGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCaa > 1:2849525/1‑150 (MQ=255) cGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg > 1:1203945/1‑150 (MQ=255) gATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGAc < 2:2723817/150‑1 (MQ=255) gATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGAc > 1:258964/1‑150 (MQ=255) gATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGAc < 2:952276/150‑1 (MQ=255) aTGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACg > 2:2124616/1‑150 (MQ=255) aTGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCAGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACg < 2:1113366/150‑1 (MQ=255) tGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACgg > 2:3758536/1‑150 (MQ=255) tGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACgg > 2:1869692/1‑150 (MQ=255) gCAATGTCCTTTACTGCTTAAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTg < 2:1821051/150‑1 (MQ=255) aaTGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGaa > 2:943250/1‑150 (MQ=255) tACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCaa < 2:1026978/150‑1 (MQ=255) aCTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAAc < 1:1823574/150‑1 (MQ=255) cTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACg < 1:3596700/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACggggg < 1:1156727/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACGGGGGtt < 1:3127173/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACGGGGGtt < 2:4995764/150‑1 (MQ=255) | CAATATCTCTGTAAAAGATTCCACAGTGACTTCGGGTTCAAATTATATCCTGGATAGCAATACTTATGGCAAAACTGGTCACTTTGGCAATTCTGATGAACCGAGTGATTATGCTGGCCCGGGTGATGTTGCAATGTCCTTTACTGCTTCAGGTTCCGACTATGCGATGAAGAACAATGTATTCCTCAGCAATTCAACGCTGATGGGTGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACGGTGACGGGGTGAAAGATACCAACGGGGGTT > CP009273/386420‑386718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |