| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 816,152 | 0 | C | A | 16.4% | 910.7 / 117.8 | 298 | intergenic (+108/‑97) | ybhL/ybhM | UPF0005 family inner membrane protein/UPF0005 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (90/159); new base A (25/24); total (115/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.55e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CTGTTCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGTTTTCTGTATCCATAAATGCAAAAGTATTTTGTATGCGTGGTTTTAAATTTATTGATGGTGAATATTAATATTTTTTCTAAGGATAACTAAAAGAATGGAATCATACTCGCAAAACAGCAATAAATTAGATTTTCAGCACGAGGCCAG > CP009273/816003‑816301 | ttCCTGCTGTTGTTGCGTATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCTTGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGCGtt < 1:3029626/150‑1 (MQ=255) ttCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGAGtt > 2:1141323/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATGTTGTTGCGGATCTTCGGCAACCGCCGTTAATTCTTTTTCACCATCACTATCCCGGCCATGTGTCGGGATTTTTTTCTTACTAAAAACGACACTTAACAAGTACCAGGTATAAAATATGCCTTATGGACGAGCGGAAGAGtt < 1:2975292/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |