| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,808,646 | G→T | 17.4% | R385S (CGC→AGC) | gshA ← | glutamate‑cysteine ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,808,646 | 0 | G | T | 17.4% | 833.9 / 117.5 | 278 | R385S (CGC→AGC) | gshA | glutamate‑cysteine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (116/113); new base T (17/32); total (133/145) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.80e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 278 total aligned reads displayed.
TCACACACTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAATCGGCGAGAACGGG > CP009273/2808498‑2808794 | cacTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTc < 2:3654488/150‑1 (MQ=255) acTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCg < 1:4922225/150‑1 (MQ=255) acTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCg > 2:4612165/1‑150 (MQ=255) acTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCg < 2:3036330/150‑1 (MQ=255) cTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGa > 1:585909/1‑150 (MQ=255) cTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGa < 1:2522520/150‑1 (MQ=255) cTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGa < 1:2481984/150‑1 (MQ=255) tttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAg < 2:3676712/150‑1 (MQ=255) ttCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAgg > 2:1839148/1‑150 (MQ=255) tCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGa > 2:4079644/1‑150 (MQ=255) tCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGa > 2:1518978/1‑150 (MQ=255) tGATACGCGTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATc < 2:2711874/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCGGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCAccc < 1:1094345/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCAccc > 2:1704251/1‑150 (MQ=255) aCGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCAccc > 1:3133995/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCg > 1:5135850/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTc < 1:708206/150‑1 (MQ=255) cgccgcCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTcc > 1:1364226/1‑150 (MQ=255) cgccgcCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTcc > 1:3659759/1‑150 (MQ=255) cgccgGTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTGTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGGAACGGGACCTGTGCGGTGTCGCAGCCGATACCCAGCGGCAGACCCGGGTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTGCCCGt > 2:186487/1‑150 (MQ=255) gccgTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGtt < 2:111429/150‑1 (MQ=255) cgTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTaa > 1:4227064/1‑150 (MQ=255) aTACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCgt > 1:4476715/1‑150 (MQ=255) aCTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCAACCGGTTCCAGTTAACGCgtgt > 2:3964929/1‑150 (MQ=255) tATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCTTGTAc < 2:4270363/150‑1 (MQ=255) tATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTAc < 1:1104507/150‑1 (MQ=255) tATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTAc < 1:3725927/150‑1 (MQ=255) ccAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAgg > 1:3849742/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGc < 1:2880680/150‑1 (MQ=255) cAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGc < 1:2274545/150‑1 (MQ=255) cAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGc > 1:1897262/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGt > 2:2002546/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGt > 2:4699722/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGt > 1:49904/1‑150 (MQ=255) gTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGt < 2:2247077/150‑1 (MQ=255) cgcgACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCt < 1:1419728/150‑1 (MQ=255) cgACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTAc > 1:4714349/1‑150 (MQ=255) gACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACt < 2:387715/150‑1 (MQ=255) gACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACt < 2:1627714/150‑1 (MQ=255) aCGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTg < 1:2064337/150‑1 (MQ=255) gcgTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCAGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCt < 1:874921/150‑1 (MQ=255) cgTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTc < 2:914170/150‑1 (MQ=255) cgTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTc > 2:315896/1‑150 (MQ=255) ttCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCAtt < 2:4804626/150‑1 (MQ=255) tCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCAttt > 2:59582/1‑150 (MQ=255) cAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTc > 2:2929125/1‑150 (MQ=255) aGATCGCGGCACAGATCTGTCCCCCCCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGGTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTcc < 2:3260901/150‑1 (MQ=255) aGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTcc > 2:309126/1‑150 (MQ=255) gATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCg < 1:1153034/150‑1 (MQ=255) aTCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCgg > 2:3640170/1‑150 (MQ=255) aTCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCgg > 2:28187/1‑150 (MQ=255) cgcgGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTg > 2:3903814/1‑150 (MQ=255) cgcgGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTg < 2:3854986/150‑1 (MQ=255) cgcgGAACAGATCTTTACACACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCTCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGTGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACTGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTg < 2:2200723/150‑1 (MQ=255) tCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATcagccagc < 1:3230861/150‑1 (MQ=255) tttACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAgcgc < 2:3338233/150‑1 (MQ=255) ttACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGca < 1:3430594/150‑1 (MQ=255) aCCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGcaca > 2:2376972/1‑150 (MQ=255) ccACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACAcc < 1:1780083/150‑1 (MQ=255) cACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCa < 1:636482/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGAc > 1:4548028/1‑150 (MQ=255) tGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGAcc < 1:1463045/150‑1 (MQ=255) gCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCa < 2:4945383/150‑1 (MQ=255) ggTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATa < 2:3688029/150‑1 (MQ=255) ggTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATa > 2:4372386/1‑150 (MQ=255) gTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATaa < 2:2055667/150‑1 (MQ=255) gTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATaa < 2:1157890/150‑1 (MQ=255) gTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATaa < 2:1322745/150‑1 (MQ=255) tAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATaaa > 1:4178896/1‑150 (MQ=255) gggAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAgg > 1:791475/1‑150 (MQ=255) ggAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGt > 1:2315466/1‑150 (MQ=255) gAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTc < 2:4916126/150‑1 (MQ=255) aCTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGa < 2:1455127/150‑1 (MQ=255) aCTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGa < 2:4810413/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAg < 1:4760388/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAg > 1:2812695/1‑150 (MQ=255) cGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATc < 2:4533246/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATc < 1:172032/150‑1 (MQ=255) cGGGTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATc < 2:3548435/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGc < 2:1913572/150‑1 (MQ=255) tttCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCa > 1:2776269/1‑150 (MQ=255) ttCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCAc > 1:2176615/1‑150 (MQ=255) tCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCAcc > 2:681760/1‑150 (MQ=255) cGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACct < 2:1727659/150‑1 (MQ=255) cAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTTCAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATCAACAGGTCGAGGAATCGCACctgc > 1:953084/1‑150 (MQ=255) cAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACctgc > 1:3520362/1‑150 (MQ=255) aaaCCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTACCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGACTCGCACCTCCTGTACa > 1:4314265/3‑150 (MQ=255) aTACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCa > 1:4422681/1‑150 (MQ=255) ccAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTa < 2:2596061/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTaca > 1:4663895/1‑150 (MQ=255) gTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGACTCGCACCTGCTGTTCATCTACACCa > 2:3532235/1‑150 (MQ=255) gTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCa > 2:1600475/1‑150 (MQ=255) tCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCaa > 2:1184356/1‑150 (MQ=255) tCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCaa < 2:1050486/150‑1 (MQ=255) cAGACCCGGTTTGCTACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAAt > 2:3728316/1‑150 (MQ=255) cAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAAt > 2:216618/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAATCgg < 2:1560486/150‑1 (MQ=255) cGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAATCGGCga < 1:4867822/150‑1 (MQ=255) tgTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAATCGGCgag > 1:2745049/2‑150 (MQ=255) tttGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAATCGGCGAGaa > 1:2856633/1‑150 (MQ=255) | TCACACACTTTCTGATACGCTTCGCCGCCGTTAATACTATCCAGCGTTTGCGCGACGCGTTTCAGATCGCGGAACAGATCTTTACCCACCTGCGGTAACGGGAACTGTGCGGTTTCGCAGCCGATACCCAGCGTCAGACCCGGTTTGCGACCTTCGAGGATCACCCGGTTCCAGTTAACGCGTGTACAGGCAAGTTCGCTACTGCTCATTTCCGGTGCATCAGCCAGCGCACACCAGACCATAAACAGGTCGAGGAATCGCACCTGCTGTTCATCTACACCAATCGGCGAGAACGGG > CP009273/2808498‑2808794 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |