| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 289,036 | G→T | 5.5% | I198I (ATC→ATA) | yagL ← | CP4‑6 prophage; DNA‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 289,036 | 0 | G | T | 5.5% | 1085.0 / 25.7 | 274 | I198I (ATC→ATA) | yagL | CP4‑6 prophage; DNA‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (124/135); new base T (8/7); total (132/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.93e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
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aaTCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGAATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCACTCAAAAAAGACAAg > 1:1644682/1‑150 (MQ=255) tCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCa < 1:4870248/150‑1 (MQ=255) ccACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCaa < 1:3886608/150‑1 (MQ=255) ccTTTCTTAAGTATTGTTATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACtt < 1:1935235/150‑1 (MQ=255) tttCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTc > 1:3400402/1‑150 (MQ=255) 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gtgATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGctct > 2:3298709/1‑150 (MQ=255) tgATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTa > 1:369317/1‑150 (MQ=255) | CTGTGATGGCTGTTAAAAAGTTACTCTGCAATTAGCTTCTGGAATTAACCGATGATTCCGTTATTCCAGTGCCGCTTCACAGTCGATAAACTGATACTCAATTTCTTTGCAATCTCAGCCTGAGTAAATCCACCTTTCTTAAGTATTGTGATATCACGTCGGTATTTGCTTCCCTCCTTTCGTCCTAATTTTTTCTTAACATGTCGATATCGGCTTTTAGTTGATTTCAGATTGTGAATGTCAATCGTATCCTGACGAGCAATCAAAAAAGACAAGCAACTTTCAGCAGAAGGCTCTA > CP009273/288887‑289184 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |