| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,274,047 | T→A | 5.2% | *158R (TGA→AGA) | agaV → | N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIB component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,274,047 | 0 | T | A | 5.2% | 1067.3 / 31.6 | 315 | *158R (TGA→AGA) | agaV | N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIB component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (172/125); new base A (9/8); total (182/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 331 total aligned reads displayed.
ACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCT > CP009273/3273898‑3274196 | aCTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACttt > 2:2296082/1‑150 (MQ=255)aCTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACttt < 2:3169430/150‑1 (MQ=255)aCTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACttt > 1:899751/1‑150 (MQ=255) tACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGa > 1:3239002/1‑150 (MQ=255) cGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAgg < 2:2967501/150‑1 (MQ=255) cAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGAt < 2:3844611/150‑1 (MQ=255) aTGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGTAAACCGCTGGGGTGGTATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATtc < 1:3394340/150‑1 (MQ=255) aTGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATtc < 1:5122108/150‑1 (MQ=255) ggCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATtcat > 1:424302/1‑150 (MQ=255) cAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATtcatca > 1:2833341/1‑150 (MQ=255) cAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATtcatca > 1:1470934/1‑150 (MQ=255) aacaacAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATg > 1:444582/1‑150 (MQ=255) aacaacAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATg < 1:850788/150‑1 (MQ=255) aaaTCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATc > 2:1747202/1‑150 (MQ=255) aaTCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCa > 2:3786723/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAg < 2:1421226/150‑1 (MQ=255) gCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCt > 2:483455/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGtt > 2:1030126/1‑150 (MQ=255) aaCGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGc > 2:1760265/1‑150 (MQ=255) aaCGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTGAGAGGGATTCATCTTGGAAATCAGCCTGTTGc < 2:4948630/150‑1 (MQ=255) ggTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAgg < 2:3590571/150‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCAttt < 2:3087409/150‑1 (MQ=255) gtgGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGc > 2:4504370/1‑150 (MQ=255) tgGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCg < 1:2930160/150‑1 (MQ=255) tgGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTAGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCg < 1:1314057/150‑1 (MQ=255) gATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGtt < 2:714617/150‑1 (MQ=255) gATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGtt > 2:4054050/1‑150 (MQ=255) aTGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTg > 1:3733097/1‑150 (MQ=255) tGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTgg < 1:1268820/150‑1 (MQ=255) tGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTgg > 1:4054888/1‑150 (MQ=255) ggCGATATCGCAGCATTTATCGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCAt < 2:3210259/150‑1 (MQ=255) ggCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCAt < 1:725288/150‑1 (MQ=255) cGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTa > 2:2820309/1‑150 (MQ=255) cGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTa < 2:2097486/150‑1 (MQ=255) atatCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATc < 1:3932186/150‑1 (MQ=255) tatCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCg > 2:4102363/1‑150 (MQ=255) tCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGcc > 1:2311720/1‑150 (MQ=255) cagcaTTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCttt < 2:1374910/150‑1 (MQ=255) agcaTTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTa < 1:3453629/150‑1 (MQ=255) agcaTTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTa > 2:1941382/1‑150 (MQ=255) gcaTTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTAt < 2:3469439/150‑1 (MQ=255) tAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTg < 1:2279118/150‑1 (MQ=255) gACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCt < 2:573363/150‑1 (MQ=255) aaaCCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATg > 1:2328961/1‑150 (MQ=255) aaaCCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATg < 2:4983003/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGt < 2:1713113/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGt > 2:4629886/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGGGTGGAATGCGTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGttt < 2:4067783/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTaa > 2:1575127/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACg < 2:2461728/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACg > 1:3153486/1‑150 (MQ=255) ggggTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACgg > 1:1372065/1‑150 (MQ=255) gTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCt < 1:4547756/150‑1 (MQ=255) tGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTAGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTa > 2:2650693/1‑150 (MQ=255) ggAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTaa < 1:3812098/150‑1 (MQ=255) gAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAAc > 2:4364898/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAAcc > 1:2753895/1‑150 (MQ=255) aTGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAAccc > 2:4390960/1‑150 (MQ=255) aTGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAAccc < 2:922693/150‑1 (MQ=255) tGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCa > 2:1905031/1‑150 (MQ=255) tGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCa > 2:4458961/1‑150 (MQ=255) tGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTAGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCa > 1:1619417/1‑150 (MQ=255) gCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCat < 2:3679653/150‑1 (MQ=255) tCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTAGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATg < 1:1020744/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATCTGTTTAACGGCCTAACCCCTATGCa > 2:2375836/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCa > 2:567032/1‑150 (MQ=255) gTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCAGTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCa > 2:5111273/1‑150 (MQ=255) ttCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCAc > 2:867277/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCTCCTTTATCGCTGGCATGGATATGTTTAACGGCCTAACCAATATGCAcc > 2:593712/1‑150 (MQ=255) ggCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGccc < 1:1641680/150‑1 (MQ=255) cGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTc < 1:3656897/150‑1 (MQ=255) cAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTc > 2:237792/1‑150 (MQ=255) cAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTc < 2:2942123/150‑1 (MQ=255) agagCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCg > 1:4720339/1‑150 (MQ=255) agCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGc > 1:2646987/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGccc < 1:2172015/150‑1 (MQ=255) ctgctgTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCg > 2:434541/1‑150 (MQ=255) tgctgTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGt < 1:1044331/150‑1 (MQ=255) tgctgTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGt > 2:1150714/1‑150 (MQ=255) gctgTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGtt < 1:532628/150‑1 (MQ=255) ctgTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTg > 2:1298771/1‑150 (MQ=255) ctgTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTg > 2:4769756/1‑150 (MQ=255) tgtgGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATAGGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTgg < 2:2600317/150‑1 (MQ=255) tgGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCACGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTc < 2:2554729/150‑1 (MQ=255) ggACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCg > 1:4183601/1‑150 (MQ=255) ggACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCAAATGCACCGCCCGGAGGTCCTCGGCCCGTTGGTCg > 2:4229868/1‑150 (MQ=255) aCCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCggg > 1:3910814/1‑150 (MQ=255) aCCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCggg < 2:5126896/150‑1 (MQ=255) ccTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGc > 1:432450/1‑150 (MQ=255) tctTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGAGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTg > 1:3605879/1‑150 (MQ=255) tttAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGt < 1:4899607/150‑1 (MQ=255) aaaTTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACt > 2:3564815/1‑150 (MQ=255) ttACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTgg > 1:1434617/1‑150 (MQ=255) tACTTAGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGc < 1:3102362/150‑1 (MQ=255) cTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGa > 1:3511022/1‑150 (MQ=255) ttGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATc < 1:3525203/150‑1 (MQ=255) tGAGGGATTCTTCATGGATATCAGCCTGTTGCAGGCTTTTGCGTTGGGCATTTTCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCt < 1:784470/150‑1 (MQ=255) tGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCt < 1:2121711/150‑1 (MQ=255) tGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCt < 1:2407588/150‑1 (MQ=255) tGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGGTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCt > 2:3429976/1‑150 (MQ=255) | ACTACGCCAATGGCAAACAACAAATCGCCAAAACGGTTTCTGTGGATGCGGGCGATATCGCAGCATTTAACGACCTGAAAACCGCTGGGGTGGAATGCTTCGTTCAGGGCGTCCCGACAGAGCCTGCTGTGGACCTCTTTAAATTACTTTGAGGGATTCATCATGGAAATCAGCCTGTTGCAGGCATTTGCGTTGGGCATTATCGCCTTTATCGCTGGCCTGGATATGTTTAACGGCCTAACCCATATGCACCGCCCGGTGGTCCTCGGCCCGTTGGTCGGGCTGGTACTTGGCGATCT > CP009273/3273898‑3274196 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |