Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,332,632 | G→T | 9.7% | L265I (CTT→ATT) | mlaF ← | ABC transporter maintaining OM lipid asymmetry, ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,332,632 | 0 | G | T | 9.7% | 1128.7 / 63.6 | 310 | L265I (CTT→ATT) | mlaF | ABC transporter maintaining OM lipid asymmetry, ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (136/143); new base T (15/15); total (151/159) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
GGCGCATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGATCCAGG > CP009273/3332483‑3332781 | ggcgCATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAg > 2:4144811/1‑150 (MQ=255) ggcgCATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAg > 2:3725105/1‑150 (MQ=255) ggcgCATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAg > 2:1500313/1‑150 (MQ=255) ggcgCATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAg > 2:1499822/1‑150 (MQ=255) gcgcATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGa < 2:3525889/150‑1 (MQ=255) cgcATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGAt > 1:3521483/1‑150 (MQ=255) gcATGTTTGCTAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATc > 1:3081026/1‑150 (MQ=255) gcATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATc < 2:4979146/150‑1 (MQ=255) gcATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATc < 2:2031072/150‑1 (MQ=255) aTGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAg < 2:3477226/150‑1 (MQ=255) aTGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAg < 2:1345461/150‑1 (MQ=255) gTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCg > 1:2302577/1‑150 (MQ=255) tGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGa > 1:3282990/1‑150 (MQ=255) cGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATa > 2:4083831/1‑150 (MQ=255) cGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAAAAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGGAAAAGATCAGCGTGATa > 1:130479/1‑150 (MQ=255) gAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATaa > 2:936037/1‑150 (MQ=255) aaTTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTTCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATc < 1:1701553/150‑1 (MQ=255) aaTTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATc < 1:3650489/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCg < 2:2858131/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCg < 1:808287/150‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGc > 2:2621698/1‑150 (MQ=255) tttGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAg > 1:1639664/1‑150 (MQ=255) tttGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAg < 1:3391902/150‑1 (MQ=255) ttGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAgg < 2:3224188/150‑1 (MQ=255) gCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGAt < 1:4144981/150‑1 (MQ=255) cGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAg < 2:2285835/150‑1 (MQ=255) gACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGc > 2:4522300/1‑150 (MQ=255) aGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGcggaa > 2:537511/1‑150 (MQ=255) aTTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGcggaacggaa > 1:5091890/1‑150 (MQ=255) ttGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCggaacggaac < 1:4859677/150‑1 (MQ=255) aaTAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAgg > 2:2955034/1‑150 (MQ=255) tAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGcc < 2:2545839/150‑1 (MQ=255) aaCATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGccc < 1:4595487/150‑1 (MQ=255) aCATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCg > 2:4112694/1‑150 (MQ=255) cATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTATTCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCACTGTTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGt > 1:784373/1‑150 (MQ=255) aTTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTc < 2:1940132/150‑1 (MQ=255) aTTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTc > 2:2090075/1‑150 (MQ=255) ttAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCAAGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCa < 2:2169035/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGc > 2:4593511/1‑150 (MQ=255) cccGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTa > 2:3527732/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTAt > 1:1977974/1‑150 (MQ=255) cccgAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCa < 1:1358084/150‑1 (MQ=255) ccgAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAg > 2:629974/1‑150 (MQ=255) ccgAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAg > 1:1848617/1‑150 (MQ=255) ccgAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGAATGAGTGGCTTAACTCACTGGTAAAAGATAAGAGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAg > 1:1788318/1‑150 (MQ=255) cgAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGa > 1:1090321/1‑150 (MQ=255) gAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGaa > 1:1385967/1‑150 (MQ=255) aCGTTCTCAGGGTTTTACTCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAAc < 2:3947019/150‑1 (MQ=255) aCGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAAc > 2:2421867/1‑150 (MQ=255) cGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACt < 2:781390/150‑1 (MQ=255) ttCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGa > 1:2197036/1‑150 (MQ=255) tctcAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGAc > 1:3028256/1‑150 (MQ=255) ctcAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACg < 1:4080530/150‑1 (MQ=255) ctcAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACg < 2:2722047/150‑1 (MQ=255) ctcAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACg < 2:125107/150‑1 (MQ=255) aGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTAc > 1:2528783/1‑150 (MQ=255) gggTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTAcg < 1:4977675/150‑1 (MQ=255) gggTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTAcg < 2:1134998/150‑1 (MQ=255) gTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTAcgcg < 1:4543596/150‑1 (MQ=255) gTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTAcgcg < 1:2672485/150‑1 (MQ=255) ttttAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGACCAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCCGAAACTGACGTAcgcgc > 1:1549063/1‑150 (MQ=255) tttAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTAcgcgcg > 2:2358803/1‑150 (MQ=255) cTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGa < 1:4373390/150‑1 (MQ=255) gTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGcc < 2:3561784/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTg < 2:2495242/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTg < 1:1451270/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTg > 1:2352415/1‑150 (MQ=255) ccGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTg < 1:2784445/150‑1 (MQ=255) gAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCa < 2:1985576/150‑1 (MQ=255) gCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAAc > 1:591824/1‑150 (MQ=255) gACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGc > 2:753242/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCt < 2:274420/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTg < 1:2924081/150‑1 (MQ=255) cAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAATATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTggg > 1:2035392/1‑150 (MQ=255) cAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTggg < 1:1722204/150‑1 (MQ=255) cAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTggg < 1:3708417/150‑1 (MQ=255) cAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTggg > 1:2826641/1‑150 (MQ=255) gcgcATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCa < 2:4721826/150‑1 (MQ=255) cgcATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCAc < 2:1706522/150‑1 (MQ=255) gcATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACt < 1:2988388/150‑1 (MQ=255) cATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTg < 1:3274291/150‑1 (MQ=255) tAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCCCTGCCAt > 2:4819317/1‑150 (MQ=255) gaaCAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCAt < 1:4035097/149‑1 (MQ=255) cAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAg > 1:3061575/1‑150 (MQ=255) aGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGc < 1:640989/150‑1 (MQ=255) aGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGc < 1:2643118/150‑1 (MQ=255) aTGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGAc > 2:1682158/1‑150 (MQ=255) tGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACa < 2:4886050/150‑1 (MQ=255) cTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAAtttttt < 1:1581903/150‑1 (MQ=255) cTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAAtttttt < 1:954767/150‑1 (MQ=255) aCTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTc < 2:4020191/150‑1 (MQ=255) tCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCCTGAGCGCCACTTTTTTTGTCCg > 2:4440822/1‑150 (MQ=255) cTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCa < 1:2623192/150‑1 (MQ=255) tAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGAt > 1:2283439/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGAt > 2:4230616/1‑150 (MQ=255) tAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAA‑TTTTTTGTCCGCCAGGATc < 1:2421867/150‑1 (MQ=255) aaaGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGATcc < 1:4681027/150‑1 (MQ=255) aaGATCAGCGTGATACTCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGATCCa < 2:649480/150‑1 (MQ=255) aaGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGATCCa > 1:3888018/1‑150 (MQ=255) aGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGATCCAg < 1:3182077/150‑1 (MQ=255) | GGCGCATGTTTGCGAAATTCCGGTTTGCCGACCAGCGCATTGAATAACATTAACCCGGCCCGCCCGAACGTTCTCAGGGTTTTAATCCCTTTATGTCCGAGCGACGCCAGCGCATTTAACAGCATGAGTGGCTTAACTCCCTGGTAAAAGATCAGCGTGATAATCGCCGGCAGGATAGCGGAACGGAACAGGCCCGTCAGCTATCCCGTCCAGAAACTGACGTACGCGCGGATCAGGATTCGCCTGCAACGCCTGGGCACTGCCATGAGCGACAATTTTTTTGTCCGCCAGGATCCAGG > CP009273/3332483‑3332781 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |