Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,694,085 | C→T | 5.8% | V158V (GTC→GTT) | malX → | fused maltose and glucose‑specific PTS enzymes: IIB component, IIC component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,694,085 | 0 | C | T | 5.8% | 1297.9 / 45.4 | 350 | V158V (GTC→GTT) | malX | fused maltose and glucose‑specific PTS enzymes: IIB component, IIC component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (180/149); new base T (9/11); total (190/160) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 353 total aligned reads displayed.
ACCTCGCGGTAAACTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGATTTTCGCCATGGG > CP009273/1693937‑1694234 | ccTCGCGGTAAACTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTg > 1:2301588/1‑150 (MQ=255) cgcgGTAAACTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGAt > 1:1818776/1‑150 (MQ=255) cgGTAAACTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGAtgc > 2:1733502/1‑150 (MQ=255) cgGTAAACTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGAtgc > 2:1948961/1‑150 (MQ=255) aaaCTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCa > 1:845976/1‑150 (MQ=255) aaCTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTGTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCTGAGCATTCTTGGGATCCTGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCGGGTATTATCGTGTGGAtggtgctt > 2:4776060/1‑148 (MQ=255) aaCTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCAt > 2:4424128/1‑150 (MQ=255) aaCTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCAt > 2:3293470/1‑150 (MQ=255) aCTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATg < 1:4668367/150‑1 (MQ=255) ggTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGtt > 2:4623403/1‑150 (MQ=255) ggTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGtt < 2:836032/150‑1 (MQ=255) gTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGttt > 2:3959314/1‑150 (MQ=255) ttGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTc < 2:2087650/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCataat < 1:1119605/150‑1 (MQ=255) aTAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCataata > 1:369035/1‑150 (MQ=255) aaaGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATc > 2:2538423/1‑150 (MQ=255) aaaGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATc > 1:4341915/1‑150 (MQ=255) aaaGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATc < 1:4054604/150‑1 (MQ=255) aaaGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATc < 1:1428746/150‑1 (MQ=255) aaaGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATc < 1:325112/150‑1 (MQ=255) aaGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATcc < 2:619537/150‑1 (MQ=255) aGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCg > 1:798297/1‑150 (MQ=255) aTTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTg < 2:1935894/150‑1 (MQ=255) tCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTTTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGcc < 2:688842/150‑1 (MQ=255) cTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCg < 1:3171950/150‑1 (MQ=255) tGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCgg > 2:2484039/1‑150 (MQ=255) tGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCgg > 2:717667/1‑150 (MQ=255) gCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGa > 1:4720236/1‑150 (MQ=255) ccAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGAt < 2:1395538/150‑1 (MQ=255) ccAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGAt > 1:279876/1‑150 (MQ=255) cAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATg < 1:4297238/150‑1 (MQ=255) aCCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTTTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATgcg < 2:257812/150‑1 (MQ=255) aCCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATgcg > 1:120763/1‑150 (MQ=255) aCCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATgcg < 2:51057/150‑1 (MQ=255) cGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTgg < 1:2989128/150‑1 (MQ=255) gATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCa > 2:4107214/1‑150 (MQ=255) tGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCAtt < 1:2531644/150‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCAttcttc < 2:2322592/150‑1 (MQ=255) cgGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTTTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcg < 2:4709804/150‑1 (MQ=255) cgGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATGCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcg > 1:3445589/1‑150 (MQ=255) gTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcggc < 2:3435313/150‑1 (MQ=255) ttCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcggcg > 1:215568/1‑150 (MQ=255) ttCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcggcg > 1:3195594/1‑150 (MQ=255) ttCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTGGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcggcg < 2:3531889/150‑1 (MQ=255) tCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTcggcgg > 2:3445236/1‑150 (MQ=255) gAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTAc > 2:2227300/1‑150 (MQ=255) aaaGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTAcg < 1:4552734/150‑1 (MQ=255) aaaGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGGGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTAcg > 2:1227977/1‑150 (MQ=255) cAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCtt > 2:1105610/1‑150 (MQ=255) aaTAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTc < 1:274875/150‑1 (MQ=255) aaTAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTc > 1:1965485/1‑150 (MQ=255) aTAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCg > 1:6807/1‑150 (MQ=255) tAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGt < 2:1447368/150‑1 (MQ=255) tAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGt > 2:2732519/1‑150 (MQ=255) aCATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTAc < 2:4211792/150‑1 (MQ=255) aCATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGAGACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTAc < 2:4877387/150‑1 (MQ=255) cATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGAGACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTAcc < 1:4859971/150‑1 (MQ=255) tCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCaa < 1:266283/150‑1 (MQ=255) cAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAAtt < 2:3355989/150‑1 (MQ=255) cAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAAtt < 2:1841736/150‑1 (MQ=255) cAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAAtt < 2:2639930/150‑1 (MQ=255) gagCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTAt > 1:1009578/1‑150 (MQ=255) agCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTAtc > 1:4131512/1‑150 (MQ=255) gCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTAtct > 2:3230095/1‑150 (MQ=255) gCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTAGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCTCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTAtct > 1:4473489/1‑150 (MQ=255) cATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTAtctc < 2:3139821/150‑1 (MQ=255) ttCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATctcct > 1:757295/1‑150 (MQ=255) tCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATctcctc > 1:2086957/1‑150 (MQ=255) tGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCt < 1:2393376/150‑1 (MQ=255) gggATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTg > 1:3777650/1‑150 (MQ=255) gggATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTg > 2:1885537/1‑150 (MQ=255) gggATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCGGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTg < 2:216564/150‑1 (MQ=255) gATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGt < 2:3716277/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTg < 2:1367754/150‑1 (MQ=255) aTCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTg < 2:1137930/150‑1 (MQ=255) tcgatcgaTACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGc > 2:1251591/1‑150 (MQ=255) gatcgatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCt > 2:4991927/1‑150 (MQ=255) gatcgatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCt > 2:3838132/1‑150 (MQ=255) atcgatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCtt > 1:4773511/1‑150 (MQ=255) tcgatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTTTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTg < 2:4580047/150‑1 (MQ=255) cgatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGAGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGt > 2:4502074/1‑150 (MQ=255) gatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTc < 1:3598701/150‑1 (MQ=255) gatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTc > 2:1800994/1‑150 (MQ=255) gatACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTc < 2:157275/150‑1 (MQ=255) ccGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGcc < 1:2857867/150‑1 (MQ=255) cGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCt < 1:2678779/150‑1 (MQ=255) gggATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTg < 1:2484039/150‑1 (MQ=255) gggATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTg > 1:4248776/1‑150 (MQ=255) gggATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTg > 1:1668668/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTTTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt < 2:4026064/150‑1 (MQ=255) cTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGAtt < 2:2799472/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTc > 2:810939/1‑150 (MQ=255) cggtgATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAg < 2:2917865/150‑1 (MQ=255) gtgATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTc > 1:523899/1‑150 (MQ=255) ggTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGAtt > 2:951310/1‑150 (MQ=255) gTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGAttt > 2:426428/1‑150 (MQ=255) attatCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGATTTTc > 1:5052346/1‑150 (MQ=255) ttatCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGATTTTCg < 2:4330680/150‑1 (MQ=255) cGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGATTTTCGCCAt < 1:584989/150‑1 (MQ=255) tCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGATTTTCGCCATgg < 2:2686598/150‑1 (MQ=255) | ACCTCGCGGTAAACTTCTGGTTGACCAATAAAGGCATTCTGCCAACCACGGATGCCGCGGTTCTGAAAGCCAATAACATCCAGAGCATTCTTGGGATCCAGTCGATCGATACCGGGATCCTCGGTGCGGTGATCGCCGGTATTATCGTCTGGATGCTGCATGAGCGTTTCCATAATATCCGCCTGCCGGATGCGCTGGCATTCTTCGGCGGTACGCGCTTCGTACCAATTATCTCCTCGCTGGTGATGGGCCTTGTCGGCCTGGTGATTCCATTAGTCTGGCCGATTTTCGCCATGGG > CP009273/1693937‑1694234 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |