Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,144,787 | C→A | 5.8% | intergenic (‑12/‑142) | argE ← / → argC | acetylornithine deacetylase/N‑acetyl‑gamma‑glutamylphosphate reductase, NAD(P)‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,144,787 | 0 | C | A | 5.8% | 1263.3 / 31.5 | 321 | intergenic (‑12/‑142) | argE/argC | acetylornithine deacetylase/N‑acetyl‑gamma‑glutamylphosphate reductase, NAD(P)‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (155/147); new base A (5/14); total (160/161) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.59e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 337 total aligned reads displayed.
CAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAA > CP009273/4144638‑4144936 | cAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACAcc < 1:1135623/150‑1 (MQ=255) aactCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACct < 2:1737662/147‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACct < 1:4587671/150‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACct < 1:1301090/150‑1 (MQ=255) aaTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACctc < 1:1815466/150‑1 (MQ=255) aTCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACctct < 1:1722392/150‑1 (MQ=255) ttAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTc < 1:4432928/150‑1 (MQ=255) tAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCa < 2:790173/150‑1 (MQ=255) aaaCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCAt > 2:39769/1‑150 (MQ=255) aaaCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCAt < 1:4924259/150‑1 (MQ=255) aaaCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCAt < 1:3886255/150‑1 (MQ=255) aCCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGa > 1:3693516/1‑150 (MQ=255) cAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATa > 1:4831462/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAg > 1:5062910/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAg > 2:1068178/1‑150 (MQ=255) gTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGt > 1:2062248/1‑150 (MQ=255) tCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTa > 2:2367855/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa > 2:2137085/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa < 2:4851302/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa > 2:1843683/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCa < 2:3326626/150‑1 (MQ=255) cagcagAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAat < 1:2765227/150‑1 (MQ=255) cagcagAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAat < 1:167537/150‑1 (MQ=255) gcagAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAatat < 1:3959027/150‑1 (MQ=255) agagTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTc < 1:613908/150‑1 (MQ=255) agTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCAt > 2:1144239/1‑150 (MQ=255) agTGATTAAATCTGCATGGCTTTGATCGAGGGCCTCTTCCGGGGCGCTGATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCTTTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCAt < 2:2040742/150‑1 (MQ=255) tGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGc < 2:3303961/150‑1 (MQ=255) aTTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAg < 1:1226654/150‑1 (MQ=255) ttAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGt < 2:2656541/150‑1 (MQ=255) tAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTa > 1:1527397/1‑150 (MQ=255) tAAATCTGCAGTGCTTTGATCGAGTGCCTCGTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAACTCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTa < 2:5099634/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAt < 2:3183992/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAt < 2:148448/150‑1 (MQ=255) aaTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAtt > 1:108583/1‑150 (MQ=255) aTCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTAttt < 2:3684441/150‑1 (MQ=255) tCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTa < 1:4628630/150‑1 (MQ=255) tCTGCATTGCTTTGATCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTa > 1:4750772/1‑150 (MQ=255) aTTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAAt < 1:3243606/150‑1 (MQ=255) ttGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATa < 2:495358/150‑1 (MQ=255) gCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaa > 2:2794315/1‑150 (MQ=255) gCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaa > 2:3224921/1‑150 (MQ=255) cTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaaa > 1:249356/1‑150 (MQ=255) tttGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaaaa > 1:802771/1‑150 (MQ=255) ttggATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAACTGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATaaaaa < 2:4445467/147‑1 (MQ=255) ttGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAATATTTATGAATAAAAAt < 2:4315023/150‑1 (MQ=255) ttGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAATATTTATGAATAAAAAt < 2:1753429/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATaca > 2:2521801/1‑150 (MQ=255) tCGAGTGACTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATacac > 1:1431392/1‑150 (MQ=255) gAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTa > 1:897661/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTaa > 1:670423/1‑150 (MQ=255) tGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACg < 2:1330690/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGtt < 2:4917110/150‑1 (MQ=255) tctTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGa > 1:4100880/1‑150 (MQ=255) ttCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGc > 2:2288222/1‑150 (MQ=255) tCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCg > 2:1708992/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACAAACGTTGAGCGta > 2:1306061/1‑150 (MQ=255) cgcTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATaaa < 2:3712513/150‑1 (MQ=255) tATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAAccc > 1:1008957/1‑150 (MQ=255) aTTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACcca > 2:4896734/1‑150 (MQ=255) aTTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACcca > 1:3487731/1‑150 (MQ=255) ttGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACccac > 1:3262112/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACccacca < 2:15102/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGcc > 1:533033/1‑150 (MQ=255) gtgtGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCg < 1:4230554/150‑1 (MQ=255) gtgGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTa > 1:2116795/1‑150 (MQ=255) ggCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAg < 2:3643399/150‑1 (MQ=255) gCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAgg < 1:785259/150‑1 (MQ=255) agagCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATg < 1:3071182/150‑1 (MQ=255) atcgcgGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGtt > 1:3402277/3‑150 (MQ=255) agCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGtt < 2:3015403/150‑1 (MQ=255) ggTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACg > 1:2172013/1‑150 (MQ=255) aTCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTaa > 1:3084732/1‑150 (MQ=255) tctcGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAAc > 1:2913745/1‑150 (MQ=255) ctcGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAAcc < 2:2731108/150‑1 (MQ=255) ctcGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAAcc > 1:3313991/1‑150 (MQ=255) gATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTgg > 2:4085380/1‑150 (MQ=255) aTAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGc > 1:1972750/1‑150 (MQ=255) tAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCa > 1:933488/1‑150 (MQ=255) aaaTGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGATGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCaa > 1:1463582/1‑150 (MQ=255) aaTGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAAc > 1:1806894/1‑150 (MQ=255) ggTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACa < 1:287577/150‑1 (MQ=255) aTTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATaag > 2:1903338/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAgg > 1:2708712/1‑150 (MQ=255) tttttCATTGTTGACACACATCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGt < 1:4333328/150‑1 (MQ=255) ttttCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTg > 1:4454704/1‑150 (MQ=255) tttCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTTAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGa < 1:1241493/150‑1 (MQ=255) tCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAAt > 1:4899927/1‑150 (MQ=255) tgttgACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGcc > 2:1242984/1‑150 (MQ=255) gttgACACAACTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGTTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGccc > 2:2623698/1‑150 (MQ=255) ttgACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGcccc > 2:4987703/1‑150 (MQ=255) gACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGa < 2:3904852/150‑1 (MQ=255) acacacCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGAt < 2:3368872/150‑1 (MQ=255) acacacCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCAGAt < 2:4750772/150‑1 (MQ=255) cacacCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTATAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAAAAGCCCCGATg > 1:375194/1‑150 (MQ=255) acacCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGt > 1:3812985/1‑150 (MQ=255) cacCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGtt < 2:645050/150‑1 (MQ=255) acCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTg < 2:4213325/150‑1 (MQ=255) acCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTg > 1:2304290/1‑150 (MQ=255) ctctGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAATATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGaa < 2:3817675/150‑1 (MQ=255) | CAAATCTTTAAACCAGTCCGCCAGCAGAGTGATTAAATCTGCATTGCTTTGATCGAGTGCCTCTTCCGTGGCGCTTATTGAAGGTGTGGCAATCAGAGCGCGGTAAATCTCGATAAATGGCGGTAATTTGTTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGAAGGTGAATAGCCCCGATGTTGAA > CP009273/4144638‑4144936 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |