| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,419,486 | G→T | 7.1% | W483L (TGG→TTG) | trkG → | Rac prophage; potassium transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,419,486 | 0 | G | T | 7.1% | 916.7 / 32.6 | 240 | W483L (TGG→TTG) | trkG | Rac prophage; potassium transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (104/118); new base T (9/8); total (114/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
ATGTATTAATAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTAT > CP009273/1419337‑1419635 | aTGTATTAATAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTg > 2:2247825/1‑150 (MQ=255) gTATTAATAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGgc < 2:1457151/150‑1 (MQ=255) aTTAATAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGgcgc < 1:4163201/150‑1 (MQ=255) aataatATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTcc < 2:4400430/150‑1 (MQ=255) taataTGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTa < 1:4963695/150‑1 (MQ=255) taataTGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTa > 1:3342949/1‑150 (MQ=255) aataTGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTaa < 2:1384696/150‑1 (MQ=255) gggATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAatatat > 1:284471/1‑150 (MQ=255) ggATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATg < 1:474276/150‑1 (MQ=255) ggATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATg > 2:3075130/1‑150 (MQ=255) gATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTTGCGCTCCTAATATATgg < 1:433651/150‑1 (MQ=255) gATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATgg < 2:1664947/150‑1 (MQ=255) gATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATgg > 2:3711664/1‑150 (MQ=255) ttgtttttGGGGCTATTGCATGGTCTTTCGTAGTGATTAATTACATTGCAAAATGCTTAATGTGAATAGATATGATTCTTGGTGGCATTGAAATTTATCATGTTTTTATATTTTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTg < 2:4035714/146‑1 (MQ=255) tttGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTta < 1:3733075/150‑1 (MQ=255) tttGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTta > 1:4471652/1‑150 (MQ=255) ttGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTtat > 2:2482413/1‑150 (MQ=255) ttGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTtat < 2:3235096/150‑1 (MQ=255) ttGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTtat < 2:760999/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTtata < 2:4585235/150‑1 (MQ=255) ggggCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATaa > 2:2628489/1‑150 (MQ=255) ggCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAAtt > 2:1800778/1‑150 (MQ=255) ggCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAAtt < 1:5148801/150‑1 (MQ=255) ggCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAAtt < 2:2125015/150‑1 (MQ=255) tACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATtgtg > 1:1397888/1‑150 (MQ=255) aCTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGa > 1:317042/1‑150 (MQ=255) gCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGtt > 2:1602268/1‑150 (MQ=255) aTTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAAtatta < 1:3515593/150‑1 (MQ=255) cGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGt < 1:2369563/150‑1 (MQ=255) ggATTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGACTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGTCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGtt < 1:4377326/150‑1 (MQ=255) gAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTg < 1:4077519/150‑1 (MQ=255) gAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTg > 1:1019287/1‑150 (MQ=255) aGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTTGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGa > 2:3347289/1‑150 (MQ=255) gTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGac < 2:4989701/150‑1 (MQ=255) cTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGactca > 1:345164/1‑150 (MQ=255) ttAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGactcac > 2:4754720/1‑150 (MQ=255) aaTGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGactcactc < 1:726634/150‑1 (MQ=255) aaTGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGactcactc > 2:2213628/1‑150 (MQ=255) aTGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTTGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGActcactca > 2:3881745/1‑150 (MQ=255) aTGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGActcactca < 1:2687573/150‑1 (MQ=255) gACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTTTGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGGTTTTTTTTTTGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCAt < 2:4334797/150‑1 (MQ=255) aCATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTg > 1:1052071/1‑150 (MQ=255) aCATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTg > 1:3132853/1‑150 (MQ=255) aTGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATAcc > 2:1055723/1‑150 (MQ=255) tGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCt > 1:1092296/1‑150 (MQ=255) tGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCt < 1:4616437/150‑1 (MQ=255) ttAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAAc > 1:226565/1‑150 (MQ=255) tgtgCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTa > 2:3831580/1‑150 (MQ=255) gtgCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTAc > 2:1940630/1‑150 (MQ=255) gtgCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTAc < 1:3298783/150‑1 (MQ=255) cATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAg < 1:1584580/150‑1 (MQ=255) cATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAg > 2:547358/1‑150 (MQ=255) aTAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGc > 1:1212102/1‑150 (MQ=255) aTAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGc > 1:3653212/1‑150 (MQ=255) tAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCa > 2:316506/1‑150 (MQ=255) tAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCa > 2:2520/1‑150 (MQ=255) aGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCaa > 1:562831/1‑150 (MQ=255) aGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCaa > 1:79644/1‑150 (MQ=255) cTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAaca > 2:2891469/1‑150 (MQ=255) tATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAacac < 2:1019680/150‑1 (MQ=255) tGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCt < 2:2003546/150‑1 (MQ=255) tGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCt > 1:3848569/1‑150 (MQ=255) gATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTc < 1:4842765/150‑1 (MQ=255) aTTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTcc > 1:4980397/1‑150 (MQ=255) tCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAAAACCTCCGt > 2:1582183/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGTCTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTc > 2:2789303/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTc > 1:3841493/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTc > 1:1333568/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTcc > 1:1990310/1‑150 (MQ=255) tGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTccc < 1:2482413/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTcccc < 1:1602268/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAg > 1:4695673/1‑150 (MQ=255) ccTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAg < 2:2667847/150‑1 (MQ=255) cTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGc > 2:4049863/1‑150 (MQ=255) aaTTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTgg > 2:4274296/1‑150 (MQ=255) aaTTTATCCTGTTATAATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTgg > 2:4274324/1‑150 (MQ=255) tttATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgnt < 1:2450410/150‑1 (MQ=255) tttATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgct < 1:1759308/150‑1 (MQ=255) tCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGctgctg < 2:5096301/150‑1 (MQ=255) ccTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgg < 2:2739656/150‑1 (MQ=255) ccTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgg < 1:2618470/150‑1 (MQ=255) cTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTggg < 1:2701311/150‑1 (MQ=255) tGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTT‑GCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGt > 2:4700623/1‑150 (MQ=255) gTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGt > 1:2200714/1‑150 (MQ=255) ttattaTATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTg < 1:1259918/150‑1 (MQ=255) ttattaTATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTg > 2:701018/1‑150 (MQ=255) tattatATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGc < 2:3044013/150‑1 (MQ=255) tataTTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGtt < 1:3041009/150‑1 (MQ=255) atatTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGttt < 2:3513549/150‑1 (MQ=255) atatTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGttt < 2:3401092/150‑1 (MQ=255) atagTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGttt < 2:1047104/150‑1 (MQ=255) tatTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGtttt > 2:1219898/1‑150 (MQ=255) tGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAtt > 1:2907794/1‑150 (MQ=255) tttCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCAt < 2:3434114/150‑1 (MQ=255) ttCAGGTTTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCAt < 2:4379109/150‑1 (MQ=255) g‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCa < 2:1747555/150‑1 (MQ=255) ttttttGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAgg < 2:4824298/150‑1 (MQ=255) tttGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg > 2:4538208/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGt < 1:3561578/150‑1 (MQ=255) ggCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTAt > 1:188074/1‑150 (MQ=255) | ATGTATTAATAATATGGGATTAGGTTTTGGGGCTACTGCATCGTCATTCGGAGTGCTTAATGACATTGCAAAATGCTTAATGTGCATAGCTATGATTCTTGGTCGCCTTGAAATTTATCCTGTTATTATATTGTTTTCAGG‑TTTTTTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTAT > CP009273/1419337‑1419635 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |