| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,468,165 | A→G | 93.7% | intergenic (‑37/‑125) | argI ← / → rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,468,165 | 0 | A | G | 93.7% | 987.8 / 37.5 | 271 | intergenic (‑37/‑125) | argI/rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (6/11); new base G (125/129); total (131/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGGA > CP009273/4468020‑4468312 | cGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGCATTAAAGTTCa > 2:3121569/1‑150 (MQ=255)cGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCa > 1:3324226/1‑150 (MQ=255) gCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCaa < 2:3847006/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 2:4221097/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 1:4954225/150‑1 (MQ=255) ttttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAtt < 2:5004494/150‑1 (MQ=255) tttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAttt < 1:3191575/150‑1 (MQ=255) tCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtat < 1:1019139/150‑1 (MQ=255) tCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtat < 2:3572904/150‑1 (MQ=255) ttATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTatat < 2:604552/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATgg > 2:3565549/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATgg > 1:302593/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat > 1:1848232/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat < 1:1960083/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat < 2:1128818/150‑1 (MQ=255) cTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatgat < 2:227747/150‑1 (MQ=255) tttCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGatt < 1:2586746/150‑1 (MQ=255) tCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattat > 1:5036500/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc < 1:2088233/150‑1 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc > 1:2418584/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc > 1:1549619/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCAtt > 1:3947747/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 1:4686829/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 1:1706686/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 1:1362914/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGATGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 1:2845123/150‑1 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa < 2:2557422/150‑1 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa > 1:3111642/1‑150 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa < 1:1441415/150‑1 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa > 1:4217256/1‑150 (MQ=255) gCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATAGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAg < 2:2954715/150‑1 (MQ=255) cTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGt < 1:2883566/150‑1 (MQ=255) aaCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCt > 1:4312514/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaa > 1:3832078/1‑150 (MQ=255) cTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaa < 2:4446563/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaa < 2:2399398/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaa < 2:2228403/150‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTaaa < 1:3858538/150‑1 (MQ=255) gcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCAt < 1:4741190/150‑1 (MQ=255) agGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATaa < 2:153614/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAAt < 1:2256461/150‑1 (MQ=255) cTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATc < 2:1976635/150‑1 (MQ=255) tGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCt < 2:2678137/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCttt < 2:3009030/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCttt < 2:4113257/150‑1 (MQ=255) gAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATGCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGt > 2:1419599/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTca > 1:2965507/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTca < 2:3359939/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTcac > 1:1171515/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTcaca > 2:5064326/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACaa < 1:665165/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAg < 1:1541703/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGt > 2:2747443/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATACATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGt > 2:2736571/1‑150 (MQ=255) ggCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTg > 1:1375170/1‑150 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg < 2:2642702/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt > 1:2200871/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt < 1:1636369/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt > 1:342910/1‑150 (MQ=255) cGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGt > 1:4243740/1‑150 (MQ=255) aGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCa > 2:4866555/1‑150 (MQ=255) tttCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtggt > 2:303635/1‑150 (MQ=255) aGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtgt > 2:1377771/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGa > 1:88656/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGa > 1:4770821/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGAc > 1:3295366/1‑150 (MQ=255) cTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATaa > 2:2124306/1‑150 (MQ=255) tGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGt < 1:1429418/150‑1 (MQ=255) aaaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCg > 2:549776/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCgg > 2:1784921/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCgg > 1:2470387/1‑150 (MQ=255) aaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGc > 1:2043488/1‑150 (MQ=255) cGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGa > 1:2397210/1‑150 (MQ=255) cGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGa < 2:3838350/150‑1 (MQ=255) gACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACa < 1:5082054/150‑1 (MQ=255) aCATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAt > 1:2622519/1‑150 (MQ=255) aCATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAt > 2:852931/1‑150 (MQ=255) cATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAtt < 2:4485556/150‑1 (MQ=255) aTAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa > 1:3500385/1‑150 (MQ=255) aTAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa < 2:4299125/150‑1 (MQ=255) aTCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAagag > 2:2947480/1‑150 (MQ=255) aTCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAagag < 2:3296194/150‑1 (MQ=255) cccTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGa > 1:1050623/1‑150 (MQ=255) cctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGa > 1:2810405/1‑150 (MQ=255) tgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCa < 1:792713/150‑1 (MQ=255) ggCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAAGGAGCCAt > 2:7357/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCa > 1:4525201/1‑150 (MQ=255) aCGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaa < 2:1706054/150‑1 (MQ=255) cGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaaa > 1:3746476/1‑150 (MQ=255) cGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAAGAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaaa > 1:1111854/1‑150 (MQ=255) cAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCgg < 2:4700169/150‑1 (MQ=255) gAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaaca < 2:4937245/150‑1 (MQ=255) aaTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaa > 2:2841783/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTACAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac < 2:2883447/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac < 2:4023111/150‑1 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac > 2:517275/1‑150 (MQ=255) aTTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTAATCATATGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGTCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaacaac > 2:1276635/1‑150 (MQ=255) tAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTg > 2:4617487/1‑150 (MQ=255) aaagTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGACTGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTgg > 1:3786366/1‑150 (MQ=255) aaaTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGga < 2:4990017/150‑1 (MQ=255) | CGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGGA > CP009273/4468020‑4468312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |