Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,144,697 | C→A | 10.2% | A27S (GCA→TCA) | argE ← | acetylornithine deacetylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,144,697 | 0 | C | A | 10.2% | 1162.6 / 71.9 | 328 | A27S (GCA→TCA) | argE | acetylornithine deacetylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (138/156); new base A (20/14); total (158/170) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
ACAAGCCGCCAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTT > CP009273/4144550‑4144846 | acaaGCCGCCAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCct < 1:3960846/150‑1 (MQ=255) acaaGCCGCCAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCct > 1:4157805/1‑150 (MQ=255) acaaGCCGCCAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCct > 1:344382/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCtt > 2:3867138/1‑150 (MQ=255) ccgccAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTcc < 2:284005/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTg > 2:3756945/1‑150 (MQ=255) aGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGgc > 1:5109333/1‑150 (MQ=255) gCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGgcg > 2:4333328/1‑150 (MQ=255) gCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGgcg < 1:3116723/150‑1 (MQ=255) ccccTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCGGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCt > 2:2327740/1‑150 (MQ=255) tCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGa < 2:1381883/150‑1 (MQ=255) tCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGa < 2:2046380/150‑1 (MQ=255) ccGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGaa < 2:3153097/150‑1 (MQ=255) gATACGTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAgg < 1:2576706/150‑1 (MQ=255) tACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGgtg > 1:3180311/1‑150 (MQ=255) tACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGgtg > 1:3015397/1‑150 (MQ=255) cTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACACTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGtgtg < 2:3030232/150‑1 (MQ=255) cTTGCCAGCAGATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCGTCCGTGGCGCTTATTGAAGGtgtg < 2:4226693/150‑1 (MQ=255) ccAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCaa > 2:1877899/1‑150 (MQ=255) tatTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCagag > 2:4327397/1‑150 (MQ=255) tGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAgcgc > 2:3958862/1‑150 (MQ=255) aTTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGt < 1:1952522/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGt < 2:5108833/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCACAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGt > 2:1219509/1‑150 (MQ=255) tgttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTaaa > 1:3375866/1‑150 (MQ=255) gttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAt < 2:687115/150‑1 (MQ=255) gttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAt > 1:496543/1‑150 (MQ=255) gttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAt > 1:3287962/1‑150 (MQ=255) gttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAt < 1:1568149/150‑1 (MQ=255) ttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAtc > 2:5010191/1‑150 (MQ=255) ttgCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAtc > 1:4915657/1‑150 (MQ=255) gCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAAtctc > 1:2839624/1‑150 (MQ=255) cTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATg > 1:2652869/1‑150 (MQ=255) tGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATgg < 2:2111602/150‑1 (MQ=255) ggAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGc < 2:4157672/150‑1 (MQ=255) gAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCg < 2:4838015/150‑1 (MQ=255) aCAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGt < 1:3827068/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTa < 2:1560936/150‑1 (MQ=255) cTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCCGTCCGCCAGCAGAGTGATTAACTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAAttt < 2:4295335/150‑1 (MQ=255) cTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAAttt < 1:1610814/150‑1 (MQ=255) gCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGt > 2:4387436/1‑150 (MQ=255) cACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGtt > 2:4525728/1‑150 (MQ=255) cACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGtt > 2:1973245/1‑150 (MQ=255) aCTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGttt > 1:3303981/1‑150 (MQ=255) aCTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGttt > 1:99469/1‑150 (MQ=255) aCTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGGAATTTGttt > 1:645050/1‑150 (MQ=255) ccACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCTGAGCGCGGTAACTCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCa < 2:395004/150‑1 (MQ=255) aTTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCAttgt < 1:4386507/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCCAACTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCAttgttg < 2:3540030/150‑1 (MQ=255) aaGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGac > 1:913059/1‑150 (MQ=255) cAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACAcc < 1:1135623/150‑1 (MQ=255) cAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACAcc < 1:1678373/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACct < 2:1737659/150‑1 (MQ=255) aaTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACctc < 1:1815454/150‑1 (MQ=255) aTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACctct < 2:2637398/150‑1 (MQ=255) aTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACctct < 1:1722392/150‑1 (MQ=255) ttAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTc < 1:4432930/150‑1 (MQ=255) tAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGACCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCa > 1:4035461/1‑150 (MQ=255) aaaCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCAt < 2:2674237/150‑1 (MQ=255) aaaCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCAt < 1:3886255/150‑1 (MQ=255) aCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGa < 2:3078253/150‑1 (MQ=255) aCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGa > 1:3693516/1‑150 (MQ=255) cAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATa > 2:816544/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAg > 1:5062910/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAg > 2:1068178/1‑150 (MQ=255) gTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGt > 1:2062248/1‑150 (MQ=255) tCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTa > 2:4911480/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa > 2:1843688/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa < 2:3326626/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa > 2:2137283/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCaa > 1:2157329/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCaa > 1:474740/1‑150 (MQ=255) cagcagAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAat < 1:2765227/150‑1 (MQ=255) cagAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATAtt < 1:2327740/150‑1 (MQ=255) tGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGc < 2:3303961/150‑1 (MQ=255) aTTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAg > 1:1456023/1‑150 (MQ=255) tAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTa < 1:78549/150‑1 (MQ=255) tAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTa < 1:3084184/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAt > 1:1191887/1‑150 (MQ=255) aaTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAtt > 1:108583/1‑150 (MQ=255) aaTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAtt < 2:277728/150‑1 (MQ=255) tCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTa < 2:2339607/150‑1 (MQ=255) tCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTa < 1:4628630/150‑1 (MQ=255) cTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTAt < 2:3393698/150‑1 (MQ=255) gCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGa < 1:1231864/150‑1 (MQ=255) aTTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAAt < 1:3243606/150‑1 (MQ=255) ttGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATa < 2:1493723/150‑1 (MQ=255) ttGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATa < 2:495358/150‑1 (MQ=255) tGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaa < 2:2541387/150‑1 (MQ=255) gCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaa > 2:3224921/1‑150 (MQ=255) cTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaaa > 1:249356/1‑150 (MQ=255) ttGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAATATTTATGAATAAAAAt < 2:1753429/150‑1 (MQ=255) tGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGGGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTATTTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATAAATATTCATGAAGTATTTATGAATAAAAATa < 1:4777772/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATaca < 1:705077/150‑1 (MQ=255) cGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACt < 2:57557/150‑1 (MQ=255) gAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATacacaa > 2:789292/1‑148 (MQ=255) gAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTa > 2:292736/1‑150 (MQ=255) gAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTa > 1:3334524/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTaa < 1:844508/150‑1 (MQ=255) tGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACg < 2:1330617/150‑1 (MQ=255) | ACAAGCCGCCAGCCCCCTGTCCGATACTTGCCAGCATATTGAATTTGTTGCGAGTTCCTGGAACAGGCTGCACTTCCACATTGAAGCCCAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTT > CP009273/4144550‑4144846 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |