| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 134,652 | G→T | 32.3% | M361I (ATG→ATT) | cueO → | multicopper oxidase (laccase) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 134,652 | 0 | G | T | 32.3% | 481.2 / 238.4 | 263 | M361I (ATG→ATT) | cueO | multicopper oxidase (laccase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/113); new base T (42/43); total (107/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.00e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
AGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134504‑134800 | aGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatga > 1:334891/1‑150 (MQ=255)aGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatga < 1:2208255/150‑1 (MQ=255) gCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatgat < 1:5050465/150‑1 (MQ=255) ccTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatgatg > 1:3426812/1‑150 (MQ=255) ccTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATatgatg < 1:1995437/150‑1 (MQ=255) cATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATgggg < 1:4581569/150‑1 (MQ=255) cATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATgggg < 2:3550215/150‑1 (MQ=255) cATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATgggg < 2:4189571/150‑1 (MQ=255) aTCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGa < 1:3613300/150‑1 (MQ=255) ccGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATg < 2:2495944/150‑1 (MQ=255) ccGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATg > 1:2612122/1‑150 (MQ=255) gCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCt < 2:4180905/150‑1 (MQ=255) cGGATTCAGCCGATTGCTATTTGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTa < 2:3341265/150‑1 (MQ=255) gATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAAt < 1:3065091/150‑1 (MQ=255) tCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGga < 1:2147349/150‑1 (MQ=255) aGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGgaga > 2:187504/1‑150 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata < 1:1386628/150‑1 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata < 1:1386691/150‑1 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata > 1:2811429/1‑150 (MQ=255) gATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAata < 2:3107914/150‑1 (MQ=255) tGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATgg < 1:2322246/150‑1 (MQ=255) tGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATgg > 1:3825167/1‑150 (MQ=255) gCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGc > 2:2822081/1‑150 (MQ=255) tATGAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATGAAGTAGCCGGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGa < 2:2975612/150‑1 (MQ=255) ttAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATc < 2:3436974/150‑1 (MQ=255) ttAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATc < 1:3397304/150‑1 (MQ=255) tAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCa > 1:3023378/1‑150 (MQ=255) tAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCa < 2:1385881/150‑1 (MQ=255) aGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTCATGGAGAAATATGGCGATCAg > 1:3244348/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAgg > 2:427767/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAgg > 2:3022661/1‑150 (MQ=255) tGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGc > 1:1449543/1‑150 (MQ=255) tGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGc < 2:57493/150‑1 (MQ=255) cTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTTCCTGCGTTACCAACGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACACGATGCTCGATATGAAGGGGATGCAGCTGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGAt > 1:3114177/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGAt > 1:2517730/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGAt < 2:2295152/150‑1 (MQ=255) cctgTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATgg > 2:2607376/4‑150 (MQ=255) gTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCg < 2:199793/150‑1 (MQ=255) gTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCg < 2:581351/150‑1 (MQ=255) tttGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggat < 1:4821436/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatg > 1:766397/1‑150 (MQ=255) tGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatgg < 2:4823648/150‑1 (MQ=255) tGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatgg < 1:4539426/150‑1 (MQ=255) gCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatgga < 1:141481/150‑1 (MQ=255) ccAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGggatggat < 1:3067195/150‑1 (MQ=255) cAGACACATTAAGTAGCCTGCCCGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATc > 1:533407/1‑150 (MQ=255) acacATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATcaca > 2:2390468/1‑150 (MQ=255) acacATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATcaca > 1:706399/1‑150 (MQ=255) acaTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGc < 1:1296671/150‑1 (MQ=255) caTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGcc < 2:4882866/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCa < 2:1502394/150‑1 (MQ=255) aTTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCa > 1:2298657/1‑150 (MQ=255) tAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAga > 1:1158281/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGTTGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat > 1:407282/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat > 1:450853/1‑150 (MQ=255) aaGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgat < 1:2404001/150‑1 (MQ=255) gTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAgatga > 1:1023381/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGatgatg > 2:1619483/1‑150 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 2:2651200/1‑150 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat > 2:1893687/1‑150 (MQ=255) cctgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCat < 1:2865873/150‑1 (MQ=255) tgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCatat > 2:2777451/1‑150 (MQ=255) tgcGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCatat > 2:4204563/1‑150 (MQ=255) ttACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATgggg < 2:3768083/150‑1 (MQ=255) tACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGc > 1:613195/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa > 2:3199708/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCa > 2:2679830/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACgg < 1:2902436/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGc < 1:783320/150‑1 (MQ=255) gCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCaa > 2:434986/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAata < 1:2947780/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAatat < 2:2475378/150‑1 (MQ=255) ggAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAatat < 2:631432/150‑1 (MQ=255) gggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAAt > 1:4143707/1‑150 (MQ=255) ggCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATc > 1:1016331/1‑150 (MQ=255) cTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCat < 1:1362979/150‑1 (MQ=255) gACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCatat < 1:52494/150‑1 (MQ=255) aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg > 1:3994031/1‑150 (MQ=255) aCGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGAGGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATg < 2:3884036/150‑1 (MQ=255) aCGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCa < 2:503708/150‑1 (MQ=255) gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg > 2:3691465/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:3018257/150‑1 (MQ=255) gCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcg < 1:867980/150‑1 (MQ=255) aaGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggc < 1:1530463/150‑1 (MQ=255) aaGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggc < 2:4981796/150‑1 (MQ=255) aGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggcg < 1:2465625/150‑1 (MQ=255) aGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCAcggcg < 2:334891/150‑1 (MQ=255) tGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGa > 1:4862721/1‑150 (MQ=255) tctctATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCg < 2:1031413/150‑1 (MQ=255) ctATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGAtt > 2:43518/1‑150 (MQ=255) tATGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGAttt > 1:1458366/1‑150 (MQ=255) aTGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTc < 2:2559157/150‑1 (MQ=255) tGGACCCGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTcc > 1:3747998/1‑150 (MQ=255) tGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTcc < 1:4574737/150‑1 (MQ=255) cccGATGCTCGATATTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTccacca < 2:4428857/150‑1 (MQ=255) gCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCcaa > 2:3289014/1‑150 (MQ=255) cTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCcaac > 1:4244606/1‑150 (MQ=255) atatTATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACaaaa > 2:878777/1‑150 (MQ=255) tattatGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTACCACCATGCCAACAAAAt > 1:4731017/1‑150 (MQ=255) tgatgGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCa > 2:468218/1‑150 (MQ=255) | AGCCTCATCCGGTAATGCGGATTCAGCCGATTGCTATTAGTGCCTCCGGTGCTTTGCCAGACACATTAAGTAGCCTGCCTGCGTTACCTTCGCTGGAAGGGCTGACGGTACGCAAGCTGCAACTCTCTATGGACCCGATGCTCGATATGATGGGGATGCAGATGCTAATGGAGAAATATGGCGATCAGGCGATGGCCGGGATGGATCACAGCCAGATGATGGGCCATATGGGGCACGGCAATATGAATCATATGAACCACGGCGGGAAGTTCGATTTCCACCATGCCAACAAAATCA > CP009273/134504‑134800 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |