| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 566,230 | C→T | 5.5% | intergenic (+346/‑119) | ybcK → / → ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 566,230 | 0 | C | T | 5.5% | 1091.6 / 34.2 | 293 | intergenic (+346/‑119) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (149/128); new base T (12/4); total (161/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
TGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCAACTGTATTGG > CP009273/566081‑566379 | aaaaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCaa < 1:3884642/150‑1 (MQ=255) aaaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCaaa < 1:4957014/150‑1 (MQ=255) aaaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCaaa > 1:617088/1‑150 (MQ=255) aaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTAGTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGGTTTGTGTATATTGTGGTaatt > 1:3532875/1‑148 (MQ=255) aaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAaat < 1:1096552/150‑1 (MQ=255) aaTACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAaat < 2:3451832/150‑1 (MQ=255) aCGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAaataat < 1:1170038/150‑1 (MQ=255) aCGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAaataat < 1:1251134/150‑1 (MQ=255) aCGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAaataat > 2:4110863/1‑150 (MQ=255) cGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAtt < 2:4818499/150‑1 (MQ=255) gTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttg > 2:3995303/1‑150 (MQ=255) gTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttg > 1:156120/1‑150 (MQ=255) gTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttg < 1:3922975/150‑1 (MQ=255) tGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgg > 2:304253/1‑150 (MQ=255) aCAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgggt > 1:701303/1‑150 (MQ=255) aCAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAAttgggt > 1:2692467/1‑150 (MQ=255) tatGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTAc < 2:1970631/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACaa > 2:760156/1‑150 (MQ=255) gAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAAt > 2:96891/1‑150 (MQ=255) gAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAAt > 1:3028583/1‑150 (MQ=255) aGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAAtt < 1:536121/150‑1 (MQ=255) cAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATtgt < 1:331804/150‑1 (MQ=255) aaaaTGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATtgtg < 2:4335747/150‑1 (MQ=255) ataTGGTGTATGTCACTTATTTTGAATGGTAGGTTAAATAATAACACCGACTGTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGa < 2:1747143/148‑1 (MQ=255) aTGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGAtt > 1:64527/1‑150 (MQ=255) aTGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGAtt < 1:2177343/150‑1 (MQ=255) tGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTg < 2:2190375/150‑1 (MQ=255) tGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTg < 2:917480/150‑1 (MQ=255) ggTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGc > 2:705292/1‑150 (MQ=255) tgtATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCtt < 2:1003115/150‑1 (MQ=255) gtATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCttt > 1:809594/1‑150 (MQ=255) cGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGaa > 2:3294845/1‑150 (MQ=255) gTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAAc > 2:4932868/1‑150 (MQ=255) tATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACa > 2:5110216/1‑150 (MQ=255) aTTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACAt < 2:2817302/150‑1 (MQ=255) tttGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTg > 1:3685029/1‑150 (MQ=255) gAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATAAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTgcgc > 2:3652301/1‑150 (MQ=255) gAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATAAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTGTTGCATGAACAGTgcgc > 2:3652406/1‑150 (MQ=255) aaTGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGcc < 2:1224190/150‑1 (MQ=255) tGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGTAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCtt > 2:1518931/1‑150 (MQ=255) tAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTAt > 1:2351232/1‑150 (MQ=255) tAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTAt > 1:4895357/1‑150 (MQ=255) aGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATg < 2:4658747/150‑1 (MQ=255) tAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGTAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATa < 1:2551595/150‑1 (MQ=255) aaaaTAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATg < 1:224394/150‑1 (MQ=255) aaTAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATgag > 1:2157136/1‑150 (MQ=255) aTAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATgaga > 1:2655245/1‑150 (MQ=255) tAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGAt > 1:4484737/1‑150 (MQ=255) aaCACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATa < 2:4972720/150‑1 (MQ=255) acacCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATaa < 2:4588969/150‑1 (MQ=255) acCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAg < 2:2960056/150‑1 (MQ=255) ccGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAgg < 1:1546682/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAata < 2:4809275/150‑1 (MQ=255) tttCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGCGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAatat < 2:4127585/150‑1 (MQ=255) tttCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGTAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGAAatat > 2:3888363/1‑150 (MQ=255) tttCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAatat < 2:3818936/150‑1 (MQ=255) tttCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAatat > 1:1764589/1‑150 (MQ=255) tttCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAatat > 2:1434514/1‑150 (MQ=255) tCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCa > 2:1586746/1‑150 (MQ=255) gTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaa > 1:4381121/1‑150 (MQ=255) gTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaa < 2:155285/150‑1 (MQ=255) gTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaa > 1:390198/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaata > 1:4250782/1‑150 (MQ=255) gtgtTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaataaa > 2:373437/1‑150 (MQ=255) tgtTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaataaaa > 1:327726/1‑150 (MQ=255) ttACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCaaataaaata < 1:1405251/150‑1 (MQ=255) cTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGTAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGAAATATCAAATAAAATAACg > 1:2111279/1‑150 (MQ=255) taataaAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGTATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAg > 2:4538446/1‑150 (MQ=255) taataaAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAg < 1:4471162/150‑1 (MQ=255) aataaAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAgg > 1:2818223/1‑150 (MQ=255) ataaAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGt > 2:4262825/1‑150 (MQ=255) ataaAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGt > 2:815339/1‑150 (MQ=255) taaAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTc < 1:3292655/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCa > 2:1476714/1‑150 (MQ=255) cAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAAc > 1:4429149/1‑150 (MQ=255) agagTTTTTAGATAGTAACAATGTTCTTTGTGTATATTGTGGCAAAAAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATAGCTTTTGCATGAACATAGCGCCTTTATTCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAAAGAAACGACATAACa > 2:4406715/1‑150 (MQ=255) tttAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTAGGGGGAACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAgg < 1:5138562/150‑1 (MQ=255) gATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGtttt < 1:3162005/150‑1 (MQ=255) gATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGtttt > 2:3176479/1‑150 (MQ=255) aTAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGttttt < 1:4449650/150‑1 (MQ=255) tAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTa < 1:1306745/150‑1 (MQ=255) tAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTa > 1:3432929/1‑150 (MQ=255) aTCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGaa > 1:4307608/1‑150 (MQ=255) cAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGTAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGAAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGaaaa > 1:2049641/1‑150 (MQ=255) cAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGaaaa > 2:2104734/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAacac > 1:241187/1‑150 (MQ=255) gtgCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACt > 1:1598958/1‑150 (MQ=255) cTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTAt > 2:2685363/1‑150 (MQ=255) tttGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATc > 1:3716361/1‑150 (MQ=255) tttGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATc < 1:383485/150‑1 (MQ=255) ttGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCg > 1:1464280/1‑150 (MQ=255) tgtgTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGt > 2:4044090/1‑150 (MQ=255) gtgtATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGtt > 2:3535131/1‑150 (MQ=255) tgtATATTGTGGCAAATAATTGTGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGttt < 2:1061071/150‑1 (MQ=255) gtATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTc > 2:2326479/1‑150 (MQ=255) tataTTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCa < 2:4882523/150‑1 (MQ=255) atatTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCaa > 2:620105/1‑150 (MQ=255) atatTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCaa > 2:1848479/1‑150 (MQ=255) tgtgGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCAACTGt > 1:1343356/1‑150 (MQ=255) tgtgGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCAACTGt < 1:1881573/150‑1 (MQ=255) | TGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATAAAATAACGATAGGTCATAACAAAGAGGTTTTTATGAAAACACTTATCGTTTCAACTGTATTGG > CP009273/566081‑566379 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |