Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,194,194 | C→A | 21.6% | S15* (TCA→TAA) | lit → | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,194,194 | 0 | C | A | 21.6% | 408.3 / 85.8 | 156 | S15* (TCA→TAA) | lit | e14 prophage; cell death peptidase, inhibitor of T4 late gene expression |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/70); new base A (16/18); total (68/88) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
ATGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACA > CP009273/1194046‑1194342 | aTGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATtcatca < 1:2999745/150‑1 (MQ=255) aaTTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTaa > 1:3809794/1‑150 (MQ=255) aaTTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTaa > 1:200564/1‑150 (MQ=255) ttCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGa < 2:2849152/150‑1 (MQ=255) tCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGAt < 2:1199686/150‑1 (MQ=255) tCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGAt < 2:1199275/150‑1 (MQ=255) tCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGAt > 2:27815/1‑150 (MQ=255) cATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGAtt > 1:2694482/1‑150 (MQ=255) tACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCa > 2:3298514/1‑150 (MQ=255) cATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCag < 1:3876831/150‑1 (MQ=255) tataGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCagag < 1:3031634/150‑1 (MQ=255) tataGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCagag < 1:2198415/150‑1 (MQ=255) tataGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCagag < 2:4762418/150‑1 (MQ=255) ataGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAgaga > 1:3125242/1‑150 (MQ=255) taGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGaa > 2:4305122/1‑150 (MQ=255) gTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAgg < 2:2180473/150‑1 (MQ=255) tATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGa < 2:8566/150‑1 (MQ=255) tATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGa < 2:749389/150‑1 (MQ=255) tCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGc < 1:2727114/150‑1 (MQ=255) gAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCaa > 1:1793424/1‑150 (MQ=255) aaCATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAg > 1:3245838/1‑150 (MQ=255) aTAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATc < 1:4519098/150‑1 (MQ=255) aGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCtt < 2:2074897/150‑1 (MQ=255) aGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCtt < 2:209396/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa > 1:2999390/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa < 2:4646391/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa < 1:3137750/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa < 1:3137868/150‑1 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa > 1:2469339/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCTGAAGAGTCATCTTATTGTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaa < 2:2688595/150‑1 (MQ=255) aaaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaaa > 2:1188247/1‑150 (MQ=255) aaaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTaaaa > 1:578790/1‑150 (MQ=255) aaaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAAc > 1:1685143/1‑150 (MQ=255) aaCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACg > 2:4414766/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGa > 1:915574/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGa > 1:915563/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGa > 1:645280/1‑150 (MQ=255) tGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATa < 1:2457746/150‑1 (MQ=255) tGAAGATTCATCTTATTTTGTATAGACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATa < 2:3538129/150‑1 (MQ=255) aaGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGt > 1:1237881/1‑150 (MQ=255) gATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTg < 1:3379449/150‑1 (MQ=255) aTTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTga > 1:3251903/1‑150 (MQ=255) tCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTgacg < 1:2313292/150‑1 (MQ=255) tCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTgacg < 2:3936607/150‑1 (MQ=255) cTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaa < 2:2663997/150‑1 (MQ=255) cTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaa < 2:2663754/150‑1 (MQ=255) cTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaa < 1:3036778/150‑1 (MQ=255) cTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaa < 1:3036777/150‑1 (MQ=255) cTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaa > 2:1331099/1‑150 (MQ=255) tATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaaaa < 2:779222/150‑1 (MQ=255) ttttGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaaaaaa > 2:1787659/1‑150 (MQ=255) tttGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACaaaaaaa > 2:2843318/1‑150 (MQ=255) tGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAAtt > 1:4078908/1‑150 (MQ=255) atataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATtata > 2:480871/1‑150 (MQ=255) atataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATtata > 2:480616/1‑150 (MQ=255) atataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAAAGAAAATTGGTCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCATCAATTTATTCATCACCCTTTAAGATTGCACCAGAGACGTAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAATTtata < 1:512862/150‑1 (MQ=255) tataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATaa > 2:2818491/1‑150 (MQ=255) tataCTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATGTAAGATTGCACCAGAGACGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACCAAAAAATtatac > 2:4035144/1‑149 (MQ=255) actacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAACAAATTATAAttt > 2:3191793/1‑150 (MQ=255) actacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATGTGTCATCTTTTCTCAGCCATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATCGTTGACGACAAAAAAATTATAAtgt > 2:3306013/1‑148 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc < 2:149145/150‑1 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc < 1:2766623/150‑1 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc > 1:1139873/1‑150 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc < 2:2878766/150‑1 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc < 1:1400920/150‑1 (MQ=255) ctacCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTc < 2:283286/150‑1 (MQ=255) cTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGtt > 1:2041535/1‑150 (MQ=255) cTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTAAGtt > 2:4632037/1‑150 (MQ=255) tAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTtg > 2:3013204/1‑150 (MQ=255) aGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTtgt < 1:3172902/150‑1 (MQ=255) gCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTtgtg < 2:3256505/150‑1 (MQ=255) caacaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagt > 1:2369183/1‑150 (MQ=255) caacaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagt > 1:4704646/1‑150 (MQ=255) acaaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTgtgagtga > 1:1306145/1‑150 (MQ=255) caaTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGaa > 1:4176130/1‑150 (MQ=255) aTGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAAcc < 1:493051/150‑1 (MQ=255) agGTTAAAGAAAAATGCGCTCAACAATTTGTCATCTTTTCTCATCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAAAGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGttt < 1:2095752/150‑1 (MQ=255) ggTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGtttt < 2:3246474/150‑1 (MQ=255) tAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAat > 2:1743396/1‑150 (MQ=255) cGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATGATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCGGGTTTTAATATc > 2:513397/1‑150 (MQ=255) tGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCa < 1:3554997/150‑1 (MQ=255) tCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaag < 2:4052458/150‑1 (MQ=255) tCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaag < 2:1376024/150‑1 (MQ=255) cACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGgaaga < 1:334129/150‑1 (MQ=255) ccAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAAt < 1:3459476/150‑1 (MQ=255) tGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGt < 1:1786599/150‑1 (MQ=255) tGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGt > 1:1155259/1‑150 (MQ=255) gTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGta < 2:318857/150‑1 (MQ=255) tCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGtaataa < 1:1282071/150‑1 (MQ=255) tttCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTc < 1:2132644/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTca < 1:1923277/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTca < 1:2581202/150‑1 (MQ=255) aGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGa < 2:3350321/150‑1 (MQ=255) cAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGaaa > 2:2406209/1‑150 (MQ=255) taattCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGt > 1:1982565/1‑150 (MQ=255) aattCATAACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGATGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGtt > 1:133032/1‑150 (MQ=255) ttCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCt < 1:4486544/150‑1 (MQ=255) tcatcaCCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTa > 2:254790/1‑150 (MQ=255) atcaCCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAAc < 2:1043781/150‑1 (MQ=255) tcaCCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACa < 2:3245838/150‑1 (MQ=255) | ATGTCGATAATTCATTACGCATATAGTATCGAACATAGAAAAAACTGAAGATTCATCTTATTTTGTATATACTACCTAGCCCAACAATGTAGAGGTTAACGAAAAATGCGCTCACCAATTTGTCATCTTTTCTCAGCAATTAATTCATCACCATTTAAGATTGCACCAGAGAAGGAGCAAGATCTTAAAACGATAGTTGACGACAAAAAAATTATAATTTCAGTTGTGAGTGAACCTGGTTTTAATATCCGAGTCAGGAAGAATGAGAGTAATAATTCACATGAAATAGTTCTAACA > CP009273/1194046‑1194342 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |