| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,197,797 | A→T | 26.9% | intergenic (+29/‑278) | yehK → / → yehL | uncharacterized protein/putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,197,797 | 0 | A | T | 26.9% | 549.5 / 234.2 | 285 | intergenic (+29/‑278) | yehK/yehL | uncharacterized protein/putative ABC superfamily transporter ATP‑binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (114/94); new base T (33/44); total (147/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.33e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
TGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCT > CP009273/2197650‑2197946 | tGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTc < 2:3898878/150‑1 (MQ=255)tGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATc > 1:2652116/1‑150 (MQ=255) gATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATcc > 2:3693616/1‑150 (MQ=255) gATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATcc < 1:4494051/150‑1 (MQ=255) gATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATcc > 2:4578469/1‑150 (MQ=255) agagATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGt > 2:4816574/1‑150 (MQ=255) gagaTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTc < 1:98832/150‑1 (MQ=255) agaTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTcc < 2:4752794/150‑1 (MQ=255) gaTGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTccc < 1:641594/150‑1 (MQ=255) aGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCACGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATg < 2:3664251/150‑1 (MQ=255) gtgtATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATgg < 1:3039856/150‑1 (MQ=255) tgtATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGc > 2:2669484/1‑150 (MQ=255) ttGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTgg < 2:2538435/150‑1 (MQ=255) ttGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTgg < 1:3716270/150‑1 (MQ=255) ttGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTgg < 2:1248347/150‑1 (MQ=255) gaGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAACAGCAATTCTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATtat < 2:258736/150‑1 (MQ=255) gCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATaa < 1:2544975/150‑1 (MQ=255) gCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATaa < 1:472993/150‑1 (MQ=255) cGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATaaa < 1:1813894/150‑1 (MQ=255) ttACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCAt > 2:144424/1‑150 (MQ=255) tACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCAtt < 1:430706/150‑1 (MQ=255) aCGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTa < 1:1483615/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTAt < 2:1886864/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTAt < 1:4554538/150‑1 (MQ=255) gAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATc > 2:2351744/1‑150 (MQ=255) aGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCt < 1:3257694/150‑1 (MQ=255) aGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCt > 1:1423529/1‑150 (MQ=255) ggTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCtt < 2:2916427/150‑1 (MQ=255) tCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGc < 2:24594/150‑1 (MQ=255) cACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCa > 1:486200/1‑150 (MQ=255) aCCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCaa < 2:3174577/150‑1 (MQ=255) aaaCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACgggg < 1:3199538/150‑1 (MQ=255) aCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCCAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTc < 2:3318903/150‑1 (MQ=255) aCTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTc < 1:1712954/150‑1 (MQ=255) tGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCa > 1:946958/1‑150 (MQ=255) gTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAg < 2:3501501/150‑1 (MQ=255) aaTAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGcc < 1:2087075/150‑1 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGt < 1:1766925/150‑1 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGt < 2:3998036/150‑1 (MQ=255) cAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGt < 2:536752/150‑1 (MQ=255) tAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAtt > 1:1509286/1‑150 (MQ=255) tAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATAATCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCAGGCGCAACGACCCAATGGCCTGGATTATAAATATCATTATCTTAATTGCAACGGGGACCAGCAGTGGATATAAtt > 1:3446180/1‑150 (MQ=255) aTCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAAttcg < 1:2371642/150‑1 (MQ=255) aTCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGGGGTTATAAttcg > 2:4767035/1‑150 (MQ=255) cGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGGGGTTATAAttcgtt > 1:5025879/1‑150 (MQ=255) gAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATtcgttcgt > 2:917985/1‑150 (MQ=255) caCTACAGAATAGATTCAACCAAGACATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTcgttcgtt < 1:3999224/149‑1 (MQ=255) aCTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTg > 2:648844/1‑150 (MQ=255) cTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTgg > 2:4848712/1‑150 (MQ=255) tACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGa < 1:1913122/150‑1 (MQ=255) aGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAaca > 1:1961629/1‑150 (MQ=255) aGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAaca > 1:247916/1‑150 (MQ=255) aGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAaca > 1:1830332/1‑150 (MQ=255) aGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAaca > 1:224351/1‑150 (MQ=255) gAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAacac < 2:824088/150‑1 (MQ=255) aaTATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACg < 1:3434282/150‑1 (MQ=255) tatatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGAt < 2:713571/150‑1 (MQ=255) tatatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGAt < 1:4267767/150‑1 (MQ=255) atatTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGACCACGATg > 2:3385195/1‑150 (MQ=255) atTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGtt < 1:4507998/150‑1 (MQ=255) ttCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTg < 2:4209786/150‑1 (MQ=255) cAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGca > 1:650586/1‑150 (MQ=255) cAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGca > 2:4357832/1‑150 (MQ=255) aCCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGcaca > 2:2431444/1‑150 (MQ=255) aCCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGcaca > 2:5100555/1‑150 (MQ=255) ccAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAg > 1:3753596/1‑150 (MQ=255) cAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAgg > 2:2097546/1‑150 (MQ=255) aaGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGc > 2:1995888/1‑150 (MQ=255) aGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCt < 2:74122/150‑1 (MQ=255) gAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCtg > 2:4912371/1‑150 (MQ=255) aTAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTgtgg > 1:3687140/1‑150 (MQ=255) aTAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTgtgg > 1:3834693/1‑150 (MQ=255) aGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTgtggtg < 1:1187740/150‑1 (MQ=255) aataatATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGtt > 2:3459121/1‑150 (MQ=255) atatACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc > 2:4631366/1‑150 (MQ=255) atatACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGc > 1:1795435/1‑150 (MQ=255) aCTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGa < 1:1351414/150‑1 (MQ=255) aCTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGa < 2:2180808/150‑1 (MQ=255) ctctAAATAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaa < 1:4103345/150‑1 (MQ=255) tctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaa > 1:3531367/1‑150 (MQ=255) ctAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGaaaa > 1:1547647/1‑150 (MQ=255) tAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAAt > 2:2728787/1‑150 (MQ=255) tAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAAt > 2:2276393/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATa > 1:790356/1‑150 (MQ=255) aataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAg < 1:2710473/150‑1 (MQ=255) aataatTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAg < 1:4371903/150‑1 (MQ=255) atTCAAATTGGTCCGTTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaa > 1:2136508/1‑150 (MQ=255) atTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaa < 2:2824961/150‑1 (MQ=255) tCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaata < 1:1123204/150‑1 (MQ=255) tCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGtaaata < 2:4521393/150‑1 (MQ=255) aTTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAg > 1:1168047/1‑150 (MQ=255) tGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGaa < 1:2954139/150‑1 (MQ=255) gTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAAcc < 1:2679465/150‑1 (MQ=255) gTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAAcc < 1:707111/150‑1 (MQ=255) gATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGcc > 1:2798119/1‑150 (MQ=255) gATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGcc > 1:3610877/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCt > 1:2573148/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCt > 2:1778556/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCt > 1:5116238/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGGGGTTATAATTCGTGCGTGGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCt > 2:2044246/1‑150 (MQ=255) | TGATTTATATAAGAGATGAGTGTATTGATGAGCGGAAATTACGAGGTGAATCACCTGAAACTGTAATAGCAATTTTTAATCGTGAACTACAGAATATATTCAACCAAGAAATAGAATAATATACTCTAAATAATTCAAATTGGTCCGATCCGGCGCAACGTCCCAATGGCCTGGATTATAAATCTCATTATCTTAATTGCAACGGGGTCCAGCCGTGGTTATAATTCGTTCGTTGGAACACGATGTTGCACAGGCTGTGGTGTTAGGCCTGAAAATAGTAAATAAAAGAACCTGCCT > CP009273/2197650‑2197946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |