| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,525,950 | 0 | C | T | 26.4% | 654.4 / 279.2 | 330 | intergenic (‑152/‑227) | yhgE/pck | DUF4153 family putative inner membrane protein/phosphoenolpyruvate carboxykinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (121/122); new base T (44/43); total (165/165) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |