| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 423,068 | C→A | 17.0% | A109E (GCG→GAG) | yajC → | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 423,068 | 0 | C | A | 17.0% | 1048.9 / 144.3 | 344 | A109E (GCG→GAG) | yajC | SecYEG protein translocase auxillary subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (125/160); new base A (31/28); total (156/188) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 352 total aligned reads displayed.
TGATGAAGTTCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACT > CP009273/422919‑423216 | gaAGTTCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTg > 1:1646945/1‑150 (MQ=255) aaGTTCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGt > 1:3400169/1‑150 (MQ=255) aGTTCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTa < 2:5026763/150‑1 (MQ=255) aGTTCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTa < 2:857682/150‑1 (MQ=255) ttCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAAt < 1:369204/150‑1 (MQ=255) tCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAAtt < 2:2093055/150‑1 (MQ=255) tGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTaa > 2:3203210/1‑150 (MQ=255) gACGAACGGTGGCCTGGGTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTaaa < 1:4006302/150‑1 (MQ=255) gAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATAAAAAtt > 1:4111920/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTCATTAAAAttttt > 2:1279374/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAAttttt < 1:1872446/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAAttttt > 1:3273143/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAAttttt > 1:3585621/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTc > 2:3916504/1‑150 (MQ=255) ggTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTc < 2:3480449/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTc < 1:2249304/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCt > 1:1212946/1‑150 (MQ=255) tggttggtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAgg < 2:2480260/150‑1 (MQ=255) ggttggtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAggg < 1:4633372/150‑1 (MQ=255) ggttggtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAggg > 1:696980/1‑150 (MQ=255) gttggtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGa < 2:4418140/150‑1 (MQ=255) gtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTg < 1:3541303/150‑1 (MQ=255) gtCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTg < 2:764218/150‑1 (MQ=255) cgTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCgt < 2:2575133/150‑1 (MQ=255) tAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCgtgt < 1:1551637/150‑1 (MQ=255) aaCCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGtt > 1:4368509/1‑150 (MQ=255) aCCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa < 1:1914644/150‑1 (MQ=255) aCCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTa < 2:4248012/150‑1 (MQ=255) ccAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTaa < 1:2573620/150‑1 (MQ=255) cAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTaaa > 2:4833537/1‑150 (MQ=255) aaaGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAAc < 1:3061050/150‑1 (MQ=255) aaaGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAAc < 1:4946016/150‑1 (MQ=255) aaaGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAAc < 2:2808665/150‑1 (MQ=255) aaaGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAAc > 1:2899291/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAGTGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAAcc < 2:1810497/150‑1 (MQ=255) aaGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAAcc < 1:285266/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGt < 1:1040836/150‑1 (MQ=255) aGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTa < 1:4667581/150‑1 (MQ=255) ggAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATcc > 1:2035202/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTtg < 2:3181305/150‑1 (MQ=255) aaCGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTtg > 1:507575/1‑150 (MQ=255) cGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTtgtg > 1:5111923/1‑150 (MQ=255) cTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGaa < 1:1361933/150‑1 (MQ=255) ttGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACg < 1:2281828/150‑1 (MQ=255) ttGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACg < 1:4409546/150‑1 (MQ=255) gCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTc > 1:3222959/1‑150 (MQ=255) cTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCa < 1:3074827/150‑1 (MQ=255) aTCGCGCTGAAGGACACCTCTGCAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATg < 2:3528414/150‑1 (MQ=255) tCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGc > 1:1985681/1‑150 (MQ=255) cgcgCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCt < 2:4603360/150‑1 (MQ=255) cgcgCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCAGGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGACTTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCt > 1:3898931/1‑150 (MQ=255) cgcTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGa < 1:100459/150‑1 (MQ=255) cTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATc < 2:245845/150‑1 (MQ=255) gAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCgt < 1:3547452/150‑1 (MQ=255) aaTGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCgtg > 2:4023210/1‑150 (MQ=255) aaTGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCgtg > 2:2044584/1‑150 (MQ=255) gACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCAGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCgtggtg < 2:1358444/150‑1 (MQ=255) ccacTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTg > 2:11291/1‑150 (MQ=255) cacTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGt > 2:5118430/1‑150 (MQ=255) acTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTc < 2:3013045/150‑1 (MQ=255) gAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATc < 1:2478711/150‑1 (MQ=255) agtagtTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCgg < 1:3778631/150‑1 (MQ=255) gtagtTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGt < 2:3852705/150‑1 (MQ=255) gtTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTctg > 2:1592052/1‑150 (MQ=255) tattaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTctgct < 1:4841135/150‑1 (MQ=255) attaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTctgctg > 2:3914681/1‑150 (MQ=255) ttaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGt > 2:4134224/1‑150 (MQ=255) ttaAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGt > 1:920504/1‑150 (MQ=255) aaaCGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTAt < 2:3051893/150‑1 (MQ=255) aaaCGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTAt < 1:2762589/150‑1 (MQ=255) aaaCGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTAt < 2:2742744/150‑1 (MQ=255) aCGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATgc < 1:349015/150‑1 (MQ=255) tGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCt > 1:3108847/1‑150 (MQ=255) tGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCt > 1:759138/1‑150 (MQ=255) cTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGACTTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTcc > 2:2375653/1‑150 (MQ=255) ttCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTccc > 1:1705767/1‑150 (MQ=255) tCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCa > 2:1958899/1‑150 (MQ=255) cGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCaa > 2:338037/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAAc > 2:2259164/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAAc > 1:2148926/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAAc > 2:3770686/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAAc < 2:2845669/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCt > 1:3525942/1‑150 (MQ=255) aGCTGCCGTCCAGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTATGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCt > 1:3453787/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTg < 1:1167602/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGtt > 1:4208078/1‑150 (MQ=255) gCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGttt < 1:785554/150‑1 (MQ=255) ccGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTg < 2:3607467/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGa > 1:554641/1‑150 (MQ=255) cTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAg > 1:1440974/1‑150 (MQ=255) ccGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGAt > 1:3426543/1‑150 (MQ=255) ggCACCAGGCAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAAGTGCCGTGTTCCACCGGGATCCTTTGTGGAAGTACGACATGCGGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCt < 2:1742478/150‑1 (MQ=255) ccATGAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTc < 1:933766/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGa < 1:4301759/150‑1 (MQ=255) tGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGa < 1:4042275/150‑1 (MQ=255) gAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGAt < 1:676533/150‑1 (MQ=255) gAAGGAGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGAt < 2:2901984/150‑1 (MQ=255) aaGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATc < 1:1495302/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGACGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCa > 2:1685219/1‑150 (MQ=255) gcgcTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACt > 2:804845/1‑150 (MQ=255) | TGATGAAGTTCTGACGAACGGTGGCCTGGTTGGTCGCGTAACCAAAGTAGCGGAAAACGGCTACATTGCTATCGCGCTGAATGACACCACTGAAGTAGTTATTAAACGTGACTTCGTAGCTGCCGTCCTGCCGAAAGGCACCATGAAGGCGCTGTAATTAAAATTTTTCCCTAAGGGAATTGCCGTGTTAAACCGTTATCCTTTGTGGAAGTACGTCATGCTGATCGTGGTGATTGTCATCGGTCTGCTGTATGCGCTTCCCAACCTGTTTGGTGAGGATCCGGCTGTTCAGATCACT > CP009273/422919‑423216 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |