| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,648,870 | 0 | A | T | 12.7% | 993.7 / 119.0 | 331 | W177R (TGG→AGG) | rspA | bifunctional D‑altronate/D‑mannonate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (149/139); new base T (21/21); total (171/160) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
CAAAGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCTTTGGTTGCGGGTTCATAAGCCAGACCTTTACCTTTCGACATGCCGTAGGTGGTTTTCATACCAGGGATTCCGCACTGCACGCGGATGGCTTTGAATCCAAGCTCTTGATGACGGGCATAATCATCCAGAGCTTCATCAATAC > CP009273/1648723‑1649019 | aaaGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTg < 1:3910659/150‑1 (MQ=255) aGCGCGCCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTc < 1:3694323/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCTTCAATAGGCGTTAAGCGATGGTGCATGTCATGCAGCAAATGTTCATTAAAACCAAACTTGTTACGTACCGCGTCAAACAATTTCGGCATGAAATCGAGGTATTTCTCCGTCGACCACAGCTGCTCTTCCGGCCACTGTCCtt > 2:1745664/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |