| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,441,854 | C→A | 8.3% | R27S (CGT→AGT) | feaB → | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,441,854 | 0 | C | A | 8.3% | 1207.7 / 53.0 | 320 | R27S (CGT→AGT) | feaB | phenylacetaldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (144/149); new base A (11/16); total (155/165) | |||||||||||
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Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
CAGCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGGTCGTCCTGGCCCCGCACAAAGTGAAAAACGGTTGGCGATCTTTGATCCGGCCACCGGGCAAGAAATTGCGTCTACTGCTGATGCCAACGAAGCGGATGTAGATAACGCAGTCATGTCTGCCTGGCGGGCCTTTGTCTCGCGTCGCTGGGCC > CP009273/1441705‑1442003 | caGCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGgtc < 1:1547805/150‑1 (MQ=255) aGCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGgtcg < 2:1739555/150‑1 (MQ=255) gCGAAAAAAGTGACTTTTCTTGTCGCTGCGTACACTGAAATCACACTGGGTAAATAATAAGGAAAAGTGATGACAGAGCCGCATGTAGCAGTATTAAGCCAGGTCCAACAGTTTCTCGATCGTCAACACGGTCTTTATATTGATGgtagt < 2:2008603/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |