| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,464,043 | A→T | 5.9% | intergenic (+102/‑251) | gtrS → / → tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,464,043 | 0 | A | T | 5.9% | 983.0 / 37.3 | 287 | intergenic (+102/‑251) | gtrS/tfaS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage/pseudogene, CPS‑53 (KpLE1) prophage; tail fiber assembly protein fragment;Phage or Prophage Related |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (152/118); new base T (9/8); total (161/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
TATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATT > CP009273/2463894‑2464191 | aaaTAATTCAAAGAAATCAATACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 2:3169094/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 1:29231/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 1:2529721/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 1:180713/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTAt > 1:525850/1‑150 (MQ=255) aataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGAGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATc > 1:2626290/1‑150 (MQ=255) ataatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCa < 1:2745634/150‑1 (MQ=255) taatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaa > 1:2982329/1‑150 (MQ=255) taatTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCaa > 1:4262318/1‑150 (MQ=255) atTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAAt > 1:1645071/1‑150 (MQ=255) ttCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATg < 1:4784225/150‑1 (MQ=255) aGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTg < 2:2283241/150‑1 (MQ=255) gAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGa > 2:642566/1‑150 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 1:4455777/1‑150 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt < 2:199503/150‑1 (MQ=255) aaaTCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGAt > 1:3591032/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCgt > 2:4004442/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 2:1376085/1‑150 (MQ=255) cAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgt > 2:457104/1‑150 (MQ=255) aGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCgttg > 1:846424/1‑150 (MQ=255) gACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCgttgt > 2:3094309/1‑150 (MQ=255) cAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTAGTGACTATCAAATGCCCTGATGCGTGGttt > 2:32810/1‑150 (MQ=255) tAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCACTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTAtt > 1:2828667/1‑150 (MQ=255) cGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTa > 1:2158869/1‑150 (MQ=255) aTGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAat < 2:2900368/150‑1 (MQ=255) aTGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAat < 2:1565487/150‑1 (MQ=255) tGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAata < 1:41715/150‑1 (MQ=255) gCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATctcct > 1:1716678/1‑150 (MQ=255) cACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATctcctc < 2:3409984/150‑1 (MQ=255) cACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATctcctc < 2:4985039/150‑1 (MQ=255) aCTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCctct < 1:4604377/150‑1 (MQ=255) cTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTa > 1:4832667/1‑150 (MQ=255) tAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTAt > 2:231981/1‑150 (MQ=255) tAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTAt > 2:5134110/1‑150 (MQ=255) aaGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATc < 2:509636/150‑1 (MQ=255) aGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCt < 1:1543301/150‑1 (MQ=255) gTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTg < 1:5014804/150‑1 (MQ=255) tAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAg > 1:2689092/1‑150 (MQ=255) aaTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGAc < 1:2225112/150‑1 (MQ=255) aaTTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGAc < 2:4884858/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGa > 1:4723420/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGAt > 2:3684165/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATa < 1:868097/150‑1 (MQ=255) gcgcCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAAc < 1:1263679/150‑1 (MQ=255) ccAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTa > 2:4306004/1‑150 (MQ=255) cAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTaa < 2:4292502/150‑1 (MQ=255) aaTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTaaa > 1:3950160/1‑150 (MQ=255) aTCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAAt < 2:2697232/150‑1 (MQ=255) cgtGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGc > 2:3571195/3‑150 (MQ=255) tGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGcat > 2:2623374/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGcat > 2:2476689/1‑150 (MQ=255) cgcgcACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGcatcat > 2:2041768/1‑150 (MQ=255) cacaAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGcc < 1:2753755/150‑1 (MQ=255) caAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCca < 1:1051449/150‑1 (MQ=255) aGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCcaca > 2:1860282/1‑150 (MQ=255) aataCCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAATTGCATCATTGCCCACAACAAAc > 2:2971453/1‑150 (MQ=255) taCCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAAccc > 1:2321081/1‑150 (MQ=255) ccAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAAccccc > 1:362919/1‑150 (MQ=255) cAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCt > 1:1361479/1‑150 (MQ=255) aaCCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTc > 2:1332954/1‑150 (MQ=255) ccTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCa < 1:698711/150‑1 (MQ=255) cTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAg < 2:1743565/150‑1 (MQ=255) tAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGa > 2:1674750/1‑150 (MQ=255) tAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGa > 1:606679/1‑150 (MQ=255) ttCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGAGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCa > 1:4918017/1‑150 (MQ=255) cctcctcTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTg > 2:4400215/1‑150 (MQ=255) tcctcTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCt > 2:3887864/1‑150 (MQ=255) cctcTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTg > 2:145117/1‑150 (MQ=255) tctTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGat > 2:4148727/1‑150 (MQ=255) ttAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGatat < 2:1146103/150‑1 (MQ=255) tAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGAtatt < 2:2778538/150‑1 (MQ=255) tAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGAtatt < 1:1132498/150‑1 (MQ=255) agagTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGAtatta < 2:763686/150‑1 (MQ=255) gagTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGAtattat < 2:3208292/150‑1 (MQ=255) gTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTatca > 1:4650042/1‑150 (MQ=255) tGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTatcat < 1:920558/150‑1 (MQ=255) tataTCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAAc > 1:3429133/1‑150 (MQ=255) tataTCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAAc < 1:3908319/150‑1 (MQ=255) atatCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACa < 1:3399265/150‑1 (MQ=255) atatCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACa > 1:2106935/1‑150 (MQ=255) atatCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACa < 1:4101207/150‑1 (MQ=255) tatCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAg < 2:3472946/150‑1 (MQ=255) atCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGt < 2:1825394/150‑1 (MQ=255) tcCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTgat < 1:3103771/150‑1 (MQ=255) tcCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTgat < 1:4659290/150‑1 (MQ=255) ccTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTgata > 1:3462247/1‑150 (MQ=255) cTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTgatag < 2:2594097/150‑1 (MQ=255) aGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACa > 1:2474709/1‑150 (MQ=255) gAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACat > 1:3030220/1‑150 (MQ=255) agtGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACatat < 2:4866989/148‑1 (MQ=255) aTTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACatat < 1:749698/150‑1 (MQ=255) tGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATAc > 2:1902285/1‑150 (MQ=255) tGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATAc < 2:1219514/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTa > 1:1483818/1‑150 (MQ=255) ggTATTGACTATCAAATGCCCTGATTAGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTaa < 1:3169094/150‑1 (MQ=255) tATTGTCTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACt < 2:3746962/150‑1 (MQ=255) aTTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTg < 1:1951570/150‑1 (MQ=255) ttGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGa > 2:462604/1‑150 (MQ=255) ttGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGa < 1:951234/150‑1 (MQ=255) gACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGAtt > 1:3507305/1‑150 (MQ=255) | TATAAAATAATTCAAAGAAATCAAGACAATAGCGATGTAAAGCACTAAGTTTAAATTGCGCGCCAATCATGGCGCGCACAAGCTATAATACCAACCTAATTTCTCCTCCTCTTAGAGTGACTATATCTCCTGATAGAATTGCGGTATTGACTATCAAATGCCCTGATTCGTTGTTTATTGTAATATCTCCTCTATCTGCAGACGATAACTTAAATGCATCATTGCCCACAACAAACCCCCTCCAGAACCAAGTGCTGATATTATCATCAACAGTGATAGATACATATACTAACTGATT > CP009273/2463894‑2464191 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |