Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,102,205 | C→A | 15.1% | V287V (GTG→GTT) | wzxB ← | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,102,205 | 0 | C | A | 15.1% | 721.1 / 78.9 | 233 | V287V (GTG→GTT) | wzxB | putative polisoprenol‑linked O‑antigen transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (120/77); new base A (19/17); total (139/94) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.63e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
AGAGGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAG > CP009273/2102056‑2102354 | agagGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCGAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATc > 1:4430362/1‑150 (MQ=255) ggCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATcaca > 2:3205794/1‑150 (MQ=255) cGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACAcc > 2:2060823/1‑150 (MQ=255) atatAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCt > 2:1081317/1‑150 (MQ=255) atatAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCt < 1:194307/150‑1 (MQ=255) ataATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTc > 1:3049341/1‑150 (MQ=255) ataATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTc > 2:4184816/1‑150 (MQ=255) taATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTca < 2:654633/150‑1 (MQ=255) aaTCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTcac < 2:3408533/150‑1 (MQ=255) aaTCATTAGCACAATCACTGCAGTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTcac < 2:3112659/150‑1 (MQ=255) aTCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTcaca > 2:2433543/1‑150 (MQ=255) tCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCacac > 2:4297330/1‑150 (MQ=255) tCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCacac < 1:2241044/150‑1 (MQ=255) cATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACg > 1:2920270/1‑150 (MQ=255) aTTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGa > 2:4155573/1‑150 (MQ=255) aTTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGa > 1:508934/1‑150 (MQ=255) ttAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGAt < 2:834430/150‑1 (MQ=255) gCACCATCACTGCATGATCAGATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTaa < 2:502508/150‑1 (MQ=255) caATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGaa > 1:636118/1‑150 (MQ=255) cACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAg > 2:2642551/1‑150 (MQ=255) aCTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGc > 2:1623860/1‑150 (MQ=255) aCTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGc < 1:1174958/150‑1 (MQ=255) aCTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGc > 1:2031041/1‑150 (MQ=255) tGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGt > 1:1845179/1‑150 (MQ=255) ttATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACtt > 1:4647283/1‑150 (MQ=255) ttATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACtt < 2:2322402/150‑1 (MQ=255) tATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTg < 2:2398957/150‑1 (MQ=255) tCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGat > 1:4518167/1‑150 (MQ=255) tatCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATAtt > 2:2594061/1‑150 (MQ=255) tCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCt > 1:3954936/1‑150 (MQ=255) cccGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCtt > 1:3904413/1‑150 (MQ=255) cGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTgg > 2:4638965/1‑150 (MQ=255) cccTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGta < 2:3888754/150‑1 (MQ=255) cccTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGta > 2:2759296/1‑150 (MQ=255) ccTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGtat > 1:4371502/1‑150 (MQ=255) tataCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTatat > 1:1213124/1‑150 (MQ=255) taCTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTg < 1:4714629/150‑1 (MQ=255) cTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCt < 2:3509508/150‑1 (MQ=255) ttATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCtt < 1:3439038/150‑1 (MQ=255) ttATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCtt < 2:3593391/150‑1 (MQ=255) tttACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCAGACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTg > 2:2927397/1‑150 (MQ=255) tACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGAt > 2:4965579/1‑150 (MQ=255) tACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGAt < 2:1393917/150‑1 (MQ=255) tataGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGAtt > 1:4279934/1‑150 (MQ=255) ataGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGAttt < 1:2758065/150‑1 (MQ=255) gATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAAt > 2:355750/1‑150 (MQ=255) gATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTATTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGTGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAAt > 2:355495/1‑150 (MQ=255) cACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGcc < 2:1960472/150‑1 (MQ=255) aCCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGccc > 1:4972130/1‑150 (MQ=255) aCCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTATTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAcccc < 1:3056346/150‑1 (MQ=255) cccAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCt < 2:3794120/150‑1 (MQ=255) aaGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGa > 1:967123/1‑150 (MQ=255) agCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAgc > 2:3476364/1‑150 (MQ=255) gCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAgcg < 1:1882122/150‑1 (MQ=255) gCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAgcg < 2:1959384/150‑1 (MQ=255) gAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGt > 1:4781958/1‑150 (MQ=255) gAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGt > 1:3352636/1‑150 (MQ=255) aaTTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGtt < 1:3265524/150‑1 (MQ=255) aTTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTATTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGttt > 2:4680467/1‑150 (MQ=255) ttAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTTTATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTc < 2:5060234/150‑1 (MQ=255) ttAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTc < 2:3669321/150‑1 (MQ=255) ttAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTc > 1:951070/1‑150 (MQ=255) tGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTtat < 1:2883702/150‑1 (MQ=255) tGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTtat < 1:3852191/150‑1 (MQ=255) tGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTtat < 2:4603449/150‑1 (MQ=255) aaaaGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGt > 1:374775/1‑150 (MQ=255) aGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTAtt < 1:2232881/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTg < 1:4010638/150‑1 (MQ=255) ccaccaATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGcc > 1:1383540/1‑150 (MQ=255) ccaATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATATCCCTTGAAGCTCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCa > 1:2676487/1‑150 (MQ=255) aaTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAtt < 2:1312034/150‑1 (MQ=255) aaTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAtt > 1:1835086/1‑150 (MQ=255) aaTCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCAtt > 1:2251647/1‑150 (MQ=255) aaaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTaaaa > 1:1122900/1‑150 (MQ=255) aaaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTaaaa > 1:2178928/1‑150 (MQ=255) aaCTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAAt > 1:2382349/1‑150 (MQ=255) cTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTc > 1:4619202/1‑150 (MQ=255) cAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTccc < 2:2132645/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCt > 2:2420835/1‑150 (MQ=255) gCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTAc > 2:4429082/1‑150 (MQ=255) cAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACg < 2:2053789/150‑1 (MQ=255) gTCAATGATTTTTTAATTAAAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGAc < 2:2706901/150‑1 (MQ=255) tCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGTCCGCATTAAAATTCCCTACGGACg > 2:1267951/1‑150 (MQ=255) aaTGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGtt < 2:3049341/150‑1 (MQ=255) gATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGt < 2:262398/150‑1 (MQ=255) gATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGt < 2:2858076/150‑1 (MQ=255) ttttttAATTAAATTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTcc > 1:244061/1‑150 (MQ=255) ttttttAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTcc < 1:435610/150‑1 (MQ=255) ttttAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAg > 1:1255191/1‑150 (MQ=255) ttttAATTAAAATAACACCCTACACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAg < 1:4252891/150‑1 (MQ=255) taattaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGata > 1:3751934/1‑150 (MQ=255) attaaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGAtata < 1:3186759/150‑1 (MQ=255) attaaAATAACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGAtata < 2:4016936/150‑1 (MQ=255) taaAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATaaa > 1:4167825/1‑150 (MQ=255) aaaaTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAAt < 1:3437942/150‑1 (MQ=255) aaaTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATc < 1:4886079/150‑1 (MQ=255) aaaTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATc > 1:3592678/1‑150 (MQ=255) aaaTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATc > 1:3592431/1‑150 (MQ=255) aTCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATcac > 2:1778713/1‑148 (MQ=255) cacaCCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAg > 2:57926/1‑150 (MQ=255) | AGAGGCGATATAATCATTAGCACAATCACTGCATTATCATATCCCGGCCCTATACTTATTTTTACTAGTATAGATGCACCCAAGAGCAGAATTAATGAAAAAGCACCACCAATCAAACTCAAGCAGGTCAATGATTTTTTAATTAAAATCACACCCTTCACACGATTAAGAACAAGCGTACTTGATATTCTTGGGTATATTGCTTGGGTGATAGGATTTAATAGCCCTTGAAGCGCGTTTCTTATAGTATTGGCCGCATTAAAATTCCCTACGGACGTTGGTCCAGATATAAATCCCAG > CP009273/2102056‑2102354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |