Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,373,522 | C→T | 5.0% | intergenic (+85/‑134) | epmA → / → yjeM | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase/putative transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,373,522 | 0 | C | T | 5.0% | 1203.9 / 34.8 | 319 | intergenic (+85/‑134) | epmA/yjeM | Elongation Factor P Lys34 lysyltransferase/putative transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (175/128); new base T (5/11); total (180/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
TGATGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACGATAA > CP009273/4373373‑4373671 | tGATGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGc < 2:4852638/150‑1 (MQ=255) tGATGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGc > 2:3652604/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCcac > 1:784322/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACaa < 2:328949/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAAt > 1:3696101/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAAt < 1:2468655/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTa < 1:1605395/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGa > 1:394716/1‑150 (MQ=255) gggCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGAc > 1:2781747/1‑150 (MQ=255) gggCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGAc < 2:3013464/150‑1 (MQ=255) gagaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGatat < 1:362781/150‑1 (MQ=255) gaCACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATAttt < 2:5109551/150‑1 (MQ=255) cacTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGa > 1:5098242/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGata < 2:4812706/150‑1 (MQ=255) ggCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATatc > 1:4389066/1‑150 (MQ=255) cTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATatcat > 1:77476/1‑150 (MQ=255) aaGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCa < 1:226387/150‑1 (MQ=255) aaGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCa < 1:1701243/150‑1 (MQ=255) aGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAg > 2:506351/1‑150 (MQ=255) gTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAgg < 2:1208749/150‑1 (MQ=255) gTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAgg < 1:3540279/150‑1 (MQ=255) tCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGt < 1:4932140/150‑1 (MQ=255) cATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTa < 2:1863534/150‑1 (MQ=255) aTCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTAt < 2:821460/150‑1 (MQ=255) aTCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTAt < 2:4270438/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATc < 2:1400506/150‑1 (MQ=255) gCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCaa > 1:4149792/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCt < 1:3083467/150‑1 (MQ=255) ttAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCt > 2:2130960/1‑150 (MQ=255) aGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGt < 2:2384006/150‑1 (MQ=255) cGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTAt > 2:160010/1‑150 (MQ=255) ttGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTg < 1:3575244/150‑1 (MQ=255) gtGACCGGGCATAATTCGGAAAAATGACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTg < 2:4880679/149‑1 (MQ=255) gACCGGGCATATTTCTGACAAATTACTGATTTAACATCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCAACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGt < 2:4089171/150‑1 (MQ=255) ccGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGttt < 1:3260076/150‑1 (MQ=255) cGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACACTTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGtttt > 2:4984879/1‑150 (MQ=255) gCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTAc < 2:2751785/150‑1 (MQ=255) gCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTAc > 1:115083/1‑150 (MQ=255) aTAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGc > 1:593315/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctg > 1:4313743/1‑150 (MQ=255) aTTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctgc > 1:4486566/1‑150 (MQ=255) tCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctgcct < 1:3386634/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTAATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGctgcctg > 1:2435798/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTc < 1:2948991/150‑1 (MQ=255) aaaTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCaa > 1:1165994/1‑150 (MQ=255) aTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATg < 1:4790934/150‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATg < 1:2203008/150‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATg < 2:4391869/150‑1 (MQ=255) tACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGtt > 1:1028852/1‑150 (MQ=255) tACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGtt > 2:581155/1‑150 (MQ=255) aCTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTg > 2:4942875/1‑150 (MQ=255) tAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtg > 1:553792/1‑150 (MQ=255) aCAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtgca > 1:1278502/1‑150 (MQ=255) aCAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtgca < 2:3718097/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtgca > 1:3278242/1‑150 (MQ=255) aCAGAGAAGAATGGCGTGATAAGCGACATTCTGTATCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACTATTTAAGACTGGATATTTGCTATCATCAAGGTATGAATTATGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcattgca < 2:1145801/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCgcagtgcag < 2:2308250/150‑1 (MQ=255) aagaaTGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAg > 1:2603637/1‑150 (MQ=255) aagaaTGGCGTGATAAGCGCCATTATGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTAGTGGTTTTTACGCTGCATGCTCAATGTATCGCAGTCCAGTTCAg > 1:4692940/1‑150 (MQ=255) gaaTGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGTCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTg < 2:1650658/150‑1 (MQ=255) aaTGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTgg > 1:3301566/1‑150 (MQ=255) gCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCAc < 1:1004514/150‑1 (MQ=255) cGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACg > 2:278535/1‑150 (MQ=255) gTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACgt > 2:3574620/1‑150 (MQ=255) gTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTAAGCTGCCTGCTCAATGTTGAGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACgt > 2:4205195/1‑150 (MQ=255) aTAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGtt > 2:2341268/1‑150 (MQ=255) aTAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGtt > 2:3470767/1‑150 (MQ=255) aGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTtata > 1:4203024/1‑150 (MQ=255) ccttCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGAGTTCGACAcgc > 1:446130/3‑150 (MQ=255) cATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACAcgc < 1:3149246/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACAcgcg > 1:516803/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACAcgcg > 1:2986160/1‑150 (MQ=255) tCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCt > 1:1476512/1‑150 (MQ=255) tGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGa > 2:2208870/1‑150 (MQ=255) tAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGaaa > 1:1990020/1‑150 (MQ=255) aGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAAt > 2:3896134/1‑150 (MQ=255) cATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGa > 2:4708335/1‑150 (MQ=255) cATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGa < 2:1427437/150‑1 (MQ=255) tatGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAg < 1:2289505/150‑1 (MQ=255) tGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGa < 2:2250692/150‑1 (MQ=255) gTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGAt > 2:3003895/1‑150 (MQ=255) gTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGAt < 2:1030869/150‑1 (MQ=255) ttttCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACTCGCTGAAATGAAGGATg > 2:13731/1‑150 (MQ=255) tttCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATgg > 2:1747235/1‑150 (MQ=255) cATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGttt > 2:2527364/1‑150 (MQ=255) cATTTGTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGAGATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGttt < 2:8801/150‑1 (MQ=255) tttttCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCa > 1:1576100/1‑150 (MQ=255) ttttCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCAt < 2:3912644/150‑1 (MQ=255) ttCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATga < 2:4054408/150‑2 (MQ=255) cGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTc > 2:307575/1‑150 (MQ=255) gTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTca > 1:720904/1‑150 (MQ=255) gTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTca > 1:4499262/1‑150 (MQ=255) gTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTca > 1:3809684/1‑150 (MQ=255) ttAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTcac < 1:4441639/150‑1 (MQ=255) tAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTcaca > 1:1490786/1‑150 (MQ=255) aaaGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCacac < 2:1540582/150‑1 (MQ=255) aaaGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCacac > 1:5001530/1‑150 (MQ=255) aaGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACg > 2:650409/1‑150 (MQ=255) aGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACGa > 1:1331176/1‑150 (MQ=255) ccACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACGATaa < 1:2339045/150‑1 (MQ=255) | TGATGTTGGCGCTGGGCGCGGAGACACTGGCTGAAGTCATCGCCTTTAGCGTTGACCGGGCATAATTCTGAAAAATTACTGAATTAACAGCGAAGAATGGCGTGATAAGCGCCATTCTGTAGCATATGTTTTCATTTTTCCGTTAAAGGCCACAATTTAAGACTGGATATTTGATATCATCCAGGTATCAATTCTGTATTGGTTTTTACGCTGCCTGCTCAATGTTGCGCAGTGCAGTTCAGTGGGCACGTGTTATACACGCGCTGAAATGAAGGATGGTTTCATGCCTCACACGATAA > CP009273/4373373‑4373671 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |