| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,072,314 | C→A | 18.3% | E126* (GAA→TAA) | cmtB ← | putative mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,072,314 | 0 | C | A | 18.3% | 920.8 / 144.1 | 314 | E126* (GAA→TAA) | cmtB | putative mannitol‑specific enzyme IIA component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (123/133); new base A (30/28); total (153/161) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
AGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGGTT > CP009273/3072165‑3072462 | aaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttctt < 2:4088886/150‑1 (MQ=255) aaaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttctt < 2:2519580/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttcttc < 2:582689/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttcttc < 2:1161574/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATttcttcttc < 2:32049/150‑1 (MQ=255) cccccAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGcac < 2:1566518/150‑1 (MQ=255) ccccAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGcaca > 1:191180/1‑150 (MQ=255) aaGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAAtt < 2:3398656/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAAtt < 2:4847976/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTc < 1:4182711/150‑1 (MQ=255) tGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCTCtt < 1:440802/150‑1 (MQ=255) tGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACtt < 1:3145703/150‑1 (MQ=255) tGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACtt < 1:904565/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGCACGAGCATACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAAc < 1:4908945/150‑1 (MQ=255) aCCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAAc < 2:1858893/150‑1 (MQ=255) cTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGc < 1:2416935/150‑1 (MQ=255) cTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGc > 1:667490/1‑150 (MQ=255) ttGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCt > 1:2840767/1‑150 (MQ=255) cACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGaa > 1:4171513/1‑150 (MQ=255) gAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAg < 2:71846/150‑1 (MQ=255) gCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAgcg > 1:4853534/1‑150 (MQ=255) aCTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCaa > 1:1479345/1‑150 (MQ=255) cTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAAt > 1:215559/1‑150 (MQ=255) ttGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAAtg < 2:2219755/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAAtg > 1:5082651/1‑150 (MQ=255) tGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAAtgt < 1:2051980/150‑1 (MQ=255) tttCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCg < 1:1390781/150‑1 (MQ=255) tttCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATACGAGGCTGATAATGGCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTAGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGACTGAATAGCGCCAATGTGCg > 1:4846894/1‑150 (MQ=255) ttCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGa < 2:2320876/150‑1 (MQ=255) ttCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGa < 1:2570348/150‑1 (MQ=255) tCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGaa < 2:83312/150‑1 (MQ=255) ccATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAat < 2:1312461/150‑1 (MQ=255) taataTTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAatcgg > 2:3227844/1‑150 (MQ=255) tCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAAtcggcatcggca > 1:1022707/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcag < 2:4817411/150‑1 (MQ=255) tGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcagca > 2:4266536/1‑150 (MQ=255) tGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGgcagca < 1:1659669/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGcagcag > 2:2004058/1‑150 (MQ=255) tAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCaga < 1:1272044/150‑1 (MQ=255) agagGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCagag < 1:322615/150‑1 (MQ=255) gaggagAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCagaga < 2:896088/150‑1 (MQ=255) ggagAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGt < 2:922015/150‑1 (MQ=255) gagagaGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTc > 1:2508329/1‑150 (MQ=255) agagagTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTcc < 2:235001/150‑1 (MQ=255) gagTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGAt > 1:953960/1‑150 (MQ=255) tATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaat > 1:3777873/1‑150 (MQ=255) tATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaat > 2:4981164/1‑150 (MQ=255) aTCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatt > 1:123693/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaattta > 1:1044373/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaa > 1:78888/1‑150 (MQ=255) cgcgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaa > 1:2320766/1‑150 (MQ=255) cgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaatt < 1:3277309/150‑1 (MQ=255) cgGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGtaatttaatt > 1:4245842/1‑150 (MQ=255) ggCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTg > 1:1805416/1‑150 (MQ=255) ggCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTg > 1:3774135/1‑150 (MQ=255) gCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTgg < 2:3585581/150‑1 (MQ=255) cTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGt > 2:3269994/1‑150 (MQ=255) gATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTc < 1:4646596/150‑1 (MQ=255) gATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTc < 1:2231742/150‑1 (MQ=255) gATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTc < 2:1275954/150‑1 (MQ=255) aaTGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTc > 2:2880683/1‑150 (MQ=255) tGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCAt < 2:4738941/150‑1 (MQ=255) gTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCAtt < 2:1444864/150‑1 (MQ=255) gCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTcccc > 2:1720376/1‑150 (MQ=255) gCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTcccc > 2:3335822/1‑150 (MQ=255) cTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCg < 1:110260/150‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGa > 2:3019590/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGa < 2:4943078/150‑1 (MQ=255) aaTTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGa > 1:4237025/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGaa < 1:2995694/150‑1 (MQ=255) tGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGaaaa < 1:521634/150‑1 (MQ=255) ttttCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATaa < 2:4601380/150‑1 (MQ=255) ttttCTGAAGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATaa > 1:2980078/1‑150 (MQ=255) ttCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAac < 1:457877/150‑1 (MQ=255) ttCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAac < 2:1749778/150‑1 (MQ=255) tCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAaca < 1:3495414/150‑1 (MQ=255) tgatgaTGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACAcc < 1:4076512/150‑1 (MQ=255) gaagatgCTGTTAATAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCt < 2:3921711/147‑1 (MQ=255) tgatgCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTg < 1:260860/150‑1 (MQ=255) gCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCa > 2:839684/1‑150 (MQ=255) gCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCa > 2:4482326/1‑150 (MQ=255) cTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa > 1:570805/1‑150 (MQ=255) cTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCaa < 2:238970/150‑1 (MQ=255) tAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTaa < 1:4510768/150‑1 (MQ=255) aaGAGTTGTTCGAGTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAAt > 1:2775042/1‑150 (MQ=255) agagTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATg < 2:27985/150‑1 (MQ=255) gagTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGt > 1:4030905/1‑150 (MQ=255) tgttCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCaaa > 1:5086220/1‑150 (MQ=255) cGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACa > 2:2496150/1‑150 (MQ=255) cGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACa > 2:2188364/1‑150 (MQ=255) gTATTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATcc > 1:4328526/1‑150 (MQ=255) aTTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCg > 2:3759365/1‑150 (MQ=255) aTTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCg > 1:3568685/1‑150 (MQ=255) aTTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCg < 2:2574818/150‑1 (MQ=255) aTTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCg > 2:2951579/1‑150 (MQ=255) aTTTATTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCg < 2:5117087/150‑1 (MQ=255) tttCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCgg > 2:3440825/1‑150 (MQ=255) ttcttcttcGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGGt > 2:4684561/1‑150 (MQ=255) ttcttcttcGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGGt > 2:550723/1‑150 (MQ=255) tcttcttcGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGGtt > 1:2579272/1‑150 (MQ=255) | AGTCAAAAAGCCCCCAAAAGCCTGGACCTTTGCACGAGCAGACTTGTTTTCCATAATATTATCCTGTAGAGGAGAGAGTAATTATCCGCGGCTGATAATGTCCGCTAATTGTTTTTCTGATGATGCTGTTAAGAGTTGTTCGAGTATTTCTTCTTCGCACAGTAATTCACTTAACGCCTGAATAGCGCCAATGTGCGAATCGGCATCGGCAGCAGAGAGTCCGATGAGTAATTTAATTGGTTCGTCATTCCCCGGAAAATAAACACCTTGTTCAAGTAATGTCAAAGACATCCCGGTT > CP009273/3072165‑3072462 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |