| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,320,106 | T→A | 15.1% | intergenic (+51/‑213) | yjcZ → / → proP | YjcZ family protein, mutational suppressor of yhjH motility mutation/proline/glycine betaine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,320,106 | 0 | T | A | 15.1% | 766.2 / 112.7 | 265 | intergenic (+51/‑213) | yjcZ/proP | YjcZ family protein, mutational suppressor of yhjH motility mutation/proline/glycine betaine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (98/127); new base A (25/15); total (123/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.81e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
CGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTT > CP009273/4319957‑4320255 | cGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAt < 2:4736584/150‑1 (MQ=255) ggCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAACTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAATTTGATcaca < 2:4893469/150‑1 (MQ=255) ggCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATcaca < 2:1253719/150‑1 (MQ=255) ggCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATcaca > 2:2545277/1‑150 (MQ=255) cAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACaaa < 1:4092304/150‑1 (MQ=255) aaaCTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAAt < 1:4979819/150‑1 (MQ=255) aaCTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAAtt < 1:2265052/150‑1 (MQ=255) aaCTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAAtt < 1:1995874/150‑1 (MQ=255) tGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTaa < 2:4223868/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACt < 2:3183546/150‑1 (MQ=255) cTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTgg < 2:736831/150‑1 (MQ=255) tGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTCGt > 2:2177872/1‑150 (MQ=255) gggATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAg > 2:3578509/1‑150 (MQ=255) ggATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAgg < 1:4425744/150‑1 (MQ=255) ggATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAgg < 1:5116932/150‑1 (MQ=255) aTGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGt < 1:3432483/150‑1 (MQ=255) gCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTaa < 1:1553138/150‑1 (MQ=255) gACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAgg < 1:387813/150‑1 (MQ=255) gACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAgg > 1:2368634/1‑150 (MQ=255) tGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCAtt < 1:4723210/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTa < 2:4861759/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTa < 2:1112752/150‑1 (MQ=255) cagcgcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACt < 2:1228247/150‑1 (MQ=255) agcgcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTg < 1:730401/150‑1 (MQ=255) cgcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGcc < 2:4031271/150‑1 (MQ=255) gcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGccc < 1:1391553/150‑1 (MQ=255) gcagcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGccc < 1:880605/150‑1 (MQ=255) gcgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTCGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAAt < 1:2663996/150‑1 (MQ=255) cgTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTTGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAAtt < 1:2579206/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTc > 2:2572041/1‑150 (MQ=255) gTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTc < 1:951159/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAg > 2:1004294/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAgg > 2:2445341/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAgg < 1:110825/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGc > 1:1638205/1‑150 (MQ=255) gCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCg < 2:4262806/150‑1 (MQ=255) cGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAGTGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGt < 1:4716945/150‑1 (MQ=255) gggggCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTc > 1:705434/1‑150 (MQ=255) gggCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCaa < 2:2779683/150‑1 (MQ=255) gggCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGACCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCaa > 2:3952268/1‑150 (MQ=255) ggCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAAc > 1:1345027/1‑150 (MQ=255) gCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGttt < 1:1735841/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg < 2:2927923/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg > 1:2108246/1‑150 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg < 2:1394860/150‑1 (MQ=255) cTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTg > 2:2873400/1‑150 (MQ=255) tCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAATGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTgt > 1:3032159/1‑149 (MQ=255) tCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGa > 2:2325842/1‑150 (MQ=255) aGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTg > 2:5085101/1‑150 (MQ=255) aGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTg < 2:1609591/150‑1 (MQ=255) gAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTa > 1:3902414/1‑150 (MQ=255) aaaTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTAc < 2:4543865/150‑1 (MQ=255) aaTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAGGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACa < 1:4844487/150‑1 (MQ=255) aTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACAt > 2:604441/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACAt < 1:1186564/150‑1 (MQ=255) aTCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACAt < 1:3281936/150‑1 (MQ=255) tctcTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTTCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCt > 2:3705748/1‑150 (MQ=255) tctcTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCt < 2:1583465/150‑1 (MQ=255) tctGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTa < 1:2863675/150‑1 (MQ=255) tctGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTa < 2:690645/150‑1 (MQ=255) tAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCg > 1:3444703/1‑150 (MQ=255) tGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGgt > 1:255520/1‑150 (MQ=255) tGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGgt < 1:4229613/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGgt > 1:1007383/1‑150 (MQ=255) cGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTa < 2:3381246/150‑1 (MQ=255) gTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTaa > 1:4629294/1‑150 (MQ=255) aaaTAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGc > 2:1271900/1‑150 (MQ=255) aaaTAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGc > 2:2939589/1‑150 (MQ=255) ataatCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCaa > 1:675616/1‑150 (MQ=255) aatCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAATTTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAAc > 2:3243272/1‑150 (MQ=255) tCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAAccc > 2:1765367/1‑150 (MQ=255) tCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAAccc > 2:3001717/1‑150 (MQ=255) tCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAACAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTGGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAAccc > 2:1506726/1‑150 (MQ=255) cAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCg < 2:3256936/150‑1 (MQ=255) cAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCg < 1:604092/150‑1 (MQ=255) aGTTACATCAATGAGTCCTAACCGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGc < 2:939860/150‑1 (MQ=255) ttACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTa > 1:727856/1‑150 (MQ=255) tACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTAc < 2:436856/150‑1 (MQ=255) tACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTAc > 1:3995173/1‑150 (MQ=255) cATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGc > 2:3545332/1‑150 (MQ=255) aTCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCt > 2:1904223/1‑150 (MQ=255) tCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGAACACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCtt > 1:5087168/1‑150 (MQ=255) cAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTg > 1:1958103/1‑150 (MQ=255) cAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTg < 1:1716438/150‑1 (MQ=255) gAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTAc < 1:762710/150‑1 (MQ=255) aGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAACAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACAGTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGC‑TGTTACag < 1:58712/150‑1 (MQ=255) ccTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACagag > 2:3605960/1‑150 (MQ=255) aaaTCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATc < 1:1497010/150‑1 (MQ=255) aaaTCCATCTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATc > 2:4419821/1‑150 (MQ=255) ccATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGc < 1:4875107/150‑1 (MQ=255) tgtgAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTc < 2:2631719/150‑1 (MQ=255) gtgAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGAGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTcc > 2:4840719/1‑150 (MQ=255) gAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCg < 2:4760912/150‑1 (MQ=255) aaGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGc > 1:2917099/1‑150 (MQ=255) aGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCt < 1:358511/150‑1 (MQ=255) gTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTc < 1:1244321/150‑1 (MQ=255) tGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTccc < 1:1473166/150‑1 (MQ=255) tGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTccc > 1:3791643/1‑150 (MQ=255) tCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCtt < 2:224621/150‑1 (MQ=255) tCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCtt > 1:1853437/1‑150 (MQ=255) | CGCTGGCAAACTGTCGCGCTGGGGATGCCACGACTCTGTTCAGCGCAGCGTCTGGCGGGGGCAATGCTCGAGGAAATCTTCTCTGTAAATTTGGCGTAAATAATCAGTTACATCAATGAGTCCTAAACGAAATCCATGTGTGAAGTTGATCACAAATTTAAACACTGGTAGGGTAAAAAGGTCATTAACTGCCCAATTCAGGCGTCAACTGGTTTGATTGTACATTCCTTAACCGGAGGGTGTAAGCAAACCCGCTACGCTTGTTACAGAGATTGCATCCTGCAATTCCCGCTCCCCTT > CP009273/4319957‑4320255 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |