Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 2,931,717 | C→A | 100% | N307K (AAC→AAA) | fucK → | L‑fuculokinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 2,931,717 | 0 | C | A | 96.3% | 998.8 / 23.9 | 297 | N307K (AAC→AAA) | fucK | L‑fuculokinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/10); new base A (154/132); total (155/142) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.02e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TTGGCGCTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAACCCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAGTGTGATTTATT > CP009273/2931569‑2931863 | tGGCGCTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAacc < 2:3464898/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAacc < 2:5016743/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCa < 1:990678/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAgg < 2:1612022/150‑1 (MQ=255) gcTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGt < 2:3381182/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAACCCAGGTa < 2:877056/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTAt < 1:4514305/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCaa > 1:552260/1‑150 (MQ=255) cTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGGTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGGACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAACCCAGGTATGCAAt < 1:4448367/150‑1 (MQ=255) tGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAAtg > 2:2199125/1‑150 (MQ=255) gAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAAtgg > 1:2600317/1‑150 (MQ=255) aCAATATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAAtggct < 2:2874992/150‑1 (MQ=255) cAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAAtggctg > 2:1712593/1‑150 (MQ=255) aaaaTGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAAtggctgg > 1:1069812/1‑150 (MQ=255) aTGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAACCCAGGTATGCAATGGCTGGCAt < 2:4816193/150‑1 (MQ=255) gAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATcc < 1:3059621/150‑1 (MQ=255) aaCCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCg > 1:4671852/1‑150 (MQ=255) aaCCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCg > 2:3919023/1‑150 (MQ=255) cGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGt < 1:1800624/150‑1 (MQ=255) gCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCt > 1:2467708/1‑150 (MQ=255) gCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCt < 1:4597533/150‑1 (MQ=255) ctctctTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTg < 1:2437500/150‑1 (MQ=255) tctctTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCACTGGCTGGCATCCGGCGTGCTgg > 2:3189819/1‑150 (MQ=255) ctctTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGa < 1:1947837/150‑1 (MQ=255) ccGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATggg < 1:2322431/150‑1 (MQ=255) gTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTga < 1:1734591/150‑1 (MQ=255) aCATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTgaga > 1:1203053/1‑150 (MQ=255) cATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATACACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGaa > 2:717774/1‑150 (MQ=255) gggAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAAc < 1:1558819/150‑1 (MQ=255) gggAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAAc < 1:4903906/150‑1 (MQ=255) aTTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTc > 2:307528/1‑150 (MQ=255) aTTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTc > 2:1295070/1‑150 (MQ=255) ttttAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCt < 2:3786367/150‑1 (MQ=255) ttttAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCt < 1:4832843/150‑1 (MQ=255) ttttAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCt < 1:3970244/150‑1 (MQ=255) ttttAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCt < 1:3708715/150‑1 (MQ=255) tttAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTg > 2:2068893/1‑150 (MQ=255) ttAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTgg < 1:3558700/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGc > 2:598246/1‑150 (MQ=255) ttCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTg < 1:2044/150‑1 (MQ=255) ttCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTg > 2:3581241/1‑150 (MQ=255) tCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGa < 1:4323283/150‑1 (MQ=255) cGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGaa > 1:2148560/1‑150 (MQ=255) gCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGaaa < 1:622644/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAac > 1:816306/1‑150 (MQ=255) gcCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACAccc < 2:761041/150‑1 (MQ=255) cccAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAGACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCt > 1:849539/1‑150 (MQ=255) ggTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCa > 2:2246299/1‑150 (MQ=255) gTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCaa < 1:3254298/150‑1 (MQ=255) ttGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCaaa > 2:3773919/1‑150 (MQ=255) tACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGtt < 1:1268022/150‑1 (MQ=255) tACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGtt < 1:4956414/150‑1 (MQ=255) cTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGttga > 1:3189380/1‑150 (MQ=255) 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ggTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACTGCTGAAACACCCTGGAAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATcgcg > 2:4497765/1‑150 (MQ=255) ggTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATcgcg > 2:1942829/1‑150 (MQ=255) ggTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATcgcg > 1:13629/1‑150 (MQ=255) ttCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAACCCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGcc < 1:1011716/150‑1 (MQ=255) tCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCt < 2:2921936/150‑1 (MQ=255) 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tGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCg < 2:4188530/150‑1 (MQ=255) gATAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTa > 1:4174017/1‑150 (MQ=255) aTAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGATTGGGTGAGAAATCTTTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCTTaa < 1:2640869/150‑1 (MQ=255) tAGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTaaa < 1:2892593/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTaaaa > 1:714394/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTaaaa > 1:1797016/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTaaaa > 1:714270/1‑150 (MQ=255) ccAGGCAGGGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAAt < 2:4745801/150‑1 (MQ=255) caggcaggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATg < 1:3353372/150‑1 (MQ=255) aggcaggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGc < 1:3754265/150‑1 (MQ=255) ggcaggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGGTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCa > 2:2074289/1‑150 (MQ=255) gcaggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAg < 2:233979/150‑1 (MQ=255) caggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAgt > 1:3650326/1‑150 (MQ=255) aggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAgtg < 1:1583730/150‑1 (MQ=255) aggGTTGTATAAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAgtg < 2:297124/150‑1 (MQ=255) 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tataAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAGTGTGATTTa > 1:1850834/1‑150 (MQ=255) tataAACCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAGTGTGATTTa > 1:4155192/1‑150 (MQ=255) | TTGGCGCTGGTGCTGAACAAAATGAACCCGTGCTCTCTTCCGGTACATGGGAAATTTTAATGGTTCGCAGCGCCCAGGTTGATACTTCGCTGTTAAGTCAGTACGCCGGTTCCACCTGCGAACTGGATAGCCAGGCAGGGTTGTATAACCCAGGTATGCAATGGCTGGCATCCGGCGTGCTGGAATGGGTGAGAAAACTGTTCTGGACGGCTGAAACACCCTGGCAAATGTTGATTGAAGAAGCTCGTCTGATCGCGCCTGGCGCGGATGGCGTAAAAATGCAGTGTGATTTATT > CP009273/2931569‑2931863 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |