| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 2,964,899 | 0 | C | A | 7.6% | 891.8 / 34.6 | 238 | intergenic (+51/‑57) | ygdR/tas | DUF903 family verified lipoprotein/putative NADP(H)‑dependent aldo‑keto reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (118/101); new base A (2/16); total (121/117) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
GAAATTGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCTTTCCCTTTTCCCTTCCCTCTGCCATTTTTATATTCCTTATGTCGTGATTATAAAAAGGAAACGGCTATGCAATATCACCGTATACCCCACAGTTCGCTGGAAGTCAGCACGCTGGGGCTTGGCACGATGACGTTTGGTGAACAGAACAGCGAAGCCGAC > CP009273/2964750‑2965048 | gAAATTGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttc > 1:3539696/1‑150 (MQ=255)gAAATTGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcacttttc > 1:1120090/1‑150 (MQ=255) aTTGATGATGATACCGGGCTGGTGAGTTATCACGATCAGCAAGGTAACGCGATGCAAATTAACCGTGATGATGTTTCGCAAATTATTGAACGTTAACAAATAAGGTCAGCATCCGGCTGGCCTTAAGATTTTTCTCtttcccttttccct > 1:900274/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |