Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,415,551 | C→A | 7.4% | P290T (CCT→ACT) | yhdY → | putative amino‑acid transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,415,551 | 0 | C | A | 7.4% | 1173.7 / 31.2 | 342 | P290T (CCT→ACT) | yhdY | putative amino‑acid transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (133/174); new base A (25/9); total (159/183) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.47e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 348 total aligned reads displayed.
TGTTTCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGTATGTCGACGGAAGGGTATGTTTTCGCCGCG > CP009273/3415402‑3415700 | tGTTTCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTc > 2:4622556/1‑150 (MQ=255) gTTTCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTcc < 1:3889011/150‑1 (MQ=255) ttCAGTCAGCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTg < 1:3759931/150‑1 (MQ=255) agtcagCATATGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGc < 1:3430264/150‑1 (MQ=255) tatGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAAt < 2:1335672/150‑1 (MQ=255) atGTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATa > 1:628340/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATAcc > 1:4234298/1‑150 (MQ=255) gTTGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATAcc < 2:3988911/150‑1 (MQ=255) ttGCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACca < 2:3058929/150‑1 (MQ=255) gCGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatc < 1:4835228/150‑1 (MQ=255) cGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatca > 1:808655/1‑150 (MQ=255) cGGAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACcatca < 1:3935536/150‑1 (MQ=255) ggAAGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTATGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATAAcatcaa > 1:4349664/1‑149 (MQ=255) aaGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCg < 2:772835/150‑1 (MQ=255) aaGTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACACAGGGGCTGGTTATTCTGCCCCAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAAAACCATCATCg > 2:2614083/1‑150 (MQ=255) gTCGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCa < 2:1559939/150‑1 (MQ=255) cGTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCAct > 2:5091943/1‑150 (MQ=255) gTGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCActc > 1:4408490/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCActct > 2:4777961/1‑150 (MQ=255) tGCGAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCGGGGCTGGTAAATACCATCATCGCActct > 2:557044/1‑150 (MQ=255) gAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCa > 2:3944655/1‑150 (MQ=255) gAGGTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCAACATCGCACTCGTCa > 1:3539314/1‑150 (MQ=255) gTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAg < 2:2571581/150‑1 (MQ=255) gTGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACTGGAAAACACAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCAACATCGCACTCTTCAAAg > 1:1445795/1‑150 (MQ=255) tGGATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAAATCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTTAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCAACATCGCACTCTTCAAAGa > 1:1862366/1‑150 (MQ=255) ggATTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGGTATTCTGCCACAGGCGGTGAAGCTGGTAAATCCTGGGCGGGGAAATACCAACAACGCACACGTCAAAGAt > 1:508367/1‑150 (MQ=255) aTTACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATAc < 2:4346074/150‑1 (MQ=255) tACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCa < 1:1437334/150‑1 (MQ=255) tACAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCa > 2:3641343/1‑150 (MQ=255) aCAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAg < 2:1075654/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGc > 2:3656488/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGcc > 2:4868850/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCCTAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTg > 2:1790928/1‑150 (MQ=255) 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tAAAGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGGTGGGTTACAGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCGGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACGCTTCAAAGATACCCGCCGGGGGATCAt > 1:4007106/1‑150 (MQ=255) aaaGGTCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCAtt > 2:3752516/1‑150 (MQ=255) aaGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTa < 1:2438616/150‑1 (MQ=255) aGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTAt > 1:4719102/1‑150 (MQ=255) aGGGCAATATGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTAt < 1:4115203/150‑1 (MQ=255) atatGCAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTGACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGgtt < 2:3299469/150‑1 (MQ=255) tatGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCCTTATCGGgttg > 2:2984711/1‑150 (MQ=255) tatGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGgttg < 1:895476/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGgttgtt < 2:2246312/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTc > 2:1001511/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAAATAAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATAACATCATCGCACTCTTAAAAGATAACAGCCTGGTGATCATTATCGGgttgtta > 2:3540339/1‑149 (MQ=255) aaGCGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCg > 2:318181/1‑150 (MQ=255) cGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATc < 2:144961/150‑1 (MQ=255) cGGCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATc > 2:4107652/1‑150 (MQ=255) ggCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCt < 2:2658154/150‑1 (MQ=255) ggCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCAGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACACTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCt > 2:2456583/1‑150 (MQ=255) ggCAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCt < 1:3664272/150‑1 (MQ=255) cAGAGTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCttt < 2:4693167/150‑1 (MQ=255) agTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCa < 2:15888/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGGCGTTGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAg > 2:1917615/1‑150 (MQ=255) 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tGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTcagc > 1:2648493/1‑150 (MQ=255) tGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTc < 1:917060/147‑1 (MQ=255) tGGGTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTACTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTc > 2:917060/1‑147 (MQ=255) gggTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTcagca < 1:457186/150‑1 (MQ=255) ggTTACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTcagcag > 1:3033698/1‑150 (MQ=255) ttACTGGAAAACTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGc < 2:2133116/150‑1 (MQ=255) aaaaCTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGtt < 2:2807430/150‑1 (MQ=255) aaCTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGa > 1:4065937/1‑150 (MQ=255) aCTCAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGAt < 1:329342/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCTGGTTATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATccc < 1:754995/150‑1 (MQ=255) 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tATTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTggg < 1:1233428/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAGGCGTTGACGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGt < 2:808655/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGt < 2:4971057/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGt < 2:2858132/150‑1 (MQ=255) aTTCTGCCACAGGCGTTGAAGCTGGTAATTCCTGGGCTGGTAAATACCATCATCGCACTCTTCAAAGATACCAGCCTGGTGATCATTATCGGGTTGTTCGATCTTTTCAGTAGCGTTCAGCAGGCAACCGTTGATCCCGCCTGGTTGGGt < 1:2103614/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |