| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,871,563 | C→A | 8.3% | R76L (CGG→CTG) | yoaF ← | DUF333 family outer membrane lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,871,563 | 0 | C | A | 8.3% | 1117.9 / 51.9 | 299 | R76L (CGG→CTG) | yoaF | DUF333 family outer membrane lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (124/150); new base A (13/12); total (137/162) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.36e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
GGACATCGCCAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGCCCATTCATCAATCGTTTCACCGCCCGGTAATTTGCAATTGTTGCTGACCCCTTGCGCTGTCTGCACTGGAATGAGCGTCCCGCCCTTCTGCTGGCAATAGACCGACGCCGGATTTGCCATACCAATCTGCGGCGGTTTA > CP009273/1871414‑1871712 | ggACATCGCCAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCAcgcc > 2:5116445/1‑150 (MQ=255) gACATCGCCAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCAcgccg > 1:1890178/1‑150 (MQ=255) tCGCCAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCcac > 2:3822667/1‑150 (MQ=255) ccAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAAt < 1:3943881/150‑1 (MQ=255) cAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATg < 1:3606891/150‑1 (MQ=255) cAAAAAACAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCAGCCACAATg > 1:2769390/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGc > 2:765996/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGc > 1:2332410/1‑150 (MQ=255) aaaCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGCCCa < 1:2862104/150‑1 (MQ=255) aaCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGCCCAt < 2:4800569/150‑1 (MQ=255) aCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGCCCAtt > 1:2696407/1‑150 (MQ=255) aCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGCCCAtt > 2:3988608/1‑150 (MQ=255) aCAGCCGCTGACCCTGCTCTACTCAGCAAAAAACACCACGCAGAACCATGCGCTGGTGCTGGCCGACTGGCTACGTAGCTTGTGATTTTAGTACAGCATCCGGCGGTTATTTTTCACCAGCCGGATGGTCACGCCGCCACAATGCCCAtt > 1:4102970/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |