| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 523,413 | G→T | 19.4% | pseudogene (6/708 nt) | rhsH → | pseudogene, Rhs familly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 523,413 | 0 | G | T | 19.4% | 915.2 / 156.9 | 324 | pseudogene (6/708 nt) | rhsH | pseudogene, Rhs familly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (160/101); new base T (28/35); total (188/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.62e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 333 total aligned reads displayed.
AAAACCATATTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGTACTACAACC > CP009273/523264‑523561 | aaCCATATTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGctct > 1:3958064/1‑150 (MQ=255) cATATTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTgat < 2:4899810/150‑1 (MQ=255) atatTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTgatg > 2:1143640/1‑150 (MQ=255) atatTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTgatg < 2:4018776/150‑1 (MQ=255) atatTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTgatg > 2:4280556/1‑150 (MQ=255) atatTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGAGGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTgatg > 2:3567464/1‑150 (MQ=255) ttAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTgatggatg > 1:3771218/1‑150 (MQ=255) tAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGc > 1:2742323/1‑150 (MQ=255) aaTTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCg > 1:4680522/1‑150 (MQ=255) aTTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCgg > 1:2179946/1‑150 (MQ=255) tACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGAt > 2:523403/1‑150 (MQ=255) cGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATgg > 1:1584288/1‑150 (MQ=255) ggAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGa > 1:592776/1‑150 (MQ=255) tACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACAt > 1:2966712/1‑150 (MQ=255) ccAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTg < 2:2328492/150‑1 (MQ=255) aGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGa > 1:2155057/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAg > 1:3480583/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCg < 1:4403347/150‑1 (MQ=255) gAGGGAGCACAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTatg < 2:3840406/150‑1 (MQ=255) gggAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGTATGCGGATGGAAACATTGAGTGGAGCGGGGAGTatgat > 2:2454178/1‑150 (MQ=255) ggAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTatgatg > 1:4887796/1‑150 (MQ=255) gAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTAtgatga > 2:3674584/1‑150 (MQ=255) aGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAg < 1:1272125/150‑1 (MQ=255) gCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGt > 1:5096165/1‑150 (MQ=255) cAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTg > 1:2044826/1‑150 (MQ=255) cAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTg > 1:1773982/1‑150 (MQ=255) aaaGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTgg > 1:3580945/1‑150 (MQ=255) aaGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCATACATAGTAAATAATTCTGGCGCTGATGTATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTggg > 1:3385926/1‑150 (MQ=255) aGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTgggg < 2:4957251/150‑1 (MQ=255) aCCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAAc < 2:2694895/150‑1 (MQ=255) cTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCa > 1:1196921/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCt < 2:3207493/150‑1 (MQ=255) aTGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCt > 2:4589194/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCtg > 2:1665178/1‑150 (MQ=255) tGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCtg < 1:4544280/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCtgaat < 1:288799/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCtgaat > 2:1734226/1‑150 (MQ=255) aGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCtgaat < 2:2581645/150‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGAGGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCtgaatg > 2:620450/1‑150 (MQ=255) gggTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAagag > 2:3492488/1‑150 (MQ=255) gggTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGAAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGAATGATGAGTGGGGCAACCAGCAGAATGAagag > 2:3713273/1‑150 (MQ=255) ggtggtGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAgaga > 1:1561494/1‑150 (MQ=255) tggtgTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAAc > 1:2836056/1‑150 (MQ=255) ggtgTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAAcc > 2:263117/1‑150 (MQ=255) gtgtATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAAccc < 1:3610693/150‑1 (MQ=255) tgtATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCg < 2:3342440/150‑1 (MQ=255) atttattATAGAAATTAATAAGAAAAATGGAGGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCAt < 2:3057802/150‑1 (MQ=255) attatAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCAcc < 1:1610239/150‑1 (MQ=255) ttatAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCt > 2:912962/1‑150 (MQ=255) taGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCa > 1:703071/1‑150 (MQ=255) aaaTTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCa > 1:2752832/1‑150 (MQ=255) aTTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGc > 2:127215/1‑150 (MQ=255) aataaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGt > 2:4671696/1‑150 (MQ=255) aataaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGt > 2:238874/1‑150 (MQ=255) ataaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTa > 1:758018/1‑150 (MQ=255) ataaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTa < 2:4149780/150‑1 (MQ=255) taaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTAc > 2:772344/1‑150 (MQ=255) aaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTAcc < 1:4602848/150‑1 (MQ=255) aaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGACCCCGCATCACCTGCACCAGCCGTAcc > 1:2246515/1‑150 (MQ=255) aaGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTAcc > 1:407351/1‑150 (MQ=255) aGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCg < 2:1907620/150‑1 (MQ=255) aGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCg < 1:863149/150‑1 (MQ=255) aGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCg < 1:4808676/150‑1 (MQ=255) gAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCgg > 1:3055073/1‑150 (MQ=255) gAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCgg > 1:5003727/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCt > 2:1401978/1‑150 (MQ=255) aaaaTGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCt < 2:2408267/150‑1 (MQ=255) aaaaTGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCt < 2:2502116/150‑1 (MQ=255) aaaTGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTg < 2:568873/150‑1 (MQ=255) aTGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGcc < 1:1354842/150‑1 (MQ=255) gATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCggg > 2:3913955/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCgggg > 1:1797986/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCgggg < 2:2069630/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGgc < 1:1950995/150‑1 (MQ=255) tgtgTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGgc < 1:2344003/150‑1 (MQ=255) tgtTTTGAATTTCCTACCTAGTAAATAATGCTGGCGCTGCTGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGgcag < 2:1453475/150‑1 (MQ=255) tgtTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGgcag < 1:1558513/150‑1 (MQ=255) tgtTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGgcag < 1:4718306/150‑1 (MQ=255) tttGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGcagcag < 2:2436906/150‑1 (MQ=255) gAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTAt > 1:1373294/1‑150 (MQ=255) aaTTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATg < 2:1984239/150‑1 (MQ=255) aaTTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATg < 1:2639913/150‑1 (MQ=255) aaTTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATg > 1:2570617/1‑150 (MQ=255) tCCTACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATaa > 2:4644373/1‑150 (MQ=255) tCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATaa > 1:978637/1‑150 (MQ=255) cTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAgg > 1:3175130/1‑150 (MQ=255) tACATAGTAAATAATGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGa > 2:2144586/1‑150 (MQ=255) tACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGa > 1:4113093/1‑150 (MQ=255) aCATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAg < 1:4236987/150‑1 (MQ=255) aCATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAg > 2:2239519/1‑150 (MQ=255) aTAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTc > 2:85537/1‑150 (MQ=255) aGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCgg > 2:4981078/1‑150 (MQ=255) aaaTAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGc > 2:1836617/1‑150 (MQ=255) aataatGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCt > 2:3899655/1‑150 (MQ=255) ataatGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTg > 2:2785645/1‑150 (MQ=255) atGCTGGCTCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGtac > 1:1997020/1‑150 (MQ=255) atGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGtac > 1:3345706/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGtact < 2:3596782/150‑1 (MQ=255) gcgggCGCTGATGGATGCGGCTGGACACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGtacta < 1:3864619/147‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGtactac > 2:3574762/1‑150 (MQ=255) | AAAACCATATTTAATTACGGAACTACCAGATAGTTGGGTTGTTGAGGGAGCAAAGTTACCTTATGAAGTTGCGGGTGGTGTATTTATTATAGAAATTAATAAGAAAAATGGATGTGTTTTGAATTTCCTACATAGTAAATAATGCTGGCGCTGATGGATGCGGATGGAAACATTGCGTGGAGCGGGGAGTATGATGAGTGGGGCAACCAGCTGAATGAAGAGAACCCGCATCACCTGCACCAGCCGTACCGGCTGCCGGGGCAGCAGTATGATAAGGAGTCGGGGCTGTACTACAACC > CP009273/523264‑523561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |