| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,521,126 | G→A | 5.5% | intergenic (+5/‑71) | yncG → / → yncH | glutathione S‑transferase homolog/IPR020099 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,521,126 | 0 | G | A | 5.5% | 888.7 / 27.2 | 238 | intergenic (+5/‑71) | yncG/yncH | glutathione S‑transferase homolog/IPR020099 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (95/129); new base A (8/5); total (103/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
GGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAACTAACTA > CP009273/1520977‑1521275 | ttATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCa > 2:270832/1‑150 (MQ=255) cACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTAt > 2:2143136/1‑150 (MQ=255) cTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGt < 2:1093053/150‑1 (MQ=255) cgcACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGttattt < 2:3516618/150‑1 (MQ=255) caaaTGGGGGCCTTGGCATGAATGTTTTCATGATAATGCCACTAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAATTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGTTATACCAGAAGATTATGttatttat < 2:255286/147‑1 (MQ=255) acaTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTtatttatt > 1:1553725/1‑150 (MQ=255) caTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATttatta > 2:1297782/1‑150 (MQ=255) caTGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATttatta < 2:249878/150‑1 (MQ=255) tGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTACAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACAGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTattatt < 2:950763/150‑1 (MQ=255) ggggCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCa > 2:3762830/1‑150 (MQ=255) gggCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAg > 2:5115365/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGt < 1:1197129/150‑1 (MQ=255) cTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAAc > 2:1845066/1‑150 (MQ=255) ggCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACttt > 2:2764722/1‑150 (MQ=255) cATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTAt > 1:1280970/1‑150 (MQ=255) aTGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATc > 2:657417/1‑150 (MQ=255) gAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCca < 2:749780/150‑1 (MQ=255) aaTGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCcac > 2:3673205/1‑150 (MQ=255) tGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACaa < 1:2739720/150‑1 (MQ=255) ggTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAat < 1:1220455/150‑1 (MQ=255) ggTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAat < 1:902357/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatg < 2:4553507/150‑1 (MQ=255) ttCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatgat < 2:3706151/150‑1 (MQ=255) tCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAatgatg > 2:3327885/1‑150 (MQ=255) cAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATgg < 1:197652/150‑1 (MQ=255) ggATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGc > 2:4339975/1‑150 (MQ=255) tAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGta > 2:3611650/1‑150 (MQ=255) tAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGta < 1:3280011/150‑1 (MQ=255) tGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaatt < 2:2188180/150‑1 (MQ=255) gCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGtaatta < 1:3908982/150‑1 (MQ=255) aCGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTaattaatt > 1:5068978/1‑150 (MQ=255) cGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAattaatta < 1:4322983/150‑1 (MQ=255) atatCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAAt > 2:3143494/1‑150 (MQ=255) atCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTc > 1:4463221/1‑150 (MQ=255) aGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATg < 1:18278/150‑1 (MQ=255) cGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTTATTAAATTCATGGTAt < 1:4589994/150‑1 (MQ=255) gATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATg > 1:3075125/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGt > 2:3864137/1‑150 (MQ=255) ttGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtt < 1:230323/150‑1 (MQ=255) tGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGttt > 2:1971608/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtttttt < 1:1352478/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGtttttt < 2:1696535/150‑1 (MQ=255) gATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTa > 2:2237745/1‑150 (MQ=255) gCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAtt < 1:4053083/150‑1 (MQ=255) cTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt < 2:2385389/150‑1 (MQ=255) cTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt < 2:4254750/150‑1 (MQ=255) cTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt < 1:1092031/150‑1 (MQ=255) cTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt < 1:2785369/150‑1 (MQ=255) cTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAttt > 2:1871997/1‑150 (MQ=255) gTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTtat > 1:2420860/1‑150 (MQ=255) aTGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTatat < 2:2202062/150‑1 (MQ=255) tCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCAc < 2:4463221/150‑1 (MQ=255) tCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCAc < 2:797269/150‑1 (MQ=255) cAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCaat > 2:539130/1‑148 (MQ=255) ttACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACtctc > 2:4122239/1‑150 (MQ=255) ttACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACtctc < 1:611538/150‑1 (MQ=255) ccGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtt < 2:2944601/150‑1 (MQ=255) ccGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtt < 2:4929370/150‑1 (MQ=255) ccGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtt > 2:1611378/1‑150 (MQ=255) cGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCttt > 1:4774946/1‑150 (MQ=255) cGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCttt > 1:4774860/1‑150 (MQ=255) gAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTATTTTATATCAATCTCCtttt > 2:4435082/1‑150 (MQ=255) gAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCtttt < 1:3605488/150‑1 (MQ=255) aaTTACAAGAATTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttca < 2:4527486/150‑1 (MQ=255) aaTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttca < 1:5121484/150‑1 (MQ=255) aTTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcat > 1:1427129/1‑150 (MQ=255) ttACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcatt > 2:1224962/1‑150 (MQ=255) tACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATAACAGAAGATTATTTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGTGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCATTttcattc > 2:4599546/1‑150 (MQ=255) aCAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcattca > 1:2911366/1‑150 (MQ=255) aCAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTttcattca > 1:1574948/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAg > 1:2074147/1‑150 (MQ=255) agTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCgtgt < 2:2948633/150‑1 (MQ=255) tATTAAAAAGGAATGATATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCt > 2:1034819/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTa > 1:729489/1‑150 (MQ=255) aTTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTAAGTAACTTTATACACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCATCGAGTCTa > 1:848152/1‑150 (MQ=255) ttAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTat > 1:4211411/1‑150 (MQ=255) tAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatt > 2:119860/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTattt < 2:1551438/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTattt > 1:4699832/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCAACAATGATGGGCTTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAAATTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTATattt > 1:3149325/1‑150 (MQ=255) aaaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttc < 2:3585929/150‑1 (MQ=255) aaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttca < 2:2105708/150‑1 (MQ=255) aaaGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttca < 1:777340/150‑1 (MQ=255) ggAATGAACTTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTatttcattt < 2:1705755/150‑1 (MQ=255) aTGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCct < 2:3228276/150‑1 (MQ=255) tGAAATTATTTGAGTGGGATTCCAGAAGATTATTTTTTTTATTATTCATTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTACTTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTTTCTATTTCATTTCctc < 2:3165486/150‑1 (MQ=255) gAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGATATTTATTATTAAGTAACTTAATCCACAATGATGGTCGTAATTAAATAAAATCATGGTATGTTTTTTAATTTATATAACTATCCTTTTCATACAGAGAGTCTATTTAATTTCatct > 1:2615719/1‑150 (MQ=255) aaaTTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTg < 2:3198144/150‑1 (MQ=255) aaaTTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTg < 2:4032357/150‑1 (MQ=255) aaaTTATTTGAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTg < 2:1619559/150‑1 (MQ=255) attattTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGaa < 1:22599/150‑1 (MQ=255) ttattTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGaaa < 1:1549838/150‑1 (MQ=255) attTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAg > 1:201296/1‑150 (MQ=255) attTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTAATTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAg > 1:198849/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGaaa > 2:2898247/1‑150 (MQ=255) gAGTGGAATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTAATTTCCTCTGAAAAGAaac > 1:4493443/1‑150 (MQ=255) aGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaact < 1:4534610/150‑1 (MQ=255) tGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaactaa < 1:1764755/150‑1 (MQ=255) gggATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaactaac > 1:1055622/1‑150 (MQ=255) ggATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAaactaact < 2:2774701/150‑1 (MQ=255) | GGACTGTTATCTTTGCACTATGCGCACATGGGGGCCTGGGCATGAATGGTTTCAGGATAATGCCACGAATATCAGTGCGATTGCTGATGCTGTATGTCAGTTACCGAAATTACAAGAAGTATTAAAAAGGAATGAAATTATTTGAGTGGGATACCAGAAGATTATGTTATTTATTATTCAGTAACTTTATCCACAATGATGGGCGTAATTAATTAAATTCATGGTATGTTTTTTAATTTATATCACTCTCCTTTTCATTCAGCGTGTCTATTTCATTTCCTCTGAAAAGAAACTAACTA > CP009273/1520977‑1521275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |