Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,340,901 | A→T | 25.7% | S33S (TCT→TCA) | gmr ← | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase; csgD regulator; modulator of Rnase II stability |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,340,901 | 0 | A | T | 25.7% | 567.4 / 227.2 | 280 | S33S (TCT→TCA) | gmr | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase; csgD regulator; modulator of Rnase II stability |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (102/106); new base T (39/33); total (141/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 284 total aligned reads displayed.
TTTCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACA > CP009273/1340752‑1341050 | tttCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTa < 2:2988115/150‑1 (MQ=255) ttCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAg > 1:1289620/1‑150 (MQ=255) tCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGa < 1:3248555/150‑1 (MQ=255) tCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGa < 2:3570344/150‑1 (MQ=255) cGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCTTCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCTATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGaa < 1:2581335/150‑1 (MQ=255) ccTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAg < 2:3152288/150‑1 (MQ=255) tACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAgcg > 1:3904951/1‑150 (MQ=255) aCCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAgcgc > 2:1020283/1‑150 (MQ=255) ccAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCa > 1:1453658/1‑150 (MQ=255) cAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGAAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCaa > 2:111152/1‑150 (MQ=255) aGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCaaa > 2:1835075/1‑150 (MQ=255) gATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCaaaa > 1:515307/1‑150 (MQ=255) cacaGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATc > 1:4668611/1‑150 (MQ=255) acaGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCg < 1:1398981/150‑1 (MQ=255) caGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCgc > 1:1723068/1‑150 (MQ=255) caGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCgc < 1:1257924/150‑1 (MQ=255) aaaGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCgctgc < 2:2282728/150‑1 (MQ=255) aaGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCgctgct < 2:51734/150‑1 (MQ=255) aaGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCgctgct < 2:51359/150‑1 (MQ=255) tCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAAc > 1:2330418/1‑150 (MQ=255) cATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGATCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCTGGTTCTTTGGTTTAGGTGGTTGAAAAGCGCTAAACATCGCTGCTTTCCGTCAAcc < 1:4509061/150‑1 (MQ=255) aTCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCg > 2:4694113/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCg < 1:4555770/150‑1 (MQ=255) tCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGc > 1:3559564/1‑150 (MQ=255) cGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGcc > 2:2488159/1‑150 (MQ=255) aCGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAg < 2:3872535/150‑1 (MQ=255) tCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATg < 1:3384442/150‑1 (MQ=255) catcatcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATtgtg < 1:2808777/150‑1 (MQ=255) atcatcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGc > 2:3240138/1‑150 (MQ=255) catcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGa < 1:4940390/150‑1 (MQ=255) catcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGa < 1:747404/150‑1 (MQ=255) atcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGAt > 1:346010/1‑150 (MQ=255) atcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGAt > 2:778858/1‑150 (MQ=255) atcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGAt > 2:4825578/1‑150 (MQ=255) tcaGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATc > 2:419928/1‑150 (MQ=255) caGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATcc < 2:4445680/150‑1 (MQ=255) ggCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCga < 1:4792110/150‑1 (MQ=255) ggCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCga < 1:1459432/150‑1 (MQ=255) ggCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCga < 1:1610897/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCgag > 1:4626182/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCgag < 2:1126960/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCgaga > 1:229691/1‑150 (MQ=255) cTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCgaga > 1:1450508/1‑150 (MQ=255) tGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGaa > 1:4185388/1‑150 (MQ=255) tGGAGGTGATGACCGTCATGTCCCTGATGCGAGCAGCCTGGTCGGCAGATAACTGCTATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGaa < 2:4775863/150‑1 (MQ=255) gTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTg > 2:4938483/1‑150 (MQ=255) gatgaCCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTa > 1:3978068/1‑150 (MQ=255) gatgaCCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTa < 2:167440/150‑1 (MQ=255) atgaCCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTAc > 1:2009270/1‑150 (MQ=255) tgaCCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACa > 1:2900730/1‑150 (MQ=255) ccGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACg < 2:3271575/150‑1 (MQ=255) ccGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACg < 2:2145622/150‑1 (MQ=255) cGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGACAGTTGTACAACGt > 1:3800510/1‑150 (MQ=255) gTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGtt > 2:2788034/1‑150 (MQ=255) tCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTtg > 2:1974815/1‑150 (MQ=255) agttCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTtggg < 2:3481905/148‑3 (MQ=255) tttCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGACAGTTGTACAACGTTGTgg > 2:730795/1‑150 (MQ=255) ttCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGa < 2:4081698/150‑1 (MQ=255) cccTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGACAGTTGTACAACGTTGTGGACt > 2:860879/1‑150 (MQ=255) cccTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACt > 2:1804744/1‑150 (MQ=255) cccTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACt < 2:4326100/150‑1 (MQ=255) cTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTcc > 1:4313307/1‑150 (MQ=255) gAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACgg < 1:2198403/150‑1 (MQ=255) gAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACgg > 2:2068577/1‑150 (MQ=255) agcagcCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGt < 1:3041705/150‑1 (MQ=255) gcagcCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGtt < 2:1293122/150‑1 (MQ=255) agcCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGtttt < 1:1022212/150‑1 (MQ=255) agcCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGtttt < 2:2571573/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCa < 2:164338/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCa < 2:3652534/150‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCat < 1:502371/150‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCat < 2:3402853/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCatga > 1:2487494/1‑150 (MQ=255) cGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGc < 1:4133754/150‑1 (MQ=255) ggCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCa > 2:2406338/1‑150 (MQ=255) cAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCata > 2:1304810/1‑150 (MQ=255) aGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCatat > 1:1118923/1‑150 (MQ=255) aGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCatat > 2:197869/1‑150 (MQ=255) aGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCatat > 1:3691197/1‑150 (MQ=255) gATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATAtc < 2:245618/150‑1 (MQ=255) cTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCg < 1:4403717/150‑1 (MQ=255) tGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCgg > 2:5104722/1‑150 (MQ=255) aaTGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTa < 2:1416882/150‑1 (MQ=255) aCGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGc < 2:2330394/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGa < 2:3520451/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGa > 1:2098244/1‑150 (MQ=255) aTCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGa < 2:3849956/150‑1 (MQ=255) aTCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGa > 1:4216452/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGt < 1:568996/150‑1 (MQ=255) gTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCcg < 1:3146892/150‑1 (MQ=255) tCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCcgcg < 2:1446168/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCgg > 2:657638/1‑150 (MQ=255) tgtgGTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGt > 1:4964554/1‑150 (MQ=255) tgtgGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGt > 2:5113488/1‑150 (MQ=255) tgGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTta > 1:2708457/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGGTGGTTGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTtaa > 2:305590/1‑150 (MQ=255) ggtAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGa < 2:4750140/150‑1 (MQ=255) ggtAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGa < 2:2930329/150‑1 (MQ=255) ggtAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGa > 2:930638/1‑150 (MQ=255) aGAATATCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACATCGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATTAAAGGaaca < 1:2393853/150‑1 (MQ=255) | TTTCGTCCTACCAGATGCACAGAAAGATCGCTTTCATCGACGGTCAGACTCATCATCAGGCTGGAGGTGATGACCGTCATTTCCCTGATGCGAGCAGCCTGTTCGGCAGATAACTGCAATGTACGATCAGGTTCTGTGGTTTCGGTGGTAGAAAAGCGCAAAACATCGCTGCTTTCCGTCAACCGCCAGTATGGATTGTGCGATCCGAGAAAGTTGTACAACGTTGTGGACTCCCTAACGGTTTTCATGATGCATATCCTCCGGTTAACAGCGGAGTCCGCGGTTAAATAAAAGGAACA > CP009273/1340752‑1341050 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |