| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 69,367 | C→A | 9.1% | M16I (ATG→ATT) | thiQ ← | thiamine, thiamine pyrophosphate ABC transporter ATPase; ThiBPQ thiamine, thiamine pyrophosphate importer |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 69,367 | 0 | C | A | 9.1% | 1332.4 / 66.8 | 359 | M16I (ATG→ATT) | thiQ | thiamine, thiamine pyrophosphate ABC transporter ATPase; ThiBPQ thiamine, thiamine pyrophosphate importer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (151/175); new base A (24/9); total (175/184) | |||||||||||
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Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
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aaaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGcc > 2:45961/1‑150 (MQ=255) cATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGAAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCAAttt > 1:563427/1‑150 (MQ=255) | ATAGTTGTGTGATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCAATTT > CP009273/69218‑69516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |