| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 132,639 | 0 | T | A | 21.1% | 850.1 / 230.9 | 356 | T105S (ACG→TCG) | speE | spermidine synthase (putrescine aminopropyltransferase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (131/150); new base A (40/35); total (171/185) | |||||||||||
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Only 100 of 357 total aligned reads displayed.
ACATCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTCCACCATCGTGATTGACTCAACGTTTTTATGTCGGGTTACTTCACGCAGCATGGCACCGTCGCCGCCGCCGATAATCAGCACATGTTTCGCGTGACCATGGGCCAGTAGCGGAACATGGGTCATCATCTCATGATAGATAAACTCGTCGCGCTCGGTGG > CP009273/132491‑132788 | aTCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTCCACCATCGTGAt < 1:4813703/150‑1 (MQ=255) tCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTCCACCATCGTGAtt > 1:1019572/1‑150 (MQ=255) tCAAAGGTCTGGCTGGTTTGATTAACGAAATTGACGCCATCGTCGATCACCAGCTTAAAGCGCGGATCGTCGTAGCTACCGGCGTTATGGTTGGGTAGATACTGACGGCAGAACGATACGACACCCGCATCGATTTCCACCATCGAGAtt > 2:818677/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |