Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 3,643,207 | C→A | 12.4% | L305I (CTT→ATT) | arsB → | arsenite/antimonite transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,643,207 | 0 | C | A | 12.4% | 1148.1 / 96.7 | 341 | L305I (CTT→ATT) | arsB | arsenite/antimonite transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (147/151); new base A (25/18); total (172/169) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.29e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
CGCGCTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATC > CP009273/3643059‑3643355 | cgcgcTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCt < 1:4004896/150‑1 (MQ=255) gcgcTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCtt < 1:737694/150‑1 (MQ=255) cgcTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCttt < 2:3560201/150‑1 (MQ=255) cgcTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCttt < 1:1708166/150‑1 (MQ=255) gcTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTc < 2:42434/150‑1 (MQ=255) cTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCt < 2:761586/150‑1 (MQ=255) tattatTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCg > 1:3801155/1‑150 (MQ=255) attattTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGt > 2:2292151/1‑150 (MQ=255) attTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACt > 1:2539815/1‑150 (MQ=255) tttGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTc < 2:3146085/150‑1 (MQ=255) tttGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTc > 2:685714/1‑150 (MQ=255) ttGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCa < 2:2053161/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACg < 2:274015/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACg < 1:2961618/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACg < 2:4378914/150‑1 (MQ=255) cgtcgCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGt > 1:1188517/1‑150 (MQ=255) cgCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCt > 1:1701283/1‑150 (MQ=255) gCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTg > 2:933724/1‑150 (MQ=255) tAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGc > 1:238604/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCgg > 1:1671474/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCgg > 2:2242809/1‑150 (MQ=255) aaCGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCgg < 1:998731/150‑1 (MQ=255) ggTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAAc > 1:1347096/1‑150 (MQ=255) tCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACgg > 1:3940134/1‑150 (MQ=255) aTGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGcc > 2:3328084/1‑150 (MQ=255) aTGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGcc > 2:2917662/1‑150 (MQ=255) tGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTTGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCt < 2:2925647/150‑1 (MQ=255) cGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCtgt > 1:4613958/1‑150 (MQ=255) gATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCtgtg > 2:3385969/1‑150 (MQ=255) aTTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTgg < 1:1963375/150‑1 (MQ=255) aTTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTgg < 2:1778355/150‑1 (MQ=255) tAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGc > 2:3449940/1‑150 (MQ=255) aaTACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGcc < 1:4575660/150‑1 (MQ=255) aTACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCcg < 1:1038337/150‑1 (MQ=255) gggTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGAc < 1:2662109/150‑1 (MQ=255) ggTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGTCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACg > 1:436850/1‑150 (MQ=255) gTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGc < 1:2681954/150‑1 (MQ=255) aaGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCg < 2:2482871/150‑1 (MQ=255) aaGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCg > 1:2006189/1‑150 (MQ=255) aGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCgg < 1:339970/150‑1 (MQ=255) aGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGAGAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCgg > 2:4172954/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCg > 2:859532/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCg > 1:3483685/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGa > 2:1882637/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGa > 1:4401430/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGAt < 1:1473557/150‑1 (MQ=255) cccccTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCa > 1:5092505/1‑150 (MQ=255) ccccTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCAc > 2:1652662/1‑150 (MQ=255) cccTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCAcc < 2:4852852/150‑1 (MQ=255) cccTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCAcc < 2:246570/150‑1 (MQ=255) cccTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCAcc < 2:2843023/150‑1 (MQ=255) ggCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCt > 1:182811/1‑150 (MQ=255) ggCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCt < 1:2511244/150‑1 (MQ=255) cAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTc > 2:3843377/1‑150 (MQ=255) aGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTcc > 2:1804038/1‑150 (MQ=255) aGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTcc > 2:1942875/1‑150 (MQ=255) gATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCct < 2:1327098/150‑1 (MQ=255) ttGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCctct < 2:1595558/150‑1 (MQ=255) cATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCtcttc > 1:3457413/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCtcttct < 1:2902429/150‑1 (MQ=255) aTCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCtcttct > 1:1446524/1‑150 (MQ=255) tcttctCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTctacta > 2:572289/1‑150 (MQ=255) cttctCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtat < 2:2001538/150‑1 (MQ=255) cttctCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtat > 2:49722/1‑150 (MQ=255) ttctCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtatt < 1:2711145/150‑1 (MQ=255) ttctCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtatt < 1:4685054/150‑1 (MQ=255) tctcGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtatta > 1:2202229/1‑150 (MQ=255) ctcgctcgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCtattat < 2:4622474/150‑1 (MQ=255) tcgctcgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATg > 2:2643246/1‑150 (MQ=255) cgctcgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGTATTAACTTAATTTCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGa < 1:43123/150‑1 (MQ=255) cgctcgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGa > 1:1632938/1‑150 (MQ=255) cgGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACaa > 1:175557/1‑150 (MQ=255) cATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAatat > 1:948602/1‑150 (MQ=255) tGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGc > 1:824997/1‑150 (MQ=255) tATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCg > 1:3730064/1‑150 (MQ=255) aTCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGa < 2:2398354/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGAc < 2:488336/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGAc < 2:3801291/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGAc < 1:2132278/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGAc < 2:4812500/150‑1 (MQ=255) tggtggTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACgg < 2:3117016/150‑1 (MQ=255) ggtggtTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGt < 2:1185966/150‑1 (MQ=255) gtggtTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGTATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTa < 1:3924845/150‑1 (MQ=255) tggtTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTAc > 1:4475664/1‑150 (MQ=255) tggtTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTAc > 1:3322348/1‑150 (MQ=255) ggtTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACt > 1:4839814/1‑150 (MQ=255) ttATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGt > 2:1928447/1‑150 (MQ=255) ttATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGt < 2:3933465/150‑1 (MQ=255) tATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGtt < 2:1460884/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTgg < 1:3622034/150‑1 (MQ=255) gcgcAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGtt < 1:244536/150‑1 (MQ=255) gcAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGt > 2:3342202/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCa > 1:1118336/1‑150 (MQ=255) tGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCAt > 1:315221/1‑150 (MQ=255) gCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCAtt < 1:1029492/150‑1 (MQ=255) ggATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCAATTGAt > 2:1551365/1‑150 (MQ=255) aTTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATgg > 2:5020689/1‑150 (MQ=255) ggAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCAc > 2:4020342/1‑150 (MQ=255) ggAATATATTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCAc > 1:1910944/1‑150 (MQ=255) tatCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCa < 2:4826666/150‑1 (MQ=255) | CGCGCTGATATTATTTGTCGTCGCTAAACGCGGTCATGCGATTAATACGGGTAAAGTCCTGCGCGGTGCCCCCTGGCAGATTGTCATCTTCTCGCTCGGCATGTATCTGGTGGTTTATGGCCTGCGCAATGCCGGATTAACGGAATATCTTTCTGGCGTACTCAACGTGCTGGCGGATAACGGCCTGTGGGCCGCGACGCTCGGCACCGGATTCCTCACCGCCTTCCTCTCTTCTATTATGAACAATATGCCGACGGTACTGGTTGGCGCGTTGTCCATTGATGGCAGCACGGCATC > CP009273/3643059‑3643355 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |