| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,204,620 | 0 | C | A | 13.6% | 654.0 / 57.7 | 199 | pseudogene (456/501 nt) | stfE | pseudogene, e14 prophage; side tail fiber protein fragment family;Phage or Prophage Related |
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Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
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aaTGCAATATTACGCGGACGAGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTAcc < 2:1239983/150‑1 (MQ=255) tGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCa > 2:3448872/1‑150 (MQ=255) atatTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATAtt < 1:584227/150‑1 (MQ=255) atTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtc < 2:2249685/150‑1 (MQ=255) tACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTtcat < 1:756407/150‑1 (MQ=255) 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gcgTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATAGa < 2:1173680/150‑1 (MQ=255) cgTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATAGaa > 2:1628582/1‑150 (MQ=255) | TTTGAAGTGGAAATATATTCCCGTGTTTCACCATCGTAGTTATAAACGGTAACATCCCCTGCCTTTGTTGCAATAAGGTCACTATTTAATATTGCTTTATGCATCAGGCTGCCCTCACGATATAGTTAAATGCAATATTACGCGGACGCGTTTCTGAGGCTGCGGCACCTAAACCATCCACTGATTGTTTATATGTTTTAAAGGTTCCATAATCCGGGGCTGGTAATCCGGCATCGTTTGTGTTTCCTCTTTTGATAATGTCAGTGCCACTATTTACCCATATTTCATCAAAATAGAA > CP009273/1204472‑1204769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |