Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,296,612 | G→T | 43.3% | A255A (GCG→GCT) | yhbV → | U32 peptidase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,296,612 | 0 | G | T | 43.3% | 351.8 / inf | 383 | A255A (GCG→GCT) | yhbV | U32 peptidase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (111/106); new base T (82/84); total (193/190) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 395 total aligned reads displayed.
GTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAACTACT > CP009273/3296463‑3296761 | gTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTcgcg < 2:1361034/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGAt > 1:4572976/1‑150 (MQ=255) gCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCAGTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTAt > 2:4406521/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATg < 2:1941753/150‑1 (MQ=255) cGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCg > 2:1454148/1‑150 (MQ=255) gCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGa > 2:4275611/1‑150 (MQ=255) aGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACg < 2:2153367/150‑1 (MQ=255) gAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGcc > 1:1133188/1‑150 (MQ=255) aaaCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCtt > 1:792792/1‑150 (MQ=255) aaaCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCACGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCtt < 1:3378863/150‑1 (MQ=255) aCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTcc > 2:2504048/1‑150 (MQ=255) aCCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTcc < 2:2870116/150‑1 (MQ=255) ccAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCcg < 1:1938478/150‑1 (MQ=255) caacaaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCcgc > 2:4556910/1‑150 (MQ=255) caacaaGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCcgc > 2:3232479/1‑150 (MQ=255) aaGTGTTTGTACTCACTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTa < 2:4028120/150‑1 (MQ=255) aGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTaa > 2:1592055/1‑150 (MQ=255) aGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTaa > 2:4153865/1‑150 (MQ=255) 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aCTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATgg < 1:5084420/150‑1 (MQ=255) tCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGgcg > 2:924025/1‑150 (MQ=255) aaTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCt < 2:4870059/150‑1 (MQ=255) aaTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCt < 2:272371/150‑1 (MQ=255) aTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTg > 1:2428204/1‑150 (MQ=255) aTGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTg < 2:4053800/150‑1 (MQ=255) tGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGc > 1:866694/1‑150 (MQ=255) ggCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGca < 2:3616948/150‑1 (MQ=255) ggCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGca < 2:4116083/150‑1 (MQ=255) cATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTCCTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacc > 2:3144069/1‑150 (MQ=255) cATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacc > 2:1190801/1‑150 (MQ=255) aTTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca < 2:2379126/150‑1 (MQ=255) aTTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGcacca < 1:1207060/150‑1 (MQ=255) aCCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCg < 1:2391353/150‑1 (MQ=255) tGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGa < 2:4202910/150‑1 (MQ=255) gCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAATATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACgg < 1:4251366/150‑1 (MQ=255) gCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACgg < 1:2582436/150‑1 (MQ=255) ggCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCg > 2:446224/1‑150 (MQ=255) tACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGAGGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTCCTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTCATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAAc > 1:130694/1‑150 (MQ=255) gTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGc < 1:2878443/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTaa > 2:4799427/1‑150 (MQ=255) ggTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGc > 1:662819/1‑150 (MQ=255) aCGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACt > 1:4080489/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTg > 1:2024131/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTgg < 2:3778637/150‑1 (MQ=255) 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gTACTGACACTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGtt > 1:2808245/1‑150 (MQ=255) cTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaac < 2:200573/150‑1 (MQ=255) gACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaacaa > 2:2598337/1‑150 (MQ=255) acacTTTCGCTATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaacaac < 2:3860090/150‑1 (MQ=255) acacTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTaacaac > 1:3872079/1‑150 (MQ=255) acTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACtt > 2:505665/1‑150 (MQ=255) ttCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTaa < 1:4007913/150‑1 (MQ=255) ttCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTaa > 1:2869077/1‑150 (MQ=255) tCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAac < 1:2245127/150‑1 (MQ=255) cgctATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAact < 2:1885443/150‑1 (MQ=255) cgcgATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAact > 2:1796409/1‑150 (MQ=255) cgcgATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAact < 1:1022133/150‑1 (MQ=255) | GTGCTGTCGCAGGAAAACCAACAAGTGTTTGTACTCAATGGCATTCAGACCATGAGCGGCTACGTTTACAACCTCGGTAACGAGCTGGCATCCATGCAGGGCCTGGTTGATGTGGTCCGCCTGTCACCGCAGGGTACTGACACTTTCGCGATGCTCGACGCCTTCCGCGCTAATGAAAATGGCGCTGCACCACTGCCGTTGACGGCGAACAGCGACTGTAACGGCTACTGGCGGCGGCTGGCAGGACTGGAGCTGCAAGCCTAAGTAAATAGCTCACTTTGTTAACAACTTTAACTACT > CP009273/3296463‑3296761 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |