| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 314,027 | C→T | 12.7% | E2K (GAA→AAA) | rclC ← | reactive chlorine species (RCS) stress resistance inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 314,027 | 0 | C | T | 12.7% | 939.2 / 105.7 | 299 | E2K (GAA→AAA) | rclC | reactive chlorine species (RCS) stress resistance inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (129/132); new base T (21/17); total (150/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
TGGACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTGA > CP009273/313878‑314176 | gACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCa < 2:496750/150‑1 (MQ=255) gACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCa > 2:3354724/1‑150 (MQ=255) aCTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACACTTGCAATACTCAGCCGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCAt < 1:1082012/150‑1 (MQ=255) ttGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGa > 2:923239/1‑150 (MQ=255) ttGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGa > 2:4861002/1‑150 (MQ=255) tGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGaa > 2:1866288/1‑150 (MQ=255) gCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAAc < 1:2569895/150‑1 (MQ=255) cgacgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACa < 2:3953879/150‑1 (MQ=255) cgacgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACa > 1:788355/1‑150 (MQ=255) cgaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATcc > 2:4033167/1‑150 (MQ=255) gaATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCt > 1:1797135/1‑150 (MQ=255) gtgtACTGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattt < 2:2798568/150‑1 (MQ=255) gtgtAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCttattt > 2:1674220/1‑150 (MQ=255) tGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATAc < 2:3604964/150‑1 (MQ=255) tCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATActg > 1:4385724/1‑150 (MQ=255) cTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGtt < 1:3064277/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCg < 1:1423458/150‑1 (MQ=255) tAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCgg < 1:3237186/150‑1 (MQ=255) aGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGtt > 2:3827867/1‑150 (MQ=255) ggACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGa > 1:4214122/1‑150 (MQ=255) aCAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAACACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAat < 2:2775512/150‑1 (MQ=255) aCAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAat > 2:2961253/1‑150 (MQ=255) cAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAatt < 1:4045657/150‑1 (MQ=255) aaaCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAatta > 2:301429/1‑150 (MQ=255) aaCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAattat < 1:3016529/150‑1 (MQ=255) aaCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAAGACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAattat < 1:2278549/150‑1 (MQ=255) aCTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAattatt < 1:2721044/150‑1 (MQ=255) tttAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATtattat > 2:1267144/1‑150 (MQ=255) tttAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATtattat > 1:4557871/1‑150 (MQ=255) taataaCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCa < 2:1964759/150‑1 (MQ=255) aaCCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTc < 2:162000/150‑1 (MQ=255) aaTCCAAATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATc < 1:4520193/150‑1 (MQ=255) aTCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCg > 1:3891619/1‑150 (MQ=255) tCCACATAAACACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGa < 1:1081591/150‑1 (MQ=255) tCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGa < 2:5121858/150‑1 (MQ=255) cacaTAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGAtg < 2:1116728/150‑1 (MQ=255) cacaTAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGAtg > 1:3412928/1‑150 (MQ=255) acaTAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGAtgt > 1:4188279/1‑150 (MQ=255) aaaCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACttt > 1:3098133/1‑150 (MQ=255) aCAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTcc > 1:1216650/1‑150 (MQ=255) aaTTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAg > 2:4332191/1‑150 (MQ=255) aaTTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAg > 2:3408019/1‑150 (MQ=255) gCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATg > 1:4093101/1‑150 (MQ=255) gCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATg > 1:649767/1‑150 (MQ=255) cAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCT‑CCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa < 1:3331987/150‑1 (MQ=255) aagaCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa < 2:2627380/147‑1 (MQ=255) aaTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa > 2:368958/1‑150 (MQ=255) aaTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGaa < 2:2603114/150‑1 (MQ=255) agaCTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAg < 2:2049925/148‑1 (MQ=255) aTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAg < 1:3633368/150‑1 (MQ=255) aTACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAg > 2:2811962/1‑150 (MQ=255) tCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAtt > 1:4242551/1‑150 (MQ=255) tCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAtt > 2:4554817/1‑150 (MQ=255) tCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAtt > 1:771088/1‑150 (MQ=255) tCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCAtt > 1:906461/1‑150 (MQ=255) tCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTAGTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGCCTTTCCAGGATGAAGCAtt > 2:4492264/1‑150 (MQ=255) cAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATta > 2:4744860/1‑150 (MQ=255) cAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATta < 1:4027624/150‑1 (MQ=255) aGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATtat > 1:3981250/1‑150 (MQ=255) aGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATtat > 2:750814/1‑150 (MQ=255) gACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATtata > 1:1651725/1‑150 (MQ=255) cGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAtt < 1:2519571/150‑1 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt > 2:3048912/1‑150 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt < 1:1144934/150‑1 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt > 2:4289877/1‑150 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt > 2:1598433/1‑150 (MQ=255) gAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAttt > 1:546648/1‑150 (MQ=255) aaTCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATAtttt < 1:2297643/150‑1 (MQ=255) aTCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTc > 1:2972852/1‑150 (MQ=255) tCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCt > 2:2229879/1‑150 (MQ=255) cAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTg < 1:2406059/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTgg < 1:4693306/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTgg < 1:2774718/150‑1 (MQ=255) tGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCt < 1:4892176/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCtata > 2:2526769/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCtata > 2:1790138/1‑150 (MQ=255) aTTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCaa > 2:2864616/1‑150 (MQ=255) ttttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAAt < 1:806234/150‑1 (MQ=255) ttttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAAt < 2:417666/150‑1 (MQ=255) tttATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATg < 1:2529178/150‑1 (MQ=255) tATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGt < 1:1678771/150‑1 (MQ=255) aTCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTa < 2:623995/150‑1 (MQ=255) tctcCCCGACGTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGACTTATTATCACTTCGCATCGAGGTGACTTTCCAGGAGGAAGCATTATATTTTCTGGCTCTAGCAGCAATgggct > 2:3135072/1‑147 (MQ=255) ctcCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAtc > 1:2066364/1‑150 (MQ=255) tcCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAtcc > 1:4586785/1‑150 (MQ=255) cccGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTAtcctc > 2:1256555/1‑150 (MQ=255) cGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCa > 1:1909303/1‑150 (MQ=255) tAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACt > 2:41450/1‑150 (MQ=255) tAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACt < 2:3232631/150‑1 (MQ=255) aaCAGGTGCAGGTATTTTTTCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTg > 1:1570278/1‑150 (MQ=255) aaCAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTg > 1:2615818/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCg > 1:5117820/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCg < 2:4450680/150‑1 (MQ=255) aGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCg > 1:3991821/1‑150 (MQ=255) ggTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGc > 1:3837888/1‑150 (MQ=255) ggTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGc < 2:2135842/150‑1 (MQ=255) gTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCt < 1:368958/150‑1 (MQ=255) tATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTg < 1:3289248/150‑1 (MQ=255) tttCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATAc > 1:1317699/1‑150 (MQ=255) tttCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATAc > 1:1239762/1‑150 (MQ=255) | TGGACTGTTTGCGACGAATGGTGTAATGCTGTCTGCCTCGTAAGGGACAAACTTTAATAACCCAATCCACATAAAAACAATTGCAATACTCAGACGAATCAATGTCAGGCCAATTTTATCTCCCCGACTTAACAGGTGCAGGTATTTTTCCATTGTGAACATCCTTATTTATACAATACTGCTGTTGCGGTTGAATTATTATCAATTCGCATCGATGTGACTTTCCAGGATGAAGCATTATATTTTCTGGCTATATCAGCAATGGTATCCTCCAGAACTGTCGGTGATGCTGATACTGA > CP009273/313878‑314176 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |