| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,259,689 | C→A | 16.9% | intergenic (+188/‑35) | yeiP → / → yeiQ | elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,259,689 | 0 | C | A | 16.9% | 973.2 / 131.7 | 331 | intergenic (+188/‑35) | yeiP/yeiQ | elongation factor P‑like protein/putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (144/130); new base A (32/25); total (176/155) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCGCGCTC > CP009273/2259540‑2259838 | cTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCg < 1:3482927/150‑1 (MQ=255) cTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCg > 2:4981797/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCg > 2:1724599/1‑150 (MQ=255) tttttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgtt < 2:2068868/150‑1 (MQ=255) tttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgttgt > 2:3612297/1‑150 (MQ=255) ttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgttgtt < 2:3618152/150‑1 (MQ=255) ttAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCgttgtt > 1:1690450/1‑150 (MQ=255) aTTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGttaat < 2:1407168/150‑1 (MQ=255) tattatACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGttaattaa < 1:202296/150‑1 (MQ=255) attatACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTtaattaat < 1:531260/150‑1 (MQ=255) ttatACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATc < 2:2547264/150‑1 (MQ=255) ccAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTAc > 1:244561/1‑150 (MQ=255) ccAATCTTCTATTTTGCGCGTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTAc < 1:4137032/150‑1 (MQ=255) cAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACt > 2:3843922/1‑150 (MQ=255) aaTCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTa < 1:1214520/150‑1 (MQ=255) aaTCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTa > 2:3157925/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCTCTTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTaa < 1:4659292/150‑1 (MQ=255) aTCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTaa < 1:3583819/150‑1 (MQ=255) tcttctATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAg < 1:1087212/150‑1 (MQ=255) tcttctATTTTGCGCGTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAg < 1:2707462/150‑1 (MQ=255) ttctATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGAc > 1:3532252/1‑150 (MQ=255) ctATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGt > 2:657554/1‑150 (MQ=255) aTTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGa > 1:917058/1‑150 (MQ=255) aTTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGa > 1:3152037/1‑150 (MQ=255) ttttGCGCGTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGAc < 1:1611555/150‑1 (MQ=255) gcgcTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCt > 2:4897035/1‑150 (MQ=255) cgcTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTa < 2:1638696/150‑1 (MQ=255) gcTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTAt < 1:2753323/150‑1 (MQ=255) cTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATa > 2:93106/1‑150 (MQ=255) aaCACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACaa > 2:1393373/1‑150 (MQ=255) cacCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATc < 1:2971311/150‑1 (MQ=255) acCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCg < 1:2888995/150‑1 (MQ=255) acCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCg > 2:3253135/1‑150 (MQ=255) cTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGcc > 1:1876183/1‑150 (MQ=255) ttACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTACTATGAATACAATCGCCt > 2:4995117/1‑150 (MQ=255) aCGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTcc < 2:4299745/150‑1 (MQ=255) cccTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGTCTCCTATGAATACAATCGCCTCCGtt < 2:2314636/150‑1 (MQ=255) cccTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGtt > 1:5000540/1‑150 (MQ=255) tttCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCTTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTccc < 2:4696672/150‑1 (MQ=255) tttCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTccc > 2:1053068/1‑150 (MQ=255) tttCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTccc < 1:4283053/150‑1 (MQ=255) gattgatCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTac < 2:3872227/150‑1 (MQ=255) attgatCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTaca < 2:183237/150‑1 (MQ=255) ttgatCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTacac < 1:2540923/150‑1 (MQ=255) ccTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACg < 2:615315/150‑1 (MQ=255) acgtCATCGCATTAACAATCCAGCCCAATTTCACTTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGCCGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGa < 1:50179/147‑1 (MQ=255) acTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGa < 1:2651205/150‑1 (MQ=255) cTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGAt > 2:3373025/1‑150 (MQ=255) ttCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATc < 2:4530789/150‑1 (MQ=255) ttCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATc < 1:1525078/150‑1 (MQ=255) tCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCca < 2:2169304/150‑1 (MQ=255) gCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCcagc > 2:1166273/1‑150 (MQ=255) ttAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGt > 1:1870625/1‑150 (MQ=255) ttAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGt > 2:2484358/1‑150 (MQ=255) ttAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGt > 2:1739762/1‑150 (MQ=255) tAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGtt < 2:1534585/150‑1 (MQ=255) aaCAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTg > 1:4210365/1‑150 (MQ=255) aTCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAAt > 2:3457681/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATc < 1:1279720/150‑1 (MQ=255) tCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATc > 1:4980871/1‑150 (MQ=255) ccAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCa > 1:4091669/1‑150 (MQ=255) ccAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCa < 1:2591636/150‑1 (MQ=255) cAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCAc < 1:4053660/150‑1 (MQ=255) aGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACg > 1:3217854/1‑150 (MQ=255) gACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGt < 1:2840723/150‑1 (MQ=255) aCCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTa > 2:283828/1‑150 (MQ=255) ccAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACACCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTAt > 2:4611812/1‑150 (MQ=255) cAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATc < 2:4052525/150‑1 (MQ=255) aaTTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCg < 2:3940718/150‑1 (MQ=255) aTTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGt > 1:3360838/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCTGTCATATAACATTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGtt < 2:3289609/150‑1 (MQ=255) tCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATTCAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCa > 1:1901942/1‑150 (MQ=255) cAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCAt > 2:4618853/1‑150 (MQ=255) aaTTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCAtt > 1:2414184/1‑150 (MQ=255) aaTTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCAtt < 1:790265/150‑1 (MQ=255) tGCTGTCATATAACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTg > 1:2790588/1‑150 (MQ=255) gCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTgg < 2:967532/150‑1 (MQ=255) cTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGc > 1:4833201/1‑150 (MQ=255) tGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGTCGGGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCt > 2:2405967/1‑150 (MQ=255) gTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAAATAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATTATCGCCAGCAGTTGCAATCAAGTATCGTTAATTTTGGCtt > 1:4698940/1‑150 (MQ=255) tCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCttt < 1:4291772/150‑1 (MQ=255) cATATACCTTGACCCTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCAGGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTg < 1:2860208/150‑1 (MQ=255) cATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTg > 2:4916238/1‑150 (MQ=255) taACTTTACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGc > 2:3133001/1‑150 (MQ=255) aCTTTACACTGTCGTTGTTAATTACTCGTTACTAAGACGTGACTCCGATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCt < 1:3746373/150‑1 (MQ=255) tttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCttt > 1:4540141/1‑150 (MQ=255) tttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCttt < 1:4491386/150‑1 (MQ=255) tttACACTGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCttt < 1:3871286/150‑1 (MQ=255) ttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTc < 1:2743791/150‑1 (MQ=255) ttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTc < 1:1432865/150‑1 (MQ=255) ttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTc > 1:2102248/1‑150 (MQ=255) ttACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATAACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTc < 2:4252149/150‑1 (MQ=255) acacTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGAAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCAc < 2:2918918/150‑1 (MQ=255) cacTGTCGTTGTTAATTAATCGTAACAAATACGTGACTCCTATGAATAAAAACGCCTCCCTTACGCTCCCGCATCAAGTACACGCTCCACGCTAAGATCGCCAGACCTAGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCAcc > 2:2700125/1‑150 (MQ=255) acTGTCGTTGTTAATTAATAGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAAAACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTAAACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGGTCATTTTTGCTTTGGATCCTTTCACcg > 2:2641070/1‑150 (MQ=255) cTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgc < 2:1975651/150‑1 (MQ=255) tGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgcg > 2:4482772/1‑150 (MQ=255) tGTAGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACcgcg > 2:3377420/1‑150 (MQ=255) cGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCGCGCtc > 2:3634589/1‑150 (MQ=255) cGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCGCGCtc < 1:4938304/150‑1 (MQ=255) | CCTTTTTTAATTTATTATACCAATCTTCTATTTTGCGCTTCCTGAACACCTTACGCCCTCAATTTTCACTCGTTGATTGATCGCCCTCACACTTCATCGCATTAACAATCCAGACCAATTTCAATTGCTGTCATATAACTTTACACTGTCGTTGTTAATTAATCGTTACTAAGACGTGACTCCTATGAATACAATCGCCTCCGTTACGCTCCCGCATCATGTACACGCTCCACGCTATGATCGCCAGCAGTTGCAATCACGTATCGTTCATTTTGGCTTTGGAGCCTTTCACCGCGCTC > CP009273/2259540‑2259838 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |