| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,680,236 | T→A | 10.2% | L348Q (CTG→CAG) | hmp → | fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,680,236 | 0 | T | A | 10.2% | 1048.9 / 86.6 | 322 | L348Q (CTG→CAG) | hmp | fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (123/166); new base A (16/17); total (139/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 | |||||||||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
TGGCGATGTTCACGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAAT > CP009273/2680087‑2680385 | gCGATGTTCACGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGACAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTgg < 2:72406/150‑1 (MQ=255) aTGTTCACGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAg < 2:1437285/150‑1 (MQ=255) aTGTTCACGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAg < 2:4394172/150‑1 (MQ=255) ttCACGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTg < 2:4574364/150‑1 (MQ=255) aCGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGt < 1:4974215/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCa < 2:240628/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCa < 1:4708905/150‑1 (MQ=255) ccTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCa < 1:2411730/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAg < 2:413648/150‑1 (MQ=255) tttGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGc > 1:3686375/1‑150 (MQ=255) tttGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGc > 1:2589884/1‑150 (MQ=255) ttGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCg < 1:1863428/150‑1 (MQ=255) gCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGAt > 1:2622199/1‑150 (MQ=255) cGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATcc < 1:1970961/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATcc < 1:1039784/150‑1 (MQ=255) gATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCg > 2:1923273/1‑150 (MQ=255) gATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCg > 2:1723528/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGa > 1:1663108/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGa < 2:639070/150‑1 (MQ=255) aTGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGa > 2:2743842/1‑150 (MQ=255) gAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCCCACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCGGATGGAGTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACa > 2:1798543/1‑150 (MQ=255) aaGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACaa < 2:340220/150‑1 (MQ=255) aGTGAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAAt < 1:2839774/150‑1 (MQ=255) tAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCa > 1:1187393/1‑150 (MQ=255) aaGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAg > 1:3376378/1‑150 (MQ=255) ggAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGtt < 1:4435666/150‑1 (MQ=255) gAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTc < 1:4004061/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCt > 1:5142561/1‑150 (MQ=255) ggggCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTAtct > 2:2573658/1‑150 (MQ=255) gCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTg > 1:344740/1‑150 (MQ=255) cAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGc > 1:1420418/1‑150 (MQ=255) cAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGc < 1:1138098/150‑1 (MQ=255) aGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCg < 2:1520762/150‑1 (MQ=255) aGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCg < 2:2268231/150‑1 (MQ=255) aGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCg > 1:203590/1‑150 (MQ=255) gTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCgg < 1:4316364/150‑1 (MQ=255) gTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCgg < 2:4203396/150‑1 (MQ=255) tCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGc < 1:4680649/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGccc < 1:1329885/150‑1 (MQ=255) ccGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGtt > 2:3382218/1‑150 (MQ=255) gcTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCt > 2:3045725/1‑150 (MQ=255) gcTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCt < 1:3760068/150‑1 (MQ=255) gcTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCt > 2:1980159/1‑150 (MQ=255) gcTTTACCGCGCACACCTGGGATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTCAAGGTCAGTGTGATCGCGCCGGTCGGAGGGAGTGGAGCACACTGGCCGGGGCGTTCCGCGAGCCGACCATGCCGGGCGATCTCTGCGGCCCGGGTGGcg > 2:4140944/1‑149 (MQ=255) tACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCAt < 2:3010873/150‑1 (MQ=255) cgcACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGt > 1:2362692/1‑150 (MQ=255) gcACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGtt > 1:3204629/1‑150 (MQ=255) cacaCCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGttt < 1:1690489/150‑1 (MQ=255) cacCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAACGTCAGTTGGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTAc < 1:4818645/150‑1 (MQ=255) acCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTAcc < 1:3128941/150‑1 (MQ=255) acCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTAcc < 2:2141680/150‑1 (MQ=255) ccTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACcg < 2:3669671/150‑1 (MQ=255) cTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACcgc > 1:4041298/1‑150 (MQ=255) tGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACcgcg > 1:65490/1‑150 (MQ=255) ccGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTg > 2:4462655/1‑150 (MQ=255) ccGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTg < 1:2743842/150‑1 (MQ=255) cGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTgg > 2:4680631/1‑150 (MQ=255) cGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTgg < 2:4980998/150‑1 (MQ=255) gAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGa > 1:303319/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTAATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGAt < 2:5144682/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCt < 1:1261759/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTg > 1:1134452/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTg < 2:917458/150‑1 (MQ=255) aaGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTgg > 2:896521/1‑150 (MQ=255) aGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTggg < 2:4212734/150‑1 (MQ=255) aGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTggg > 2:4015612/1‑150 (MQ=255) aGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTggg > 2:3487993/1‑150 (MQ=255) ccGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCg > 1:2869016/1‑150 (MQ=255) cGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGt > 2:4121719/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGa > 1:364960/1‑150 (MQ=255) tCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGaa < 1:383217/150‑1 (MQ=255) cgcgCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAg < 2:2622199/150‑1 (MQ=255) cgcgCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAg < 2:3744834/150‑1 (MQ=255) cgcTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCa < 1:2757980/150‑1 (MQ=255) tAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGa < 2:4425266/150‑1 (MQ=255) aaGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGaaa < 2:4908607/150‑1 (MQ=255) ggTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAc > 1:3917782/1‑150 (MQ=255) ggTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAc > 1:3058054/1‑150 (MQ=255) aGTTTTATTGCTAATGTCTGTTGGATTTGAGAAATATGTAAGGTGCGTTCTGAGATCCTACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCTGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcatta < 2:2685113/150‑2 (MQ=255) aGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcattc < 2:3578704/150‑1 (MQ=255) aGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcattc < 1:5050513/150‑1 (MQ=255) aGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcattc < 2:2837946/150‑1 (MQ=255) tttGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcattcat > 1:837279/1‑150 (MQ=255) tttGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcattcat < 2:3901995/150‑1 (MQ=255) ttGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAcattcatt < 2:2596592/150‑1 (MQ=255) tGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTa < 1:937578/150‑1 (MQ=255) tAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGa < 2:1090299/150‑1 (MQ=255) gCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAAt < 1:1723528/150‑1 (MQ=255) cGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATg > 1:3335386/1‑150 (MQ=255) ggTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCttt < 1:2180067/150‑1 (MQ=255) gTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTg < 2:3705983/150‑1 (MQ=255) gTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTg < 1:1555447/150‑1 (MQ=255) tCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTgg < 1:4201611/150‑1 (MQ=255) ggATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCa > 2:3335836/1‑150 (MQ=255) gATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCAt < 2:1147488/150‑1 (MQ=255) gAGCAAACAGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGt > 2:4753062/1‑150 (MQ=255) gCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGc < 1:4267666/150‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGt > 2:1899827/1‑150 (MQ=255) aCTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTa > 1:4602677/1‑150 (MQ=255) tGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAAt > 2:3166630/1‑150 (MQ=255) | TGGCGATGTTCACGCCTTTGCCGATGAAGTTAAGGAACTGGGGCAGTCACTGCCGCGCTTTACCGCGCACACCTGGTATCGTCAGCCGAGCGAAGCCGATCGCGCTAAAGGTCAGTTTGATAGCGAAGGTCTGATGGATTTGAGCAAACTGGAAGGTGCGTTCAGCGATCCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAAT > CP009273/2680087‑2680385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |